22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4486 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4486  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 116 aa  227  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4197  transcriptional regulator, MarR family  96.55 
 
 		 116 aa  197  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0296  hypothetical protein  80.36 
 
 		 116 aa  179  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128484  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3360  MarR family transcriptional regulator  80.7 
 
 		 114 aa  167  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2180  transcriptional regulator, putative  69.83 
 
 		 116 aa  153  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.846727  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2092  putative transcriptional regulator  68.97 
 
 		 116 aa  152  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.696757  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0731  MarR family transcriptional regulator  67.24 
 
 		 116 aa  150  8e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3952  MarR family transcriptional regulator  60.34 
 
 		 116 aa  134  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0139  MarR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 117 aa  124  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0243  MarR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0251  transcriptional regulator, MarR family  44.34 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.493522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0097  MarR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427273  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0418  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000420026  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0429  MarR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 163 aa  47  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 224 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0931  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 324 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>