80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5587 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5587  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  937    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0909697  normal  0.0199748 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5900  hypothetical protein  58.2 
 
 		 459 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02340  cytochrome P450  42.01 
 
 		 445 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.169645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0607  cytochrome P450  38.07 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00215804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0629  cytochrome P450  38.07 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0616  cytochrome P450  38.07 
 
 		 407 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1360  cytochrome P450 monooxygenase  37.56 
 
 		 478 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.731473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2008  hypothetical protein  35.68 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2435  cytochrome P450  31.03 
 
 		 456 aa  171  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0411175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3091  cytochrome P450  30.85 
 
 		 467 aa  147  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.242717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  25 
 
 		 463 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6754  cytochrome P450  26.29 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  32.89 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  32.89 
 
 		 471 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1455  cytochrome P450  25.57 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0276  putative cytochrome P450 hydroxylase superfamily protein  29.41 
 
 		 460 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5109  cytochrome P450  29.27 
 
 		 1071 aa  53.9  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  34.78 
 
 		 462 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2337  putative cytochrome P450  26.5 
 
 		 458 aa  53.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.338094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  31.46 
 
 		 473 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  25.81 
 
 		 469 aa  53.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  30.05 
 
 		 462 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  24.54 
 
 		 431 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0425  cytochrome P450  25.99 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  27.86 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4969  cytochrome P450  29.68 
 
 		 473 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  0.174544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  27.72 
 
 		 1075 aa  50.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  26.78 
 
 		 447 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  30.91 
 
 		 464 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  33.08 
 
 		 468 aa  50.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  25.47 
 
 		 433 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  23.81 
 
 		 466 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  23.84 
 
 		 462 aa  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2522  cytochrome P450  26.07 
 
 		 1053 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  28.81 
 
 		 462 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2396  cytochrome P450  29.45 
 
 		 449 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0570158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2324  cytochrome P450  25.45 
 
 		 444 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950685  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  23.79 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  26.94 
 
 		 1065 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  26.4 
 
 		 1006 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  26.94 
 
 		 1065 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  27.48 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  25 
 
 		 1065 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  26.98 
 
 		 1065 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4599  cytochrome P450  25.25 
 
 		 445 aa  48.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2497  cytochrome P450  29.14 
 
 		 398 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000177201  hitchhiker  0.00356568 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  26.84 
 
 		 1065 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3529  cytochrome P450  29.71 
 
 		 479 aa  47.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  25.45 
 
 		 1065 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  29.29 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  30.28 
 
 		 1065 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3962  cytochrome P450  25.37 
 
 		 486 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  30.28 
 
 		 1065 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  24.18 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  28.81 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  21.41 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3985  cytochrome P450  28.97 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  24.58 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29177  predicted protein  26.62 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0176037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  26.34 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4796  cytochrome P450  28.15 
 
 		 1074 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  25.2 
 
 		 457 aa  45.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  29.46 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  30.28 
 
 		 1065 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  32.61 
 
 		 470 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26422  lutein deficient 1-like protein  24.86 
 
 		 769 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673064  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0056  cytochrome P450  25.81 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  24.02 
 
 		 453 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58031  Cytochrome P450 52A13 (Alkane hydroxylase 2) (Alkane-inducible p450alk 2) (DH-ALK2)  30.37 
 
 		 516 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.413796  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09384  cytochrome P450, putative (Eurofung)  29.61 
 
 		 512 aa  44.7  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284157  normal  0.464861 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0268  cytochrome P450  25.71 
 
 		 1059 aa  44.7  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1222  cytochrome P450  29.94 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.310345 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1820  cytochrome P450  24.11 
 
 		 1075 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0711  cytochrome P450  25 
 
 		 459 aa  44.3  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  28.86 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32745  predicted protein  23.53 
 
 		 573 aa  43.9  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.040701  normal  0.08964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  25.26 
 
 		 458 aa  43.9  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11423  cytochrome P450 132 cyp132  30 
 
 		 461 aa  43.9  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000352831  normal  0.140869 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6803  cytochrome P450  24.81 
 
 		 1063 aa  43.5  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.670423 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43467  predicted protein  29.37 
 
 		 488 aa  43.1  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>