More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04710 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0688  peptidase M24  76.69 
 
 
430 aa  715    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142397  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04710  probable X-pro aminopeptidase  100 
 
 
430 aa  895    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3457  peptidase M24  56.84 
 
 
430 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2876  peptidase M24  56.05 
 
 
430 aa  524  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0874223  decreased coverage  0.00406602 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1524  hypothetical protein  56.8 
 
 
421 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.518831 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3034  aminopeptidase P  50.81 
 
 
428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6929  peptidase M24  45.69 
 
 
430 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430082  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1106  peptidase M24  43.46 
 
 
427 aa  387  1e-106  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  33.71 
 
 
445 aa  261  1e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2806  peptidase M24  33.88 
 
 
416 aa  260  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.275182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  33.64 
 
 
441 aa  253  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  33.49 
 
 
441 aa  251  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  33.72 
 
 
437 aa  251  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  33.18 
 
 
441 aa  250  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  33.49 
 
 
441 aa  250  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  32.96 
 
 
437 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  33.33 
 
 
441 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  33.33 
 
 
441 aa  248  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  33.33 
 
 
441 aa  247  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  33.33 
 
 
441 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  33.33 
 
 
441 aa  247  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  32.87 
 
 
438 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  32.87 
 
 
438 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  33.11 
 
 
441 aa  247  4e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  33.33 
 
 
441 aa  247  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  32.87 
 
 
438 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  32.87 
 
 
438 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  32.87 
 
 
438 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6000  peptidase M24  32.05 
 
 
441 aa  246  8e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2854  xaa-pro aminopeptidase  34.58 
 
 
414 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2539  xaa-pro aminopeptidase  34.58 
 
 
414 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  32.05 
 
 
436 aa  240  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2399  peptidase M24  33.71 
 
 
435 aa  240  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  33.63 
 
 
436 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  34.08 
 
 
439 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  31.24 
 
 
443 aa  236  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  31.42 
 
 
461 aa  236  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  31.63 
 
 
436 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  34.08 
 
 
439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  33.03 
 
 
444 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  32.8 
 
 
444 aa  235  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  31.65 
 
 
439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  30.75 
 
 
436 aa  233  5e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  33.03 
 
 
442 aa  233  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  32.72 
 
 
444 aa  232  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  33.26 
 
 
441 aa  232  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  33.03 
 
 
439 aa  232  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  31.4 
 
 
454 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  32.34 
 
 
444 aa  230  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  33.26 
 
 
439 aa  229  5e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  32.64 
 
 
437 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  32.64 
 
 
437 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  32.64 
 
 
437 aa  229  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  32.03 
 
 
444 aa  229  9e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  31.89 
 
 
444 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  31.37 
 
 
458 aa  228  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  32.05 
 
 
444 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  31.46 
 
 
444 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2008  Xaa-Pro aminopeptidase  31.35 
 
 
427 aa  226  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010826  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  31.66 
 
 
444 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  32.13 
 
 
444 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  31.46 
 
 
444 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  31.8 
 
 
437 aa  225  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1982  xaa-pro aminopeptidase, putative  31.25 
 
 
427 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174927  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  30.3 
 
 
443 aa  220  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  31.08 
 
 
439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  32.39 
 
 
499 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0075  aminopeptidase P  32.62 
 
 
437 aa  219  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.819876  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  31.53 
 
 
443 aa  218  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  33.33 
 
 
436 aa  216  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1451  peptidase M24  34.52 
 
 
447 aa  216  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  30.59 
 
 
461 aa  216  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  30.37 
 
 
437 aa  215  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  30.15 
 
 
461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3662  aminopeptidase P  34.35 
 
 
432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  30.94 
 
 
462 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.429272 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  30.7 
 
 
459 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0623  aminopeptidase P  30.6 
 
 
468 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.920846  normal  0.361918 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1764  peptidase M24  31.86 
 
 
427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  30.77 
 
 
458 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1577  peptidase M24  31.99 
 
 
455 aa  213  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0492  aminopeptidase P  31.49 
 
 
474 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.476859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  32.19 
 
 
414 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  30.7 
 
 
514 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4336  peptidase M24  32.75 
 
 
389 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  31.93 
 
 
436 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1740  Xaa-Pro aminopeptidase  31.09 
 
 
427 aa  210  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1485  peptidase M24  31.91 
 
 
413 aa  210  3e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  29.25 
 
 
446 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  29.25 
 
 
446 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1712  Xaa-Pro aminopeptidase  31.09 
 
 
426 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2176  aminopeptidase P  32.17 
 
 
426 aa  210  4e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0588  peptidase M24  30.47 
 
 
464 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  32.27 
 
 
433 aa  209  6e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0614  peptidase M24  30.41 
 
 
464 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.178264 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1763  xaa-pro aminopeptidase  30.54 
 
 
427 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.996986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1936  putative xaa-pro aminopeptidase  30.85 
 
 
427 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03576e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1901  xaa-pro aminopeptidase  30.54 
 
 
427 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.111292  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1906  Xaa-Pro aminopeptidase  32.02 
 
 
427 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0128902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0662  peptidase M24  31.6 
 
 
461 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>