More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6929 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6929  peptidase M24  100 
 
 
430 aa  894    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430082  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3457  peptidase M24  50.93 
 
 
430 aa  461  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2876  peptidase M24  48.36 
 
 
430 aa  441  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0874223  decreased coverage  0.00406602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0688  peptidase M24  45.71 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142397  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04710  probable X-pro aminopeptidase  45.69 
 
 
430 aa  414  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1524  hypothetical protein  47.73 
 
 
421 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.518831 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3034  aminopeptidase P  44.39 
 
 
428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1106  peptidase M24  39.77 
 
 
427 aa  341  1e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2806  peptidase M24  33.65 
 
 
416 aa  230  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.275182  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  32.66 
 
 
441 aa  228  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  32.21 
 
 
441 aa  227  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2008  Xaa-Pro aminopeptidase  31.06 
 
 
427 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010826  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  32.13 
 
 
437 aa  225  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2854  xaa-pro aminopeptidase  32.24 
 
 
414 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2539  xaa-pro aminopeptidase  32.24 
 
 
414 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  32.74 
 
 
461 aa  222  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1982  xaa-pro aminopeptidase, putative  30.99 
 
 
427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174927  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  32.96 
 
 
437 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  32.96 
 
 
437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  31.11 
 
 
439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  32.73 
 
 
437 aa  216  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  31.77 
 
 
438 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  31.77 
 
 
438 aa  216  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  31.54 
 
 
438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  31.77 
 
 
438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  31.77 
 
 
438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  31.63 
 
 
441 aa  213  5.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  31.63 
 
 
441 aa  212  9e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  31.63 
 
 
441 aa  212  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  31.63 
 
 
441 aa  212  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  31.63 
 
 
441 aa  212  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  31.63 
 
 
441 aa  212  9e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  31.63 
 
 
441 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  31.67 
 
 
441 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  31.67 
 
 
441 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  31 
 
 
437 aa  210  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  29.79 
 
 
445 aa  209  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  31.76 
 
 
437 aa  209  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1712  Xaa-Pro aminopeptidase  30.75 
 
 
426 aa  207  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1740  Xaa-Pro aminopeptidase  30.83 
 
 
427 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1763  xaa-pro aminopeptidase  30.7 
 
 
427 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.996986  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1901  xaa-pro aminopeptidase  30.7 
 
 
427 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.111292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1936  putative xaa-pro aminopeptidase  30.7 
 
 
427 aa  206  9e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03576e-43 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  30.47 
 
 
442 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1764  peptidase M24  31.08 
 
 
427 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  29.78 
 
 
439 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3437  Xaa-Pro aminopeptidase  31.39 
 
 
427 aa  203  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.644236  hitchhiker  0.0000000000133541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  29.84 
 
 
439 aa  202  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0152  aminopeptidase P  30.7 
 
 
441 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  30.92 
 
 
439 aa  202  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  29.13 
 
 
454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1906  Xaa-Pro aminopeptidase  31.14 
 
 
427 aa  201  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0128902  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  29.93 
 
 
436 aa  199  6e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  31.59 
 
 
458 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  30.63 
 
 
441 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  29.89 
 
 
436 aa  196  7e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  29.71 
 
 
436 aa  196  7e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  29.73 
 
 
439 aa  195  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  29.9 
 
 
414 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2399  peptidase M24  29.57 
 
 
435 aa  193  5e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  30.39 
 
 
454 aa  192  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0385  peptidase M24  29.33 
 
 
459 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2540  Xaa-Pro aminopeptidase  28.03 
 
 
481 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.804576  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  30.04 
 
 
436 aa  191  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0274  Xaa-Pro aminopeptidase  28.03 
 
 
481 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1135  Xaa-Pro aminopeptidase  28.03 
 
 
481 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2360  Xaa-Pro aminopeptidase  28.03 
 
 
468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0509  XAA-Pro aminopeptidase  29.72 
 
 
458 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.13437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0400  peptidase M24  29.3 
 
 
462 aa  190  5e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.429272 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0432  aminopeptidase P  29.17 
 
 
465 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.386273  normal  0.154723 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3394  xaa-pro aminopeptidase  27.89 
 
 
469 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  29.85 
 
 
446 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  29.85 
 
 
446 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  29.55 
 
 
443 aa  189  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3399  aminopeptidase P  27.8 
 
 
642 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612294  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  29.38 
 
 
443 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  29.5 
 
 
446 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  29.2 
 
 
444 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3781  aminopeptidase P  27.95 
 
 
461 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2549  peptidase M24  28.32 
 
 
514 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  29.95 
 
 
437 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3358  xaa-pro aminopeptidase  27.67 
 
 
469 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  29.84 
 
 
444 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1254  Xaa-Pro aminopeptidase  27.9 
 
 
611 aa  186  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1577  peptidase M24  30.79 
 
 
455 aa  186  6e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  28.97 
 
 
444 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1524  aminopeptidase P  29.03 
 
 
430 aa  186  9e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0210879  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1451  peptidase M24  29.31 
 
 
447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.582435  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0662  peptidase M24  27.35 
 
 
461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  30.68 
 
 
433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  27.11 
 
 
443 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0128  peptidase M24  28.57 
 
 
440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  27.84 
 
 
499 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.106603 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  27.05 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0075  aminopeptidase P  29.81 
 
 
437 aa  184  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.819876  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0211  peptidase M24  27.35 
 
 
461 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0695  peptidase M24  27.35 
 
 
461 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6000  peptidase M24  27.83 
 
 
441 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  28.97 
 
 
444 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  28.41 
 
 
444 aa  183  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>