More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4511 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4511  small GTP-binding protein  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154216  normal  0.99692 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0761  GTP-binding protein HSR1-related  55.6 
 
 		 720 aa  292  5e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0972395  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1043  ferrous iron transport protein B  53.18 
 
 		 725 aa  285  4e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00262992 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1972  small GTP-binding protein  58.52 
 
 		 244 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0845382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2275  small GTP-binding protein  59.46 
 
 		 244 aa  271  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3838  small GTP-binding protein  59.63 
 
 		 262 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2719  GTP-binding protein, HSR1-related  57.14 
 
 		 261 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0076047  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0679  ferrous iron transport protein B  54.46 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0623  ferrous iron transport protein B, N-terminal region  54.46 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0768  ferrous iron transport protein B, N- region  54.46 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000015907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0842  ferrous iron transport protein B, N- region  57 
 
 		 240 aa  253  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0748  ferrous iron transport protein B  56.52 
 
 		 240 aa  250  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4589  ferrous iron transport protein B  57 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1538  GTP-binding protein, HSR1-related  52.54 
 
 		 259 aa  249  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0623  ferrous iron transport protein B  54.46 
 
 		 240 aa  246  3e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000038054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0629  small GTP-binding protein  55.56 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1404  GTP-binding protein, HSR1-related  53.7 
 
 		 716 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000264351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1406  GTP-binding protein, HSR1-related  57.27 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3772  GTP-binding protein HSR1-related  52.49 
 
 		 271 aa  241  9e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0601  small GTP-binding protein  56.04 
 
 		 240 aa  238  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02710  Ferrous iron transport protein FeoB  46.85 
 
 		 262 aa  238  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1009  ferrous iron transport protein B  48.42 
 
 		 707 aa  208  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0206507  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  42.8 
 
 		 680 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1266  GTP-binding protein, HSR1-related  50.47 
 
 		 689 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  44.18 
 
 		 786 aa  185  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  42.11 
 
 		 676 aa  182  6e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0850  ferrous iron transport protein B  46.08 
 
 		 695 aa  180  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  42.98 
 
 		 778 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  45.45 
 
 		 741 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  39.26 
 
 		 720 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2493  ferrous iron transport protein B  46.26 
 
 		 743 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1209  small GTP-binding protein  58.9 
 
 		 609 aa  176  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0549532  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2213  ferrous iron transport protein B  45.28 
 
 		 713 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  42.45 
 
 		 665 aa  174  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  42.98 
 
 		 732 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  43.83 
 
 		 724 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  45.83 
 
 		 776 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  43.22 
 
 		 725 aa  171  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  42.13 
 
 		 669 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  42.13 
 
 		 669 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  46.7 
 
 		 778 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  43.13 
 
 		 725 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  44.09 
 
 		 740 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  40.32 
 
 		 712 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  42.04 
 
 		 680 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0012  ferrous iron transport protein B  44.13 
 
 		 717 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00299021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  39.6 
 
 		 743 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4259  small GTP-binding protein  50.93 
 
 		 176 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.548408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  44.6 
 
 		 738 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  44.12 
 
 		 770 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0554  small GTP-binding protein  50.31 
 
 		 176 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  44.12 
 
 		 770 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  40.25 
 
 		 666 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  39.83 
 
 		 688 aa  163  3e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  40.74 
 
 		 712 aa  163  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1739  ferrous iron transport protein B  39.62 
 
 		 646 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00069018  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  41.01 
 
 		 783 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  42.08 
 
 		 740 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0646  small GTP-binding protein  42.86 
 
 		 826 aa  160  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  43.48 
 
 		 662 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1553  small GTP-binding protein  36.78 
 
 		 822 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00130117  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  40.37 
 
 		 711 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3545  small GTP-binding protein  52.7 
 
 		 177 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  40.45 
 
 		 657 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  43.38 
 
 		 778 aa  159  4e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2464  ferrous iron transport protein B  40.18 
 
 		 712 aa  159  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.967572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  37.05 
 
 		 697 aa  159  6e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  42.4 
 
 		 713 aa  159  6e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0108  ferrous iron transport protein B  40.55 
 
 		 712 aa  159  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  40.71 
 
 		 747 aa  158  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  41.36 
 
 		 774 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1622  ferrous iron transport protein B  42.33 
 
 		 722 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.782227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  39.83 
 
 		 664 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  39.13 
 
 		 669 aa  156  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  39.26 
 
 		 662 aa  156  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  41.51 
 
 		 666 aa  156  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0259  ferrous iron transport protein B  41.18 
 
 		 628 aa  155  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00038951  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1585  ferrous iron transport protein B  40.08 
 
 		 723 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0104102  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0571  ferrous iron transport protein B  41.23 
 
 		 845 aa  155  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  42.56 
 
 		 676 aa  155  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1959  ferrous iron transport protein B  39.42 
 
 		 816 aa  155  9e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0239  ferrous iron transport protein B  39.42 
 
 		 816 aa  155  9e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  39.91 
 
 		 741 aa  155  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  41.41 
 
 		 774 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  38.16 
 
 		 667 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1929  ferrous iron transport protein B  40.09 
 
 		 712 aa  153  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000762105  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1015  ferrous iron transport protein B  41.31 
 
 		 759 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.913336 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  36.18 
 
 		 646 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1452  ferrous iron transport protein B  37.84 
 
 		 665 aa  152  7e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.789379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0303  small GTP-binding protein  40.18 
 
 		 678 aa  151  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  40.65 
 
 		 728 aa  151  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  43.4 
 
 		 749 aa  151  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  38.89 
 
 		 647 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  34.66 
 
 		 829 aa  149  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12990  ferrous iron transporter FeoB  39.04 
 
 		 824 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0255803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  40.74 
 
 		 714 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  40.09 
 
 		 647 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  35.83 
 
 		 665 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  37.96 
 
 		 647 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  43.53 
 
 		 631 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>