More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3034 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_3034  aminopeptidase P  100 
 
 
428 aa  887    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2876  peptidase M24  54.08 
 
 
430 aa  514  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0874223  decreased coverage  0.00406602 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1524  hypothetical protein  57.66 
 
 
421 aa  499  1e-140  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.518831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3457  peptidase M24  53.36 
 
 
430 aa  484  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04710  probable X-pro aminopeptidase  50.81 
 
 
430 aa  470  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0688  peptidase M24  50.35 
 
 
430 aa  468  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142397  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1106  peptidase M24  46.73 
 
 
427 aa  420  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6929  peptidase M24  44.39 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430082  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2854  xaa-pro aminopeptidase  38.33 
 
 
414 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2539  xaa-pro aminopeptidase  38.33 
 
 
414 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  35.63 
 
 
441 aa  276  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2806  peptidase M24  35.15 
 
 
416 aa  274  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.275182  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  34.94 
 
 
441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  33.94 
 
 
445 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  34.56 
 
 
441 aa  261  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  33.03 
 
 
441 aa  261  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  33.26 
 
 
441 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  35.97 
 
 
439 aa  260  3e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  32.88 
 
 
441 aa  260  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  32.88 
 
 
441 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  32.88 
 
 
441 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  32.88 
 
 
441 aa  260  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  32.88 
 
 
441 aa  260  4e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  32.65 
 
 
441 aa  259  6e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  33.03 
 
 
441 aa  258  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  34.18 
 
 
442 aa  256  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2008  Xaa-Pro aminopeptidase  34.04 
 
 
427 aa  256  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010826  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  32.49 
 
 
437 aa  256  7e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  32.03 
 
 
438 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  32.03 
 
 
438 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  32.03 
 
 
438 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  32.03 
 
 
438 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  31.8 
 
 
438 aa  250  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  33.79 
 
 
436 aa  249  9e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  33.03 
 
 
437 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  34.63 
 
 
439 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  33.95 
 
 
443 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  32.56 
 
 
437 aa  246  6.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1485  peptidase M24  35.91 
 
 
413 aa  245  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  32.96 
 
 
444 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  34.17 
 
 
439 aa  243  5e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  34.01 
 
 
444 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  34.55 
 
 
444 aa  243  6e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1982  xaa-pro aminopeptidase, putative  33.17 
 
 
427 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174927  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  34.24 
 
 
444 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  33.56 
 
 
444 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  34.24 
 
 
444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  32.03 
 
 
437 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  32.03 
 
 
437 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1764  peptidase M24  34.32 
 
 
427 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  32.03 
 
 
437 aa  239  8e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  34.85 
 
 
436 aa  239  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  33.64 
 
 
444 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1740  Xaa-Pro aminopeptidase  33.91 
 
 
427 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1712  Xaa-Pro aminopeptidase  33.91 
 
 
426 aa  238  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  32.19 
 
 
443 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  34.01 
 
 
444 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1906  Xaa-Pro aminopeptidase  34.99 
 
 
427 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0128902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  33.56 
 
 
444 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  33.18 
 
 
454 aa  236  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  33.33 
 
 
444 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  32.88 
 
 
461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1763  xaa-pro aminopeptidase  33.91 
 
 
427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.996986  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1936  putative xaa-pro aminopeptidase  33.99 
 
 
427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03576e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1901  xaa-pro aminopeptidase  33.91 
 
 
427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.111292  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  32.35 
 
 
436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3437  Xaa-Pro aminopeptidase  34.32 
 
 
427 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.644236  hitchhiker  0.0000000000133541 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  33.33 
 
 
444 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2399  peptidase M24  33.71 
 
 
435 aa  231  1e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  33.26 
 
 
439 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1451  peptidase M24  33.33 
 
 
447 aa  230  3e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  32.21 
 
 
443 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  31.88 
 
 
446 aa  230  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  31.88 
 
 
446 aa  230  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  32.35 
 
 
436 aa  229  6e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  30.31 
 
 
459 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  31.42 
 
 
435 aa  227  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  30.2 
 
 
458 aa  225  9e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  33.87 
 
 
439 aa  225  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  30.43 
 
 
433 aa  224  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1524  aminopeptidase P  31.96 
 
 
430 aa  224  3e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0210879  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  31.16 
 
 
499 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  33.64 
 
 
439 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3287  aminopeptidase P  30.91 
 
 
439 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  30.53 
 
 
458 aa  222  8e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  31.64 
 
 
437 aa  222  9e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  33.58 
 
 
414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  30.48 
 
 
462 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.429272 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3406  peptidase M24  30.91 
 
 
439 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  32.65 
 
 
449 aa  220  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3362  peptidase M24  30.91 
 
 
439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0075  aminopeptidase P  33.33 
 
 
437 aa  220  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.819876  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  30.52 
 
 
440 aa  219  5e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3662  aminopeptidase P  30.48 
 
 
432 aa  219  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2689  peptidase M24  29.17 
 
 
461 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1254  Xaa-Pro aminopeptidase  28.87 
 
 
611 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  29.24 
 
 
514 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  29.13 
 
 
454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  28.88 
 
 
461 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3399  aminopeptidase P  29.1 
 
 
642 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>