30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1798 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1798  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 235 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.27 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3815  Tetratricopeptide domain protein  35.42 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5454  Tetratricopeptide domain protein  31.53 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0213  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 259 aa  92  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0496  hypothetical protein  29.95 
 
 		 208 aa  89.4  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1348  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2069  TPR repeat  30.69 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1777  Tetratricopeptide domain protein  29.91 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3719  TPR domain-containing protein  29.73 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1800  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.74 
 
 		 227 aa  85.1  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0705  TPR repeat-containing protein  31.53 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0326  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1430  TPR domain-containing protein  30.61 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.480041 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09778  hypothetical protein  31.76 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.685186  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0533  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000139229 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1657  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.73 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0480  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 264 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0908  hypothetical protein  24.12 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.171086  hitchhiker  0.000000000418263 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0652  hypothetical protein  39.71 
 
 		 833 aa  49.3  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.326198 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1607  hypothetical protein  32.95 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0731714 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1935  hypothetical protein  32.95 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2855  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 222 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000189993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1655  hypothetical protein  31.82 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.858349  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2078  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  30.39 
 
 		 782 aa  42.4  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2203  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.06 
 
 		 243 aa  42.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  29.63 
 
 		 222 aa  42  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2291  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.3 
 
 		 243 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>