More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3858 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3858  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 		 209 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.254816  normal  1 
 
 
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NC_010678  Rpic_4935  heat shock protein DnaJ domain protein  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.124962 
 
 
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NC_007348  Reut_B4346  heat shock protein DnaJ, N-terminal  70.92 
 
 		 192 aa  241  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_1209  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  52.8 
 
 		 215 aa  198  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.453241 
 
 
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NC_010676  Bphyt_5705  heat shock protein DnaJ domain protein  62.58 
 
 		 225 aa  178  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635582  normal  0.873603 
 
 
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NC_007952  Bxe_B1015  putative DnaJ-like protein  47.01 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.232085  normal  0.105814 
 
 
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NC_008391  Bamb_5251  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.48 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.204163  normal  0.506676 
 
 
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NC_010552  BamMC406_3418  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  49.76 
 
 		 197 aa  154  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_1208  heat shock protein DnaJ domain protein  56.92 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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BN001307  ANIA_02238  DnaJ domain protein Psi, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07340)  44.59 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.542195  normal  0.0811515 
 
 
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NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  57.14 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_0971  chaperone protein DnaJ  56.06 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.300897 
 
 
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BN001308  ANIA_00892  DnaJ domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G15460)  54.84 
 
 		 837 aa  75.9  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.679022 
 
 
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NC_010577  XfasM23_1454  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 		 368 aa  75.9  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.142529  n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_2510  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 376 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.318751  normal  1 
 
 
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NC_010513  Xfasm12_1511  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 		 368 aa  75.5  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.577618  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  57.14 
 
 		 378 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0958  chaperone protein DnaJ  57.14 
 
 		 377 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_0996  chaperone protein DnaJ  57.14 
 
 		 377 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.406882 
 
 
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NC_008577  Shewana3_0960  chaperone protein DnaJ  57.14 
 
 		 377 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0112522  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  57.14 
 
 		 378 aa  75.1  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  57.14 
 
 		 378 aa  75.1  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  57.58 
 
 		 385 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_2843  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 376 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0744929  normal  0.0660711 
 
 
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NC_011071  Smal_1601  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 		 376 aa  74.7  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.095683  normal  1 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  52.05 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
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NC_013946  Mrub_0739  chaperone protein DnaJ  53.03 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A1438  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_0970  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 376 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103271  n/a   
 
 
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NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  52.05 
 
 		 335 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 		 375 aa  74.3  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_1043  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0054277  decreased coverage  0.0000000510426 
 
 
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CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  30.69 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_0582  chaperone protein DnaJ  57.14 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.162907  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
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NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  30.69 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_3536  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_01186  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12513  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_3318  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00186939  n/a   
 
 
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NC_007954  Sden_1183  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 		 377 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000246856  n/a   
 
 
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NC_007984  BCI_0553  chaperone protein DnaJ  57.14 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
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NC_013926  Aboo_1350  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009068  PICST_74586  DnaJ-like protein  47.3 
 
 		 460 aa  73.6  0.000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.869575  normal  0.702487 
 
 
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NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  30.69 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  30.69 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  30.69 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  30.69 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  30.69 
 
 		 376 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 		 395 aa  72.8  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal  1 
 
 
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NC_010085  Nmar_0097  chaperone protein DnaJ  52.38 
 
 		 361 aa  72.4  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00841674 
 
 
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NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  51.95 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077022 
 
 
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NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 377 aa  72.4  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  50.79 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2970  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 376 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  50.79 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_0738  chaperone protein DnaJ  52.38 
 
 		 379 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0425034  normal  0.897985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3960  chaperone protein DnaJ  52.38 
 
 		 380 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715144 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 		 378 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1972  chaperone protein DnaJ  59.68 
 
 		 374 aa  72  0.000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  52.05 
 
 		 324 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  54.79 
 
 		 311 aa  72  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  54.84 
 
 		 396 aa  72  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002620  TC0619  chaperone protein DnaJ  54.84 
 
 		 392 aa  71.6  0.000000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1492  chaperone protein DnaJ  50.79 
 
 		 365 aa  72  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0235261  n/a   
 
 
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NC_006670  CNA03090  conserved hypothetical protein  48.65 
 
 		 490 aa  71.6  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006682  CNM01120  chaperone regulator, putative  43.48 
 
 		 361 aa  71.6  0.000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1437  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 		 379 aa  71.6  0.000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0109  heat shock protein DnaJ domain protein  57.81 
 
 		 297 aa  71.6  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.200595  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  30.2 
 
 		 376 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  52.38 
 
 		 379 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  53.73 
 
 		 333 aa  71.2  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  30.2 
 
 		 376 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1899  chaperone protein DnaJ  57.14 
 
 		 383 aa  71.2  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.61643  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0461  chaperone protein DnaJ  56.45 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1550  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  54.84 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85654  yeast dnaJ homolog (nuclear envelope protein) heat shock protein  50.77 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.351399  normal  0.0803186 
 
 
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NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  52.38 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  45.68 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
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NC_013385  Adeg_0608  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008261  CPF_2289  chaperone protein DnaJ  52.38 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008262  CPR_2004  chaperone protein DnaJ  52.38 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  56.25 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009714  CHAB381_1148  chaperone protein DnaJ  51.52 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.697031  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  52.38 
 
 		 378 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
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NC_008578  Acel_0784  chaperone protein DnaJ  58.06 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0590762 
 
 
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NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  42.86 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  55.56 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.85963 
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  52.11 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0101299 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
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NC_010644  Emin_1299  chaperone protein DnaJ  52.38 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  52.24 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
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NC_010581  Bind_0129  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
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NC_009636  Smed_3390  chaperone protein DnaJ  53.97 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.44272  normal  1 
 
 
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NC_008599  CFF8240_0765  co-chaperone protein DnaJ  53.85 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000175229  n/a   
 
 
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