28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3095 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3095  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  100 
 
 		 310 aa  637    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0691949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0854  hypothetical protein  74.12 
 
 		 333 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0961  hypothetical protein  74.19 
 
 		 333 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3401  hypothetical protein  54.36 
 
 		 335 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2423  hypothetical protein  54.24 
 
 		 339 aa  322  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2192  hypothetical protein  54.82 
 
 		 372 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4787  hypothetical protein  45.09 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3416  hypothetical protein  44.06 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.132342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0128  hypothetical protein  44.06 
 
 		 300 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4769  hypothetical protein  41.28 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.275018  normal  0.511697 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0970  hypothetical protein  33.72 
 
 		 299 aa  165  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.152926  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0399  hypothetical protein  34.05 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1235  hypothetical protein  29.19 
 
 		 330 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1125  hypothetical protein  29.06 
 
 		 330 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6411  hypothetical protein  27.14 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4734  hypothetical protein  28.18 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0919  hypothetical protein  25.32 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000244259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0955  hypothetical protein  25.32 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000014544  normal  0.349997 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0920  hypothetical protein  25.32 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000510544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1798  hypothetical protein  25.09 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000750515  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1848  conserved hypothetical secreted protein  21.28 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.51214  hitchhiker  0.00000000124644 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5379  hypothetical protein  21.28 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0361  hypothetical protein  23.46 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0904  hypothetical protein  23.32 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000046277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3459  hypothetical protein  23.32 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000354114  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2655  hypothetical protein  23.91 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000824644  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0609  putative lipoprotein  22.56 
 
 		 305 aa  50.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.581249 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0362  conserved hypothetical secreted protein  22.05 
 
 		 278 aa  46.6  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.807375  normal  0.507937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>