More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5068 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_5068  putative GNAT family acetyltransferase  100 
 
 
164 aa  337  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5129  GCN5-related N-acetyltransferase  72.5 
 
 
175 aa  244  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601206  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6404  GCN5-related N-acetyltransferase  70.37 
 
 
175 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111575  normal  0.507549 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1243  GCN5-related N-acetyltransferase  68.12 
 
 
169 aa  225  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.722913  normal  0.335188 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0377  GCN5-related N-acetyltransferase  62.5 
 
 
172 aa  217  7e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4433  GCN5-related N-acetyltransferase  59.51 
 
 
185 aa  216  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0583  GCN5-related N-acetyltransferase  57.93 
 
 
177 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5587  hypothetical protein  61.25 
 
 
172 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4892  phosphinothricin N-acetyltransferase, putative  58.28 
 
 
180 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0694  GCN5-related N-acetyltransferase  62.34 
 
 
166 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64360  hypothetical protein  60.62 
 
 
172 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272704  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4846  GCN5-related N-acetyltransferase  60.38 
 
 
171 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  59.17 
 
 
178 aa  210  7e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.23018 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4638  GCN5-related N-acetyltransferase  61.64 
 
 
171 aa  209  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0702354 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  59.75 
 
 
171 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4903  GCN5-related N-acetyltransferase  60.38 
 
 
171 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449893  hitchhiker  0.00644876 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1274  Phosphinothricin acetyltransferase  64.05 
 
 
168 aa  202  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2104  GCN5-related N-acetyltransferase  59.49 
 
 
171 aa  196  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  56.33 
 
 
172 aa  193  1e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2054  acetyltransferase, GNAT family  56.33 
 
 
193 aa  192  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000047072 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1725  acetyltransferase  55.7 
 
 
172 aa  192  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000562438 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1629  acetyltransferase  56.33 
 
 
193 aa  192  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1534  acetyltransferase  56.33 
 
 
193 aa  192  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2211  GCN5-related N-acetyltransferase  56.33 
 
 
172 aa  192  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1718  acetyltransferase, GNAT family  56.33 
 
 
193 aa  191  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01405  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  56.33 
 
 
172 aa  191  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01416  hypothetical protein  56.33 
 
 
172 aa  191  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0868  GCN5-related N-acetyltransferase  58.82 
 
 
169 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0919602  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1751  phosphinothricin acetyltransferase  54.37 
 
 
171 aa  187  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1570  phosphinothricin acetyltransferase  54.37 
 
 
171 aa  187  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.538734  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1770  phosphinothricin acetyltransferase  54.37 
 
 
171 aa  187  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1705  phosphinothricin acetyltransferase  54.37 
 
 
171 aa  187  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.667334  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1708  phosphinothricin acetyltransferase  54.37 
 
 
171 aa  187  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0205864  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0996  GCN5-related N-acetyltransferase  59.48 
 
 
183 aa  187  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1596  acetyltransferase  56 
 
 
202 aa  182  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1268  GCN5-related N-acetyltransferase  54.67 
 
 
164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1649  acetyltransferase  55.33 
 
 
164 aa  180  6e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.336507  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  56 
 
 
171 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3167  GCN5-related N-acetyltransferase  56 
 
 
171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  47.13 
 
 
182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1146  GCN5-related N-acetyltransferase  47.13 
 
 
182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1122  GCN5-related N-acetyltransferase  45.86 
 
 
184 aa  160  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0293431  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2159  GCN5-related N-acetyltransferase  45.57 
 
 
184 aa  156  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147439  normal  0.386853 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4258  GCN5-related N-acetyltransferase  44.3 
 
 
182 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257172  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3636  GCN5-related N-acetyltransferase  52.67 
 
 
165 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3983  GCN5-related N-acetyltransferase  43.67 
 
 
178 aa  153  8e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3760  GCN5-related N-acetyltransferase  44.65 
 
 
182 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4837  GCN5-related N-acetyltransferase  44.65 
 
 
182 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3133  putative antibiotic resistance (acetyltransferase) protein  43.31 
 
 
182 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2211  GCN5-related N-acetyltransferase  45.86 
 
 
173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0487  N-acetyltransferase  47.97 
 
 
165 aa  147  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2535  phosphinothricin N-acetyltransferase  41.03 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0379071  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1028  GCN5-related N-acetyltransferase  45.22 
 
 
182 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.517814  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  44.59 
 
 
182 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2837  acetyltransferase  41.03 
 
 
170 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000369165  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2857  acetyltransferase, GNAT family  41.18 
 
 
170 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000726351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2568  phosphinothricin N-acetyltransferase  41.18 
 
 
170 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852433  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2817  acetyltransferase, GNAT family  41.18 
 
 
170 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000095145 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2475  acetyltransferase, GNAT family  39.74 
 
 
170 aa  133  9e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.357932  normal  0.684775 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2815  acetyltransferase, GNAT family  39.74 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  38.56 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2552  GCN5-related N-acetyltransferase  38.56 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2457  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 
167 aa  130  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2611  GCN5-related N-acetyltransferase  37.82 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2779  GCN5-related N-acetyltransferase  40.54 
 
 
165 aa  127  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229182  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2090  phosphinothricin acetyltransferase, putative  38.56 
 
 
164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04066  N-acetyltransferase  39.6 
 
 
173 aa  125  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.691269  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1861  GCN5-related N-acetyltransferase  42.4 
 
 
177 aa  113  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0026  GCN5-related N-acetyltransferase  38.41 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  39.24 
 
 
180 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
185 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1787  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  38.31 
 
 
200 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000010061 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  40.24 
 
 
184 aa  107  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 
186 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4882  GCN5-related N-acetyltransferase  37.42 
 
 
197 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256707  normal  0.880249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1342  GCN5-related N-acetyltransferase  39.26 
 
 
185 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327917  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  37.2 
 
 
176 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695211  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0238  GCN5-related N-acetyltransferase  38.96 
 
 
183 aa  103  9e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1921  Phosphinothricin acetyltransferase  33.79 
 
 
165 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5489  GCN5-related N-acetyltransferase  36.75 
 
 
176 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385408  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0784  GNAT family acetyltransferase  34 
 
 
158 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4059  GCN5-related N-acetyltransferase  39.35 
 
 
207 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0540643  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2571  phosphinothricin N-acetyltransferase  32.03 
 
 
169 aa  101  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209959  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  36 
 
 
162 aa  101  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570513  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1369  Phosphinothricin acetyltransferase  38.41 
 
 
177 aa  101  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3388  GCN5-related N-acetyltransferase  36.91 
 
 
156 aa  101  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00641  phosphinothricin N-acetyltransferase  38.41 
 
 
170 aa  100  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405677  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2440  GCN5-related N-acetyltransferase  34 
 
 
158 aa  100  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961994  hitchhiker  0.00680494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0385  phosphinothricin acetyltransferase (PPT N-acetyltransferase)  37.66 
 
 
176 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0089  phosphinothricin N-acetyltransferase  37.89 
 
 
179 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32151  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0396  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 
183 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617467  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1342  phosphinothricin N-acetyltransferase, putative  34.64 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.952982  normal  0.763441 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  36.13 
 
 
182 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0556271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5144  Phosphinothricin acetyltransferase  35.1 
 
 
170 aa  99  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324669  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3647  GCN5-related N-acetyltransferase  36.13 
 
 
182 aa  99  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1154  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
186 aa  98.2  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0181286  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1352  phosphinothricin N-acetyltransferase  36.42 
 
 
247 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2530  phosphinothricin N-acetyltransferase  36.42 
 
 
247 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1274  phosphinothricin N-acetyltransferase  36.42 
 
 
247 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4517  GCN5-related N-acetyltransferase  36.42 
 
 
187 aa  97.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.729154  normal  0.542094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>