62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5058 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0674  Integrase catalytic region  92.48 
 
 		 930 bp  811    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4981  Integrase catalytic region  92.48 
 
 		 930 bp  811    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5058    100 
 
 		 585 bp  1160    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.527487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4559  Integrase catalytic region  92.48 
 
 		 930 bp  811    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.326011 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4891  Integrase catalytic region  90.43 
 
 		 930 bp  716    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0382576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2860  integrase catalytic region  87.86 
 
 		 930 bp  597  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6506  integrase catalytic region  87.86 
 
 		 930 bp  597  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5713    87.69 
 
 		 1992 bp  589  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5714  integrase catalytic region  87.69 
 
 		 930 bp  589  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6240  integrase catalytic region  87.52 
 
 		 1128 bp  565  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4607  integrase catalytic region  86.25 
 
 		 930 bp  519  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5765    91.89 
 
 		 411 bp  496  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00000020219  normal  0.53939 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4471  integrase catalytic region  86.56 
 
 		 708 bp  355  8.999999999999999e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154485  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5317  integrase catalytic region  80 
 
 		 921 bp  143  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0707814  normal  0.862383 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3888    80.16 
 
 		 955 bp  137  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3869    80.16 
 
 		 982 bp  137  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1212    83.52 
 
 		 555 bp  119  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.129542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3736  integrase catalytic region  85.28 
 
 		 873 bp  117  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.402881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  81.04 
 
 		 1182 bp  109  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7887    86.18 
 
 		 637 bp  109  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0381  integrase catalytic subunit  89.36 
 
 		 570 bp  107  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  95.24 
 
 		 894 bp  67.9  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2693    89.66 
 
 		 268 bp  67.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.113528  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5450    85.37 
 
 		 789 bp  67.9  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.564298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1608  integrase catalytic region  82.69 
 
 		 873 bp  63.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0124752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3472  integrase catalytic region  82.69 
 
 		 873 bp  63.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0238059  normal  0.994317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1064  integrase catalytic region  82.69 
 
 		 873 bp  63.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  86.76 
 
 		 855 bp  63.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  83.7 
 
 		 810 bp  63.9  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0221  integrase catalytic region  82.69 
 
 		 873 bp  63.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0898 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0926  integrase catalytic region  83.7 
 
 		 810 bp  63.9  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2509  integrase  83.7 
 
 		 696 bp  63.9  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0263754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  83.7 
 
 		 810 bp  63.9  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  83.7 
 
 		 810 bp  63.9  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2968  integrase catalytic subunit  85.92 
 
 		 795 bp  61.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  87.1 
 
 		 924 bp  60  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3223  integrase protein  83.95 
 
 		 714 bp  58  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2624  integrase protein  83.95 
 
 		 714 bp  58  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.947279  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3526  integrase protein  83.95 
 
 		 714 bp  58  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3728  integrase protein  83.95 
 
 		 714 bp  58  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1042  hypothetical protein  85.51 
 
 		 546 bp  58  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  0.577447 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1092    86.15 
 
 		 860 bp  58  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  84 
 
 		 1118 bp  54  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3070    90.7 
 
 		 691 bp  54  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.817214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  83.54 
 
 		 939 bp  54  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  84 
 
 		 1118 bp  54  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  84 
 
 		 1118 bp  54  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  84 
 
 		 1118 bp  54  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  84 
 
 		 1118 bp  54  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  84 
 
 		 1118 bp  54  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  84 
 
 		 1118 bp  54  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1257    84 
 
 		 2455 bp  54  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.697608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  84 
 
 		 1118 bp  54  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  84 
 
 		 1118 bp  54  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  84 
 
 		 1118 bp  54  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  92.11 
 
 		 822 bp  52  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  92.11 
 
 		 822 bp  52  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  92.11 
 
 		 822 bp  52  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  92.11 
 
 		 822 bp  52  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  92.11 
 
 		 822 bp  52  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  85.48 
 
 		 930 bp  52  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1166  integrase catalytic region  93.75 
 
 		 672 bp  48.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>