More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43467 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43466  predicted protein  68.87 
 
 
487 aa  721    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43467  predicted protein  100 
 
 
488 aa  1012    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1807  cytochrome P450  27.59 
 
 
458 aa  116  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0665551  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0451  cytochrome P450  23.91 
 
 
454 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.360422  normal  0.928248 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1417  cytochrome P450  26.98 
 
 
439 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5257  cytochrome P450  27.03 
 
 
446 aa  107  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5133  cytochrome P450  28.03 
 
 
457 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.266361  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1531  cytochrome P450  28.34 
 
 
471 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5081  cytochrome P450  26.76 
 
 
447 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3754  cytochrome P450  25.37 
 
 
429 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.782699  hitchhiker  0.00441352 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  25.91 
 
 
599 aa  99.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2727  cytochrome P450  24.46 
 
 
469 aa  98.2  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1330  cytochrome P450  27.81 
 
 
471 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.514675 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42499  predicted protein  25.21 
 
 
395 aa  97.1  7e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.439591  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6421  cytochrome P450  25.41 
 
 
1055 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.018533 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0326  cytochrome P450  24.56 
 
 
441 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.301346  normal  0.0106447 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2602  cytochrome P450  24.71 
 
 
445 aa  94.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.939146  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2227  cytochrome P450  24.29 
 
 
454 aa  94.4  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0479  cytochrome P450  25.89 
 
 
484 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26422  lutein deficient 1-like protein  23.38 
 
 
769 aa  93.2  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.673064  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07818  Probable sterigmatocystin biosynthesis P450 monooxygenase stcF (EC 1.14.-.-)(Cytochrome P450 60A2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q12609]  26.27 
 
 
483 aa  91.7  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.135585 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4880  cytochrome P450  25.32 
 
 
464 aa  92.4  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1410  cytochrome P450 family protein  24.57 
 
 
453 aa  92.4  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.534609  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0777  cytochrome P450  22.97 
 
 
466 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1598  cytochrome P450 family protein  24.57 
 
 
453 aa  92.4  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.451985  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1744  cytochrome P450 family protein  25.06 
 
 
453 aa  92  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2602  cytochrome P450  26.46 
 
 
1096 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000391794  hitchhiker  0.00294815 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0514  cytochrome P450  26.54 
 
 
463 aa  91.7  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.234733 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2272  cytochrome P450  27.44 
 
 
453 aa  90.5  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4177  cytochrome P450  25.57 
 
 
459 aa  90.1  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00497532  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0322  cytochrome P450 family protein  23.33 
 
 
457 aa  90.1  8e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6996  cytochrome P450 family protein  27.7 
 
 
482 aa  90.1  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00633728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0609  cytochrome P450  25.07 
 
 
468 aa  90.1  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.484343  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0140  cytochrome P450  26.3 
 
 
464 aa  89.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07808  Probable sterigmatocystin biosynthesis P450 monooxygenase stcS (EC 1.14.-.-)(Cytochrome P450 59) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00714]  25.45 
 
 
488 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.13287  normal  0.554586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0268  cytochrome P450  25.68 
 
 
1059 aa  89  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2585  cytochrome P450  26.79 
 
 
459 aa  88.2  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539084  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0744  cytochrome P450  25.19 
 
 
452 aa  88.2  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.491653  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0711  cytochrome P450  24.74 
 
 
459 aa  87.8  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498089  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09007  cytochrome P450, putative (Eurofung)  28.44 
 
 
531 aa  87.4  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00471163  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3072  cytochrome P450  24.51 
 
 
437 aa  87.4  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341667  normal  0.412442 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2167  cytochrome P450  23.74 
 
 
448 aa  87.4  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0823  cytochrome P450  25.62 
 
 
450 aa  87.4  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.141729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1981  cytochrome P450  24.2 
 
 
468 aa  87  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0150704  normal  0.856547 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2921  NADPH-cytochrome P450 reductase  25.21 
 
 
1065 aa  87  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2890  cytochrome P450  23.93 
 
 
466 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357507  normal  0.363908 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2981  NADPH-cytochrome P450 reductase  24.93 
 
 
1065 aa  87  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.313998  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10028  cytochrome P450, putative (Eurofung)  23.21 
 
 
497 aa  86.7  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.908419 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2663  cytochrome P450  23.93 
 
 
466 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2785  cytochrome P450  24.19 
 
 
467 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.438082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1303  cytochrome P450  24.56 
 
 
432 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191796  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4313  cytochrome P450  24.21 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29177  predicted protein  20.91 
 
 
563 aa  85.1  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0176037  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6661  cytochrome P450  25.52 
 
 
463 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181447  decreased coverage  0.0065391 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2936  cytochrome P450  24.93 
 
 
1065 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.807105  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4522  cytochrome P450  25.57 
 
 
462 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0554  cytochrome P450  26.29 
 
 
452 aa  84  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2993  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  24.8 
 
 
1065 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3221  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  24.8 
 
 
1065 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3250  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  24.65 
 
 
1065 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.95935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16780  hypothetical protein  27.61 
 
 
425 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1460  hypothetical protein  34.76 
 
 
425 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6371  cytochrome P450  26.14 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407318  normal  0.219064 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18007  predicted protein  23.06 
 
 
560 aa  82  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00198856  normal  0.151799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0082  cytochrome P450  26.59 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3985  cytochrome P450  24.24 
 
 
466 aa  82.4  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4464  cytochrome P450  24.86 
 
 
489 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0696  cytochrome P450  24.93 
 
 
470 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3268  cytochrome P450  24.18 
 
 
466 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4102  cytochrome P450  25.95 
 
 
452 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.117897  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3229  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  24.37 
 
 
1065 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3868  putative cytochrome P450  34.29 
 
 
473 aa  81.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3382  putative cytochrome  24.93 
 
 
487 aa  81.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1367  cytochrome P450  22.9 
 
 
455 aa  80.9  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2016  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  24.36 
 
 
1065 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4212  cytochrome P450  26.49 
 
 
473 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.610601 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3239  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  24.37 
 
 
1065 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3231  bifunctional P-450:NADPH-P450 reductase 1  24.79 
 
 
1006 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1255  cytochrome P450  24.72 
 
 
445 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5157  cytochrome P450  25.42 
 
 
474 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0481875  hitchhiker  0.00610054 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0005  cytochrome P450  33.33 
 
 
433 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00156979  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0687  cytochrome P450  25.64 
 
 
462 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3260  cytochrome P450 family protein  25.14 
 
 
1373 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08338  cytochrome P450, putative (Eurofung)  29.38 
 
 
565 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.216757  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1482  cytochrome P450  23.7 
 
 
484 aa  78.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_11142  cytochrome P450, putative (Eurofung)  28.64 
 
 
549 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3146  cytochrome P450 family protein  25.14 
 
 
1373 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0290  cytochrome P450  32.4 
 
 
431 aa  79.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132315  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1094  cytochrome P450  23.16 
 
 
464 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00217839 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1475  cytochrome P450 family protein  24.58 
 
 
1373 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0116  cytochrome P450  25.43 
 
 
462 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4009  cytochrome P450  23.54 
 
 
462 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0741551  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1394  cytochrome P450-related protein  24.58 
 
 
1373 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1115  cytochrome P450-related protein  24.58 
 
 
1373 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2088  cytochrome P450-related protein  24.58 
 
 
1373 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2347  cytochrome P450-related protein  24.58 
 
 
1380 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2612  cytochrome P450  24.38 
 
 
1075 aa  77.8  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00689158  normal  0.012939 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4559  cytochrome P450  31.79 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2379  cytochrome P450-related protein  24.58 
 
 
1373 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.276948  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3634  cytochrome P450  22 
 
 
462 aa  77.8  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>