More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0362 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0362  ATPase  100 
 
 		 298 aa  591  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0422  ATPase  90.57 
 
 		 305 aa  529  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0381294  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1351  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  78.01 
 
 		 298 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0525002  normal  0.107862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1415  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  78.01 
 
 		 298 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.144398 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0367  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  76.11 
 
 		 295 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.473428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0092  ATPase  76.61 
 
 		 296 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4354  putative ATPase  76.11 
 
 		 295 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1466  hypothetical protein  77.89 
 
 		 301 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.283033 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1290  ATPase  58.6 
 
 		 309 aa  350  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0290732  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2605  ATPase  56.76 
 
 		 303 aa  341  7e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2959  ATPase  57 
 
 		 303 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.937893  hitchhiker  0.00986895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1633  ATPase  56.42 
 
 		 302 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3676  ATPase  55.74 
 
 		 302 aa  335  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4324  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  56.08 
 
 		 300 aa  335  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.294108  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1485  ATPase  56.12 
 
 		 309 aa  333  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.0145294 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1784  ATPase  56.42 
 
 		 302 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.582319  normal  0.377483 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2356  hypothetical protein  59.93 
 
 		 303 aa  333  2e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.952971 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0327  ATPase  58.16 
 
 		 304 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0968  ATPase  56.44 
 
 		 314 aa  333  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2203  AAA ATPase  56.23 
 
 		 314 aa  331  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.55218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5316  ATPase  56.23 
 
 		 302 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.397847 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0471  ATPase  56.52 
 
 		 300 aa  330  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129382  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1752  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  59.93 
 
 		 300 aa  328  7e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27049  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1770  ATPase  56.55 
 
 		 304 aa  328  7e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2452  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.42 
 
 		 302 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1758  AAA_5 ATPase  56.01 
 
 		 301 aa  325  5e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0088309  normal  0.628591 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1524  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.04 
 
 		 299 aa  323  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.711967 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0582  ATPase  56.46 
 
 		 304 aa  322  3e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5445  ATPase  59.79 
 
 		 300 aa  322  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1931  AAA family ATPase  56.46 
 
 		 304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2699  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.36 
 
 		 314 aa  319  3.9999999999999996e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0577482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2166  ATPase  54.14 
 
 		 296 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1452  ATPase  53.74 
 
 		 296 aa  311  6.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1142  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.25 
 
 		 300 aa  308  5e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2377  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.8 
 
 		 305 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2251  ATPase  54.28 
 
 		 312 aa  305  9.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.117441 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3975  ATPase  55.02 
 
 		 294 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.212397  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4537  ATPase  55.09 
 
 		 305 aa  301  7.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0114  ATPase  54.67 
 
 		 314 aa  299  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2980  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  57.49 
 
 		 304 aa  297  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000460304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13080  MoxR-like ATPase  55.63 
 
 		 316 aa  296  4e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4712  AAA ATPase central domain protein  53.85 
 
 		 324 aa  296  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0992582  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0239  ATPase  51.97 
 
 		 291 aa  292  5e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3030  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  54.76 
 
 		 308 aa  292  6e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.261439  normal  0.0317155 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.7 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0575  ATPase  50 
 
 		 328 aa  287  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2768  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  53.71 
 
 		 297 aa  285  8e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1383  ATPase  54.81 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.11716 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2148  putative MoxR-like ATPase, CoxD  50.69 
 
 		 297 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0344546  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6198  ATPase  54.15 
 
 		 292 aa  279  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0346062  normal  0.0544047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4954  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  52.4 
 
 		 305 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1565  ATPase  55.47 
 
 		 293 aa  275  6e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0033  putative ATPase  50 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.273348 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2036  ATPase  50.55 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0580414  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0632  ATPase  53.79 
 
 		 280 aa  269  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1375  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.77 
 
 		 298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.842047  normal  0.382396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2843  ATPase associated with various cellular activities, AAA_5  53.7 
 
 		 288 aa  264  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.089583  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4108  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  51.64 
 
 		 294 aa  262  4e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.466442  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0806  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.21 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.243298 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10375  oxidoreductase  50 
 
 		 298 aa  258  8e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000136286  normal  0.912822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0046  ATPase  47.35 
 
 		 310 aa  257  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4313  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  50.34 
 
 		 296 aa  256  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322215  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1955  ATPase  44.7 
 
 		 315 aa  254  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2708  ATPase associated with various cellular activities, AAA-5  46.6 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.867096  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0825  ATPase  49.24 
 
 		 300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00233341  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4807  ATPase  51.11 
 
 		 293 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.818126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2702  ATPase  45.16 
 
 		 334 aa  251  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0929755  normal  0.507457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0719  AAA_5 ATPase  45.22 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0759  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.94 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.355314 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2182  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.11 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1584  ATPase  48 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000201568  normal  0.651039 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2094  AAA_5 ATPase  48.73 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.393208 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2894  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.26 
 
 		 306 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2801  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  46.26 
 
 		 306 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.088397  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2759  AAA ATPase central domain protein  44.53 
 
 		 292 aa  249  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0232984  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5289  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.65 
 
 		 298 aa  248  7e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1213  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  49.26 
 
 		 302 aa  248  9e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0634227  normal  0.99414 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0212  ATPase  50.94 
 
 		 288 aa  248  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0536  ATPase  45.27 
 
 		 326 aa  246  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.996373  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1750  carbon monoxide dehydrogenase, coxD accessory protein  49.64 
 
 		 299 aa  246  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.705157  normal  0.655706 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0102  ATPase  45.92 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0615  ATPase  43.87 
 
 		 315 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.376805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0654  ATPase  45.27 
 
 		 326 aa  245  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3567  ATPase  41.02 
 
 		 316 aa  245  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.110663  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0291  ATPase  47.46 
 
 		 299 aa  242  7e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0812  AAA ATPase  42.58 
 
 		 315 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1262  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.69 
 
 		 321 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1229  AAA_5 ATPase associated with various cellular activities  45.91 
 
 		 297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.809649  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1604  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.41 
 
 		 295 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.084581  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5255  ATPase  45.08 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.290387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1646  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  45.88 
 
 		 302 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3933  ATPase  45.58 
 
 		 294 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2810  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  44.95 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0366113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3537  ATPase  45.23 
 
 		 295 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.648434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3610  ATPase  45.23 
 
 		 295 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0405029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3542  ATPase  45.23 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2645  ATPase  45.36 
 
 		 291 aa  235  8e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2693  putative ATPase  44.19 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.164702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0778  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  43.88 
 
 		 413 aa  232  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1567  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  47.48 
 
 		 322 aa  232  5e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.24742  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>