24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3124 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  306  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  80.65 
 
 		 152 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  78.71 
 
 		 152 aa  228  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1811  hypothetical protein  35.29 
 
 		 218 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  36.26 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  37.1 
 
 		 241 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  38.39 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  36.36 
 
 		 280 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  35 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  45.63 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  34.23 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  44.09 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  41.67 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  45.16 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  33.11 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1368  hypothetical protein  42.34 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3326  hypothetical protein  35.1 
 
 		 211 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  34.27 
 
 		 199 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  30.86 
 
 		 185 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  36 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  34.38 
 
 		 210 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  26.53 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  33.96 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  28.37 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>