86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1689 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1689  type VI secretion system lysozyme-related protein  100 
 
 		 173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3470  hypothetical protein  59.52 
 
 		 185 aa  216  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  normal  0.684408 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6118  type VI secretion system lysozyme-related protein  60.24 
 
 		 183 aa  214  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0590599  normal  0.324873 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0976  hypothetical protein  57.8 
 
 		 190 aa  207  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3904  type VI secretion system lysozyme-related protein  58.48 
 
 		 188 aa  206  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.705999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0945  type VI secretion system lysozyme-related protein  59.01 
 
 		 178 aa  205  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1699  hypothetical protein  57.83 
 
 		 193 aa  204  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0247  hypothetical protein  57.83 
 
 		 193 aa  204  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1203  hypothetical protein  57.83 
 
 		 193 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1905  hypothetical protein  57.83 
 
 		 193 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.182169  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0916  hypothetical protein  57.83 
 
 		 193 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.677867  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2178  hypothetical protein  57.83 
 
 		 193 aa  203  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0338  hypothetical protein  57.23 
 
 		 193 aa  201  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4432  hypothetical protein  55.9 
 
 		 176 aa  187  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0307  type VI secretion system lysozyme-related protein  50.64 
 
 		 164 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0294  type VI secretion system lysozyme-related protein  50 
 
 		 164 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.214716 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0292  hypothetical protein  50 
 
 		 164 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.871177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0299  type VI secretion system lysozyme-related protein  50 
 
 		 164 aa  158  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.828471  normal  0.298801 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3011  type VI secretion system lysozyme-related protein  46.67 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0617913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6690  type VI secretion system lysozyme-related protein  46.91 
 
 		 173 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0137  hypothetical protein  46.3 
 
 		 172 aa  132  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.410126  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0151  hypothetical protein  46.3 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1622  hypothetical protein  46.3 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0173  hypothetical protein  46.3 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1585  hypothetical protein  40.61 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22173  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3858  type VI secretion system lysozyme-related protein  38.75 
 
 		 184 aa  118  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.229758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3010  GPW/gp25 family protein  34.81 
 
 		 191 aa  117  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.50496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2452  type VI secretion system lysozyme-related protein  33.73 
 
 		 191 aa  117  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0480301  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1479  hypothetical protein  40 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0197  type VI secretion system lysozyme-related protein  39.1 
 
 		 175 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0406  hypothetical protein  40.62 
 
 		 182 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2832  hypothetical protein  40.62 
 
 		 178 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1786  hypothetical protein  40.62 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1197  hypothetical protein  40.62 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1603  hypothetical protein  40.62 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2957  hypothetical protein  40.62 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0456  hypothetical protein  40.62 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0526  type VI secretion system lysozyme-related protein  34.84 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0261  hypothetical protein  40 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1930  hypothetical protein  35.67 
 
 		 159 aa  102  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.180626  normal  0.25956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1490  type VI secretion system lysozyme-related protein  35.67 
 
 		 159 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.237539  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1378  hypothetical protein  35.67 
 
 		 159 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26640  hypothetical protein  39.74 
 
 		 180 aa  100  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.54439  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4087  type VI secretion system lysozyme-related protein  32.92 
 
 		 184 aa  98.6  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000692593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2328  GPW/gp25 family protein  36.77 
 
 		 170 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570455  normal  0.0349509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01060  hypothetical protein  38.06 
 
 		 169 aa  94  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0159  hypothetical protein  38.06 
 
 		 169 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00262  hypothetical protein  34.39 
 
 		 167 aa  89  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.885463  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1533  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  67.4  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3562  type VI secretion system lysozyme-related protein  25.66 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3433  hypothetical protein  25.66 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.545337  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0760  hypothetical protein  25.66 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.168942  normal  0.059645 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0470  hypothetical protein  30.28 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000139842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0448  type VI secretion system lysozyme-related protein  30.28 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.42159  normal  0.655562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0384  hypothetical protein  28.87 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.576989  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0405  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.58 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00895356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3562  hypothetical protein  30.28 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.132433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2636  hypothetical protein  30.28 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0057  hypothetical protein  30.99 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3641  hypothetical protein  30.99 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0866939  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3632  hypothetical protein  30.99 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3143  hypothetical protein  30.99 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2927  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.58 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.132533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1710  hypothetical protein  30.99 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3657  hypothetical protein  30.99 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403377  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2961  hypothetical protein  30.99 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000024  uncharacterized protein ImpF  33.33 
 
 		 154 aa  48.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.472951  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2174  hypothetical protein  31.69 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000567459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3039  type VI secretion system lysozyme-related protein  29.11 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4916  type VI secretion system lysozyme-related protein  28.87 
 
 		 159 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00677472  decreased coverage  0.00161069 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3480  hypothetical protein  27.14 
 
 		 235 aa  44.3  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426871  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3124  GPW/gp25 family protein  27.14 
 
 		 235 aa  44.3  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0142629  normal  0.0780049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2446  hypothetical protein  29.79 
 
 		 248 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0240156  normal  0.711628 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5981  type VI secretion system lysozyme-related protein  36 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01962  hypothetical protein  30.56 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0416888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2363  type VI secretion system lysozyme-related protein  26.8 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0568076 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02048  hypothetical protein  27.78 
 
 		 162 aa  43.5  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103916  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2270  hypothetical protein  27.16 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3409  hypothetical protein  30.61 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2077  hypothetical protein  29.55 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0746  hypothetical protein  29.55 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0792  hypothetical protein  29.55 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0703  hypothetical protein  29.55 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1041  hypothetical protein  29.55 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0441  hypothetical protein  29.55 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2015  hypothetical protein  29.55 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>