More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1874 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1874  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  100 
 
 		 336 aa  666    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1290  rod shape-determining protein MreB  60.83 
 
 		 342 aa  424  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.69839  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0848  rod shape-determining protein MreB  59.64 
 
 		 351 aa  418  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000008182  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1820  rod shape-determining protein MreB  61.28 
 
 		 342 aa  418  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0691  rod shape-determining protein MreB  61.59 
 
 		 342 aa  420  1e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.444485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0800  rod shape-determining protein MreB  60.83 
 
 		 342 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0512  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 342 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.370229  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0553  rod shape-determining protein MreB  60.24 
 
 		 345 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.212626 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  61.38 
 
 		 346 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3308  rod shape-determining protein MreB  59.36 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0785141  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  60.18 
 
 		 347 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0808  rod shape-determining protein MreB  59.12 
 
 		 340 aa  395  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.880258 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  58.91 
 
 		 346 aa  397  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.17 
 
 		 350 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  60.06 
 
 		 347 aa  391  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  60.06 
 
 		 347 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  60.06 
 
 		 347 aa  391  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0249  rod shape-determining protein MreB  56.27 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  57.69 
 
 		 343 aa  389  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  58.98 
 
 		 347 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  57.49 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  58.08 
 
 		 346 aa  384  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0194  rod shape-determining protein MreB  59.23 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  61.04 
 
 		 344 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5925  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  57.77 
 
 		 341 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  56.71 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  55.69 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  60 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3832  rod shape-determining protein MreB  56.98 
 
 		 341 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.11388 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  56.97 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  59.27 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  56.72 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  56.72 
 
 		 342 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  58.38 
 
 		 347 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  60.49 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  59.02 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  57.06 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  57.35 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  59.33 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  55.09 
 
 		 343 aa  378  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  59.02 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  58.56 
 
 		 343 aa  378  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  57.23 
 
 		 368 aa  379  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  56.63 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  58.43 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7285  rod shape-determining protein MreB  58.08 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  56.25 
 
 		 340 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  57.31 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  55.49 
 
 		 343 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  56.93 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  57.6 
 
 		 346 aa  376  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1687  MreB/Mrl family cell shape determining protein  57.45 
 
 		 344 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.869584  normal  0.143925 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  56.8 
 
 		 340 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  58.51 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  55.29 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  58.16 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  57.49 
 
 		 342 aa  371  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0766  rod shape-determining protein MreB  56.93 
 
 		 342 aa  374  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0541555  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  57.23 
 
 		 348 aa  374  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3388  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  56.53 
 
 		 344 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.315024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00565  putative rod-shape determining protein  55.98 
 
 		 342 aa  370  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.444637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  53.89 
 
 		 343 aa  368  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0537  rod shape-determining protein MreB  58.28 
 
 		 346 aa  368  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.433633 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  56.38 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  55.29 
 
 		 339 aa  364  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0107  rod shape-determining protein MreB  55.52 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  56.5 
 
 		 344 aa  364  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1248  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  56.16 
 
 		 345 aa  363  2e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0506008  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1539  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  55.82 
 
 		 344 aa  363  3e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113087  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  58.28 
 
 		 347 aa  363  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  52.71 
 
 		 344 aa  362  4e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1461  rod shape-determining protein MreB  55 
 
 		 347 aa  362  6e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000397491  unclonable  0.000000242005 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3167  rod shape-determining protein MreB  52.4 
 
 		 338 aa  361  1e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  55.06 
 
 		 347 aa  361  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1734  rod shape-determining protein MreB  54.87 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000550029  normal  0.180064 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  54.35 
 
 		 346 aa  360  2e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2125  rod shape-determining protein MreB  54.91 
 
 		 345 aa  360  2e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.55936  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  55.89 
 
 		 347 aa  359  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0663  rod shape-determining protein MreB  52.1 
 
 		 339 aa  359  4e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.435022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  55.89 
 
 		 347 aa  359  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4571  rod shape-determining protein MreB  52.1 
 
 		 339 aa  359  4e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00556747  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0868  rod shape-determining protein MreB  54.91 
 
 		 345 aa  358  5e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1352  rod shape-determining protein MreB  53.99 
 
 		 343 aa  359  5e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.261173  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  56.88 
 
 		 348 aa  358  5e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1461  rod shape-determining protein MreB  54.95 
 
 		 354 aa  358  5e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.473562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  56.19 
 
 		 347 aa  359  5e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  55.59 
 
 		 347 aa  359  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4544  rod shape-determining protein MreB  52.1 
 
 		 339 aa  358  6e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  54.05 
 
 		 346 aa  358  6e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4350  rod shape-determining protein MreB  52.1 
 
 		 339 aa  358  6e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000471132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4186  rod shape-determining protein MreB  52.1 
 
 		 339 aa  358  6e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4197  rod shape-determining protein MreB  52.1 
 
 		 339 aa  358  6e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  54.05 
 
 		 346 aa  358  6e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4684  rod shape-determining protein MreB  52.1 
 
 		 339 aa  358  6e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4586  rod shape-determining protein MreB  52.1 
 
 		 339 aa  358  6e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.176997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4532  rod shape-determining protein MreB  52.1 
 
 		 339 aa  358  6e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2728  rod shape-determining protein MreB  57.01 
 
 		 347 aa  358  7e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000992624  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  55.26 
 
 		 348 aa  358  8e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  55.89 
 
 		 347 aa  358  8e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>