41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5267 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5267  protein of unknown function DUF1236  100 
 
 
95 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1291  protein of unknown function DUF1236  53.06 
 
 
104 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349745  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1202  protein of unknown function DUF1236  51.92 
 
 
104 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.195228  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4377  hypothetical protein  63.22 
 
 
94 aa  99.4  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1430  hypothetical protein  47.06 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.731285  hitchhiker  0.000462383 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2728  hypothetical protein  46.27 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1500  protein of unknown function DUF1236  49.28 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.447894  normal  0.683768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1431  hypothetical protein  37.23 
 
 
135 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191025  hitchhiker  0.0000578227 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4035  hypothetical protein  34.44 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662929  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3125  hypothetical protein  44.3 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.936872  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3677  hypothetical protein  43.48 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.566857  hitchhiker  0.00495452 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3254  protein of unknown function DUF1236  44.93 
 
 
131 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.304143  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3004  protein of unknown function DUF1236  43.48 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3342  hypothetical protein  42.25 
 
 
225 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.799557  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0136  hypothetical protein  44.12 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1396  protein of unknown function DUF1236  47.83 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.955591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4727  protein of unknown function DUF1236  47.83 
 
 
132 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6932  protein of unknown function DUF1236  44.93 
 
 
131 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.019322  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0791  protein of unknown function DUF1236  42.03 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2242  hypothetical protein  38.16 
 
 
210 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700744  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0356  hypothetical protein  39.13 
 
 
122 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3557  hypothetical protein  39.13 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826917  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1254  hypothetical protein  42.71 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0464649  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1616  hypothetical protein  42.42 
 
 
148 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.735089  hitchhiker  0.000199985 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0713  hypothetical protein  41.79 
 
 
139 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0569  protein of unknown function DUF1236  38.57 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3015  protein of unknown function DUF1236  36.84 
 
 
205 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2752  protein of unknown function DUF1236  35.53 
 
 
205 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.348159  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1280  hypothetical protein  37.14 
 
 
139 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0200201  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3862  hypothetical protein  38.71 
 
 
220 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0234  hypothetical protein  37.31 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.301588  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3380  hypothetical protein  32.95 
 
 
221 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.374175  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3026  hypothetical protein  31.82 
 
 
221 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1032  hypothetical protein  39.13 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0259413 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1806  protein of unknown function DUF1236  37.31 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.809056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7467  protein of unknown function DUF1236  31.96 
 
 
111 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.311345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2358  hypothetical protein  34.78 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.318896  normal  0.1272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4345  hypothetical protein  34.85 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0703177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0372  hypothetical protein  31.34 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4429  hypothetical protein  36.23 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5270  hypothetical protein  35.29 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.100526  normal  0.118454 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>