More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5133 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7600  proline dipeptidase  91.14 
 
 
474 aa  921    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5371  peptidase M24  88.4 
 
 
474 aa  894    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.56285 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5133  peptidase M24  100 
 
 
474 aa  988    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4421  peptidase M24  27.83 
 
 
399 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2626  hydrolase/M24 family peptidase  26.89 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000124819  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4527  hydrolase/M24 family peptidase  26.89 
 
 
439 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000187713  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0525  peptidase M24  24.17 
 
 
398 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1043  peptidase M24  23.59 
 
 
449 aa  67.4  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.127087  normal  0.0673089 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1771  peptidase M24  27.17 
 
 
367 aa  65.1  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0652129  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3901  peptidase M24  24.67 
 
 
429 aa  63.2  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337713  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3289  peptidase M24  22.86 
 
 
367 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.065637  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1358  peptidase M24  22.57 
 
 
347 aa  62  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0476908  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2506  M24 family metallopeptidase  21.31 
 
 
358 aa  60.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4742  X-Pro dipeptidase  20.23 
 
 
365 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.928976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4355  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  20.52 
 
 
365 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1764  peptidase M24  22.57 
 
 
351 aa  60.8  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1798  peptidase M24  22.57 
 
 
351 aa  60.8  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3760  creatinase  22.2 
 
 
392 aa  60.5  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.180567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4748  proline dipeptidase  20.23 
 
 
365 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4051  peptidase M24  21.41 
 
 
353 aa  60.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4730  X-Pro dipeptidase  20.23 
 
 
365 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2768  peptidase M24  25.98 
 
 
408 aa  60.1  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2761  peptidase M24  26.27 
 
 
383 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.809431  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1308  putative peptidase  21.92 
 
 
406 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.469292  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4271  proline dipeptidase  21.73 
 
 
353 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2880  peptidase M24  22.92 
 
 
424 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4508  proline dipeptidase  20.23 
 
 
365 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4344  Xaa-Pro dipeptidase (proline dipeptidase)  20.23 
 
 
365 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3951  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  21.41 
 
 
353 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00282404  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0549  peptidase M24  22.4 
 
 
369 aa  59.7  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0221  peptidase M24  21.79 
 
 
414 aa  59.7  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4861  proline dipeptidase  20.23 
 
 
365 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1418  putative peptidase  21.92 
 
 
406 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2820  M24 family metallopeptidase  21.31 
 
 
358 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4308  X-Pro dipeptidase  21.41 
 
 
353 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4443  peptidase M24  19.65 
 
 
365 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1268  putative X-Pro dipeptidase  21.83 
 
 
356 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2201  peptidase M24  21.7 
 
 
432 aa  58.9  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3295  peptidase M24  20.52 
 
 
365 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.745544  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4328  X-Pro dipeptidase  21.41 
 
 
353 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1643  Xaa-Pro dipeptidase  21.97 
 
 
434 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0514  X-Pro dipeptidase  19.94 
 
 
365 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2456  creatinase  23.35 
 
 
425 aa  58.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3727  proline dipeptidase  20.64 
 
 
356 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4102  proline dipeptidase  21.41 
 
 
353 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0184718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1824  peptidase M24  23.41 
 
 
356 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000132868  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4014  proline dipeptidase  20.64 
 
 
356 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.832696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4422  proline dipeptidase  21.41 
 
 
353 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3890  putative X-Pro dipeptidase  20.64 
 
 
356 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000130814 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4218  X-Pro dipeptidase  21.41 
 
 
353 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1480  M24 family peptidase  29.71 
 
 
383 aa  57.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0128687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4723  X-Pro dipeptidase  19.94 
 
 
365 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1531  M24 family peptidase  29.71 
 
 
383 aa  57.4  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2784  peptidase M24  23.47 
 
 
429 aa  57  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.540448  normal  0.681898 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3940  proline dipeptidase, Xaa-Pro dipeptidase  21.09 
 
 
353 aa  56.6  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1271  proline dipeptidase  21.61 
 
 
351 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1636  creatinase  28 
 
 
383 aa  56.2  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  23.42 
 
 
251 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5287  peptidase M24  22.45 
 
 
426 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.912163  normal  0.238252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2374  peptidase M24  26.62 
 
 
376 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.429708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0926  X-Pro dipeptidase  21.09 
 
 
353 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2021  xaa-pro dipeptidase  21.54 
 
 
355 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.812333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3635  proline dipeptidase  20.64 
 
 
356 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0666  peptidase M24  22.22 
 
 
395 aa  55.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3699  peptidase M24  20.76 
 
 
356 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.602043  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3031  peptidase M24  26.24 
 
 
405 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2340  peptidase M24  21.97 
 
 
353 aa  55.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3617  proline dipeptidase  20 
 
 
356 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.338254  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1906  peptidase M24  30.38 
 
 
384 aa  55.1  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3921  proline dipeptidase, putative  21.13 
 
 
356 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0663  peptidase M24  22.03 
 
 
348 aa  54.7  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.782539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3924  putative X-Pro dipeptidase  20.19 
 
 
356 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4409  peptidase M24  25.23 
 
 
419 aa  54.3  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.537695 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3975  putative X-Pro dipeptidase  20 
 
 
356 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2035  peptidase M24  25.31 
 
 
347 aa  54.3  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.232424  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  27.14 
 
 
441 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2365  peptidase M24  26.95 
 
 
400 aa  53.9  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2124  peptidase M24  26.92 
 
 
403 aa  53.5  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6284  creatinase  22.67 
 
 
403 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.37554  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2892  peptidase M24  20.77 
 
 
353 aa  53.1  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0628939  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28590  putative methionine aminopeptidase  27.33 
 
 
260 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000104352 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4843  peptidase M24  22.1 
 
 
426 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0444471 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3167  peptidase M24  22.56 
 
 
422 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6059  peptidase M24  23.62 
 
 
379 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11000  Xaa-Pro aminopeptidase  21.97 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.181241  normal  0.0111766 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  23.79 
 
 
439 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  28.48 
 
 
437 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  28.48 
 
 
437 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  26.63 
 
 
414 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1800  peptidase M24  24.04 
 
 
400 aa  52.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.04954  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2255  peptidase M24  29.06 
 
 
383 aa  52.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2323  peptidase M24  20.98 
 
 
384 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00153369  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  28.57 
 
 
251 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0982  peptidase M24  23.4 
 
 
357 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000249313  normal  0.0334908 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  28.48 
 
 
437 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  27.15 
 
 
255 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3457  peptidase M24  24.31 
 
 
430 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3728  creatinase  22.62 
 
 
418 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04710  probable X-pro aminopeptidase  25.76 
 
 
430 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0578  methionine aminopeptidase, type I  24.83 
 
 
273 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>