More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1050 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_1050  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 
517 aa  1026    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0043  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.3 
 
 
530 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.112939 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2779  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.65 
 
 
504 aa  624  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.470369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19740  ATP synthase F1, alpha subunit  61.39 
 
 
513 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5553  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.14 
 
 
522 aa  585  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175535  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0426  F0F1 ATP synthase subunit alpha  61.55 
 
 
556 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259702  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1885  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.12 
 
 
510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0879266  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1122  ATP synthase F1, alpha subunit  57.81 
 
 
525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0130  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.26 
 
 
670 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0154  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.26 
 
 
670 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325143  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  62.26 
 
 
670 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1048  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.87 
 
 
664 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2787  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.87 
 
 
670 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2645  F0F1 ATP synthase subunit alpha  64.87 
 
 
666 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.727067  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3935  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit  58.02 
 
 
497 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.455536  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4103  ATP synthase F1, alpha subunit  58.02 
 
 
497 aa  498  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0134913  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  49.16 
 
 
541 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.64 
 
 
505 aa  475  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  47.42 
 
 
502 aa  474  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 
502 aa  474  1e-132  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  49.25 
 
 
508 aa  472  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  50.63 
 
 
508 aa  474  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0513  ATP synthase F1, alpha subunit  48.05 
 
 
501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2164  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.5 
 
 
502 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.82 
 
 
505 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0201  ATP synthase F1, alpha subunit  49.89 
 
 
501 aa  468  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.406681  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0336  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.36 
 
 
505 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.120732  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2454  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.5 
 
 
502 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.84 
 
 
506 aa  466  9.999999999999999e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.68 
 
 
502 aa  462  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2332  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.05 
 
 
526 aa  462  1e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0327  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.79 
 
 
507 aa  464  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 
502 aa  464  1e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 
502 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 
502 aa  464  1e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1505  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.28 
 
 
502 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.56305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 
502 aa  464  1e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.85 
 
 
502 aa  465  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.68 
 
 
502 aa  463  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 
502 aa  464  1e-129  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15701  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.44 
 
 
504 aa  462  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.110948  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1961  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.1 
 
 
510 aa  462  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.938875  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  50.11 
 
 
502 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0915  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.41 
 
 
505 aa  462  1e-129  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0383852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 
502 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.84 
 
 
526 aa  463  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.48 
 
 
502 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0604  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.28 
 
 
502 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.89 
 
 
502 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_501  ATP synthase F1, alpha subunit  48.1 
 
 
503 aa  462  1e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0562093  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.36 
 
 
501 aa  465  1e-129  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0562  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.1 
 
 
503 aa  461  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.529195  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2619  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48 
 
 
503 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.622361 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.89 
 
 
504 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1736  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.2 
 
 
505 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.46 
 
 
502 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0488  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.36 
 
 
506 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.294002  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4334  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.05 
 
 
512 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00117083  normal  0.611425 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.43 
 
 
505 aa  459  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0270  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.68 
 
 
505 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.45 
 
 
501 aa  457  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0601  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.9 
 
 
505 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00209636  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  46.82 
 
 
501 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.68 
 
 
503 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.61 
 
 
505 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0297  F0F1 ATP synthase subunit alpha  45.62 
 
 
526 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.68 
 
 
503 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2606  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.55 
 
 
506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.37 
 
 
503 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  46 
 
 
507 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0747  ATP synthase F1, alpha subunit  44.89 
 
 
504 aa  453  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.873736  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16531  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.91 
 
 
505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.592214  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2611  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.49 
 
 
506 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.169882  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.23 
 
 
502 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.116029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2996  F0F1 ATP synthase subunit alpha  53.33 
 
 
522 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16301  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.33 
 
 
505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0465  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.42 
 
 
509 aa  453  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.809021  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1544  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.12 
 
 
505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4037  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.23 
 
 
502 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00278502 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16411  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.91 
 
 
505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0292  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.45 
 
 
507 aa  451  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0981  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.4 
 
 
504 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3338  ATP synthase F1 subunit alpha  47.07 
 
 
506 aa  451  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0947  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.46 
 
 
502 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3133  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.46 
 
 
502 aa  451  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1985  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.05 
 
 
526 aa  450  1e-125  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.25217  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  47.58 
 
 
512 aa  450  1e-125  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2188  F0F1 ATP synthase subunit alpha  48.54 
 
 
506 aa  449  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.929468 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1654  F0F1 ATP synthase subunit alpha  49.78 
 
 
511 aa  451  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  47.2 
 
 
507 aa  450  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0131  ATP synthase F1, alpha subunit  49.66 
 
 
509 aa  449  1e-125  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0945  alternate F1F0 ATPase, F1 subunit alpha  50.64 
 
 
585 aa  451  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.670591  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.12 
 
 
509 aa  450  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.45 
 
 
502 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18491  F0F1 ATP synthase subunit alpha  47.97 
 
 
504 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0663  F0F1 ATP synthase subunit alpha  44.93 
 
 
520 aa  450  1e-125  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0131395  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0262  F0F1 ATP synthase subunit alpha  45.62 
 
 
526 aa  450  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0489814 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21420  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  47.05 
 
 
520 aa  449  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4070  F0F1 ATP synthase subunit alpha  45.97 
 
 
517 aa  448  1.0000000000000001e-124  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0283869  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1797  ATP synthase F1, alpha subunit  50.66 
 
 
504 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>