76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1847 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1847  putative glutathione S-transferase-related protein  100 
 
 		 310 aa  631  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1438  Glutathione S-transferase domain  51.28 
 
 		 318 aa  301  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44949  normal  0.0129155 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1479  Glutathione S-transferase domain protein  50 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627969  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1768  putative glutathione S-transferase-related protein  50.96 
 
 		 318 aa  285  8e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.628601  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1783  putative glutathione S-transferase-related protein  46.6 
 
 		 310 aa  278  6e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14170  hypothetical protein  42.26 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2563  putative glutathione S-transferase-related protein  43.27 
 
 		 312 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.569618  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3552  glutathione S-transferase-like protein  43.45 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872782  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1259  hypothetical protein  42.31 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0981  hypothetical protein  42.44 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2490  putative glutathione S-transferase-related protein  43.27 
 
 		 313 aa  249  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  42.72 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.417859 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1081  hypothetical protein  41.94 
 
 		 310 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2869  putative glutathione S-transferase-related protein  43.32 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1263  hypothetical protein  41.94 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2915  putative glutathione S-transferase-related protein  41.35 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2004  putative glutathione S-transferase-related protein  42.81 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.344243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1699  putative glutathione S-transferase-related protein  42.49 
 
 		 308 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11360  hypothetical protein  38.98 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1650  hypothetical protein  38.22 
 
 		 310 aa  199  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227985  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03487  conserved hypothetical protein  27.06 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.67628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  34.19 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  29.63 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.65 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  31.39 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2783  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.37 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01261  putative glutathione S-transferase  25.26 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.991625  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  27.41 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  27.41 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.37 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  22.37 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  30.16 
 
 		 241 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  22.96 
 
 		 241 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  26.24 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  31.11 
 
 		 246 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  24.5 
 
 		 239 aa  53.5  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01271  putative glutathione S-transferase  24.23 
 
 		 241 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.867718  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  24.55 
 
 		 221 aa  53.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2289  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.61 
 
 		 252 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.497964  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  23.5 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0113  putative glutathione S-transferase  25.91 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6309  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.6 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  25.69 
 
 		 198 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  24.78 
 
 		 223 aa  50.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2142  glutathione S-transferase-like protein  28.47 
 
 		 223 aa  49.3  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2019  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569659 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  26.87 
 
 		 203 aa  47.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  27.03 
 
 		 222 aa  47.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  26.87 
 
 		 203 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  26.87 
 
 		 203 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  25.37 
 
 		 203 aa  45.8  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  25.37 
 
 		 203 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3441  maleylacetoacetate isomerase  32.65 
 
 		 219 aa  45.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06190  putative glutathione S-transferase  28.46 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  27.18 
 
 		 203 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  27.18 
 
 		 203 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.18 
 
 		 203 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  27.1 
 
 		 203 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  27.1 
 
 		 203 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  27.1 
 
 		 203 aa  44.3  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  27.1 
 
 		 203 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  27.1 
 
 		 203 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  27.1 
 
 		 203 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  27.1 
 
 		 203 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  27.1 
 
 		 203 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.17 
 
 		 203 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  26.17 
 
 		 203 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.17 
 
 		 203 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.17 
 
 		 203 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.17 
 
 		 203 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.17 
 
 		 203 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  26.17 
 
 		 203 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29981  predicted protein  26.04 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0281173  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0852  putative transcription modulator protein  26.12 
 
 		 204 aa  42.7  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  25.47 
 
 		 203 aa  42.7  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 		 203 aa  42.4  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>