87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0864 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2465  hypothetical protein  72.22 
 
 		 470 aa  713    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0864  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  1024    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5980  hypothetical protein  60.22 
 
 		 470 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.335989  normal  0.514898 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2216  hypothetical protein  60.13 
 
 		 470 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4704  hypothetical protein  59.66 
 
 		 473 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0115102 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5403  hypothetical protein  53.85 
 
 		 470 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1504  hypothetical protein  47.47 
 
 		 462 aa  428  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.215631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1408  hypothetical protein  45.92 
 
 		 464 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1437  hypothetical protein  45.92 
 
 		 464 aa  422  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.768827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1145  hypothetical protein  45.06 
 
 		 465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2987  hypothetical protein  44.64 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000011145  hitchhiker  0.00753945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1207  hypothetical protein  45.57 
 
 		 474 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.587699  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2396  hypothetical protein  44.47 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2140  hypothetical protein  49.57 
 
 		 470 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0653  hypothetical protein  43.98 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7522  hypothetical protein  46.57 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2955  hypothetical protein  42.12 
 
 		 510 aa  358  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000276818  hitchhiker  0.00175827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6353  hypothetical protein  43.5 
 
 		 484 aa  349  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.385812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6605  hypothetical protein  46.47 
 
 		 470 aa  344  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1593  hypothetical protein  41.3 
 
 		 476 aa  342  7e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0473  hypothetical protein  43.29 
 
 		 473 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1503  hypothetical protein  44.4 
 
 		 503 aa  328  2.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0473  Protein of unknown function DUF2252  42.13 
 
 		 462 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1503  Protein of unknown function DUF2252  45.02 
 
 		 464 aa  322  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.935426  normal  0.301708 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2326  hypothetical protein  40.75 
 
 		 474 aa  319  7.999999999999999e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00587073  hitchhiker  0.0000416917 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3161  hypothetical protein  39.58 
 
 		 437 aa  317  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0158  hypothetical protein  38.73 
 
 		 477 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.94727  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0568  hypothetical protein  38.44 
 
 		 468 aa  310  5e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4747  hypothetical protein  40.97 
 
 		 487 aa  306  8.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2365  Protein of unknown function DUF2252  38.44 
 
 		 458 aa  294  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398569  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1130  hypothetical protein  38.92 
 
 		 494 aa  289  6e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1242  hypothetical protein  38.71 
 
 		 494 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.36599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2520  hypothetical protein  37.47 
 
 		 493 aa  283  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0184081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4442  hypothetical protein  40.17 
 
 		 479 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2396  hypothetical protein  37.42 
 
 		 495 aa  267  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1587  hypothetical protein  35.4 
 
 		 461 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1537  hypothetical protein  31.87 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2087  hypothetical protein  28.41 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0931  Protein of unknown function DUF2252  26.39 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1648  hypothetical protein  27 
 
 		 437 aa  107  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.324068  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1916  hypothetical protein  24.49 
 
 		 480 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.382206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2341  hypothetical protein  24.73 
 
 		 444 aa  104  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000268257  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02588  conserved hypothetical protein  26.29 
 
 		 448 aa  103  6e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0352078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5970  hypothetical protein  25.87 
 
 		 436 aa  101  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.323905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1384  hypothetical protein  25.4 
 
 		 438 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.978626  normal  0.608008 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3367  hypothetical protein  26.16 
 
 		 391 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000329011  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1350  hypothetical protein  25.17 
 
 		 442 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.060115  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1368  hypothetical protein  25.17 
 
 		 438 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4516  hypothetical protein  24.31 
 
 		 486 aa  96.3  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1180  hypothetical protein  25.58 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2606  hypothetical protein  26.39 
 
 		 448 aa  90.5  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.045879  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6450  hypothetical protein  64.06 
 
 		 176 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.201741 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4820  Protein of unknown function DUF2252  23.61 
 
 		 447 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.923578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5889  hypothetical protein  25.24 
 
 		 404 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0828  hypothetical protein  23.67 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.182341  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2085  hypothetical protein  25.31 
 
 		 407 aa  87  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2529  hypothetical protein  22.92 
 
 		 492 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.301158  normal  0.321166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3585  hypothetical protein  22.92 
 
 		 492 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3805  hypothetical protein  46 
 
 		 138 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.702256  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4080  hypothetical protein  25.06 
 
 		 404 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1459  hypothetical protein  25.98 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01772  hypothetical protein  24.83 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1341  hypothetical protein  25.99 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.101093 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4763  hypothetical protein  26.98 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.896269  normal  0.204861 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0769  hypothetical protein  23.11 
 
 		 503 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.598571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4869  Protein of unknown function DUF2252  31.9 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534903  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1406  hypothetical protein  25.3 
 
 		 408 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  0.0309709 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3960  hypothetical protein  25.14 
 
 		 399 aa  66.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.146173  normal  0.0157887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1863  hypothetical protein  31.9 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.165766 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2044  hypothetical protein  25.73 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.122216  normal  0.245811 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5840  hypothetical protein  25.19 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.5584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5266  hypothetical protein  36.97 
 
 		 369 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.164397  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3637  hypothetical protein  35.48 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4552  hypothetical protein  25.71 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0632047 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3587  hypothetical protein  23.66 
 
 		 414 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4087  hypothetical protein  23.86 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3998  hypothetical protein  24.34 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2373  hypothetical protein  34.62 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.424194  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4574  hypothetical protein  37.93 
 
 		 358 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0041  hypothetical protein  34.48 
 
 		 401 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0602392  normal  0.0628482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0074  hypothetical protein  28.78 
 
 		 406 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.667411 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2635  hypothetical protein  25.27 
 
 		 392 aa  45.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0021  hypothetical protein  33.33 
 
 		 401 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3330  hypothetical protein  37.93 
 
 		 364 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0308165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4311  hypothetical protein  48.94 
 
 		 358 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5051  hypothetical protein  37.35 
 
 		 357 aa  43.5  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.684708  normal  0.0897321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>