122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0294 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0294  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  100 
 
 		 274 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.383352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0265  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  97.08 
 
 		 274 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2531  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  63.6 
 
 		 283 aa  350  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3967  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  52.01 
 
 		 281 aa  293  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0622201  normal  0.0127829 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3078  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  51.66 
 
 		 280 aa  279  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39201  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3609  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  50 
 
 		 280 aa  275  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5160  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  50.56 
 
 		 280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0369  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  49.26 
 
 		 283 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171852  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1193  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  49.63 
 
 		 278 aa  261  8e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.233071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1960  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  47.21 
 
 		 280 aa  241  7.999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0102816 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0962  Fructose-bisphosphate aldolase  31.02 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188927  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0237  fructose-bisphosphate aldolase  30.51 
 
 		 271 aa  108  7.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.239509 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1654  fructose-bisphosphate aldolase  29.09 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000168998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1287  fructose-bisphosphate aldolase  29.93 
 
 		 270 aa  99  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.673267 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1178  fructose-bisphosphate aldolase  26.74 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.298775  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0316  fructose-bisphosphate aldolase  28.78 
 
 		 271 aa  95.9  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1648  fructose-bisphosphate aldolase  28.26 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00227658  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1274  fructose-bisphosphate aldolase  26.74 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2815  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  25.27 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0837  fructose-bisphosphate aldolase  28.52 
 
 		 258 aa  89.4  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0853  predicted phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  25.74 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2456  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  29.41 
 
 		 279 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000207717  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2001  fructose-bisphosphate aldolase  29.56 
 
 		 285 aa  87  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183812  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2807  fructose-bisphosphate aldolase  28.78 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0103202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0753  fructose-bisphosphate aldolase  27.51 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00617024 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0617  fructose-bisphosphate aldolase  28.57 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1302  fructose-bisphosphate aldolase  28.26 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.295464  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1312  fructose-bisphosphate aldolase  27.31 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1345  fructose-bisphosphate aldolase  30.5 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10149  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1078  fructose-bisphosphate aldolase  29.25 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1506  fructose-bisphosphate aldolase  28.52 
 
 		 272 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276432  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0201  fructose-bisphosphate aldolase  29.03 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3489  fructose-bisphosphate aldolase  27.9 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0890  fructose-bisphosphate aldolase  28.99 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0399  aldolase  28.2 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3187  fructose-bisphosphate aldolase  27.99 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.171061  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1952  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30.51 
 
 		 270 aa  79  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1802  aldolase  27.88 
 
 		 293 aa  79  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0338  fructose-bisphosphate aldolase  28.26 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1710  fructose-bisphosphate aldolase  28.32 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.547035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1586  fructose-bisphosphate aldolase  24.73 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0116446  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0076  aldolase  28.47 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1197  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro- 3-deoxyheptonate aldolase  28.89 
 
 		 295 aa  75.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.352827 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2610  fructose-bisphosphate aldolase  27.21 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0721  fructose-bisphosphate aldolase  28.52 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.239684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0920  fructose-bisphosphate aldolase  26.2 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0917  fructose-bisphosphate aldolase  24.72 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1655  aldolase  26.77 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3036  fructose-bisphosphate aldolase  25.82 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152041 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1599  aldolase  26.77 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1717  aldolase  26.77 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2141  aldolase  26.77 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01474  hypothetical protein  26.77 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0474  fructose-bisphosphate aldolase  27.47 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2008  aldolase  26.84 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.283107 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01485  hypothetical protein  26.77 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1277  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30.15 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.399616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2413  aldolase  28.09 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3525  aldolase  28.73 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0862  aldolase  28.73 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3654  aldolase  28.73 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2129  Fructose-bisphosphate aldolase  26.77 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.635781  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0055  aldolase  25.35 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.471008  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0532  fructose-bisphosphate aldolase  25.19 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1558  fructose-bisphosphate aldolase  26.81 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0553  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  23.99 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.633374 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4407  aldolase  27.68 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4409  aldolase  27.68 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.365152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4294  aldolase  27.68 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.78019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4324  aldolase  27.68 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4477  aldolase  27.68 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.959953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1897  aldolase  26.59 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.160076  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2130  aldolase  26.02 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2464  aldolase  25.47 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.548218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1036  fructose-bisphosphate aldolase  35.56 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0462563  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2259  aldolase  26.77 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0573247 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0600  fructose-bisphosphate aldolase  24.64 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0194744  normal  0.0293794 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2611  fructose-bisphosphate aldolase  36.17 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.870869  normal  0.699 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2720  aldolase  26.77 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2700  aldolase  26.77 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161141  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0411  aldolase  25.09 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0114  fructose-bisphosphate aldolase  24.72 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2477  fructose-bisphosphate aldolase  24.55 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0102873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3532  aldolase  25.37 
 
 		 295 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.18059 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2776  aldolase  26.39 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.21432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2983  aldolase  26.77 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2771  aldolase  26.77 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2982  aldolase  26.77 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3085  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  26.69 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.997362  unclonable  0.00000947187 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1303  fructose-bisphosphate aldolase  27.66 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.852372  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1557  fructose-bisphosphate aldolase  27.54 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2335  aldolase  25.83 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3021  aldolase  26.77 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2979  aldolase  26.77 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000139976 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2373  deoxyribose-phosphate aldolase/phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  25.18 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2002  aldolase  26.47 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0256357  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1971  aldolase  26.82 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132065  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1751  fructose-bisphosphate aldolase  24 
 
 		 265 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0194  aldolase  27.2 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0914  fructose-bisphosphate aldolase  26.84 
 
 		 267 aa  64.3  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000266803  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>