238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2984 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3232  polysaccharide export protein  96.03 
 
 
422 aa  764    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2984  polysaccharide export protein  100 
 
 
403 aa  810    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182191  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0093  polysaccharide export protein  39.95 
 
 
410 aa  295  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3781  polysaccharide export protein  41.73 
 
 
396 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543784  normal  0.42896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  40 
 
 
402 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3057  polysaccharide export protein  41.39 
 
 
440 aa  291  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1028  putative capsule polysaccharide export outer membrane protein  38.93 
 
 
440 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1033  polysaccharide export protein  36.48 
 
 
400 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2463  polysaccharide export protein  36.68 
 
 
390 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7135  polysaccharide export protein  37.44 
 
 
389 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3767  polysaccharide export protein  36.29 
 
 
419 aa  234  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6357  polysaccharide export protein  37.98 
 
 
389 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.168651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3770  polysaccharide export protein  36.94 
 
 
388 aa  232  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2714  polysaccharide export protein  37.97 
 
 
393 aa  232  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1938  polysaccharide export protein  36.48 
 
 
410 aa  227  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231854  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3660  polysaccharide export protein  36.15 
 
 
388 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0950  polysaccharide export protein  36.44 
 
 
394 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3462  polysaccharide export protein  36.94 
 
 
388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0324  polysaccharide export protein  34.92 
 
 
410 aa  220  3e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2535  polysaccharide export protein  36.89 
 
 
417 aa  219  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2758  polysaccharide export protein  36.89 
 
 
390 aa  219  6e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3820  polysaccharide export protein  37.4 
 
 
404 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388057  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1533  polysaccharide export protein  34.1 
 
 
397 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1078  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.68 
 
 
378 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273848  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2307  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.68 
 
 
387 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3301  WcbC  33.68 
 
 
387 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0776528  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2185  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.68 
 
 
387 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3254  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.68 
 
 
387 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3289  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.78 
 
 
373 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0521  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.78 
 
 
373 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21613  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1161  polysaccharide export protein  32.61 
 
 
388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0571636  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1327  WcbC  30.63 
 
 
422 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5948  exopolysaccharide export protein  32.5 
 
 
406 aa  192  9e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0740  polysaccharide export protein  30.77 
 
 
379 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2347  polysaccharide export protein  33.76 
 
 
363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0287  polysaccharide export protein  30.91 
 
 
409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0771  polysaccharide export protein  30.91 
 
 
409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3859  polysaccharide export protein  30.69 
 
 
398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0753  polysaccharide export protein  34.08 
 
 
392 aa  183  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2589  polysaccharide export protein  30.39 
 
 
397 aa  182  9.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2975  capsule polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family  30.39 
 
 
390 aa  182  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0664  polysaccharide export protein  31.33 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0130788  normal  0.0340972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2754  polysaccharide export protein  32.89 
 
 
391 aa  172  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982682  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6038  polysaccharide export protein  31.94 
 
 
380 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  30.49 
 
 
387 aa  164  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0198  polysaccharide export protein  31.98 
 
 
395 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2079  polysaccharide export protein  30.71 
 
 
394 aa  156  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.238275 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  28.88 
 
 
365 aa  156  7e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1486  polysaccharide export protein  28.69 
 
 
408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.721781  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0728  polysaccharide export protein  27.2 
 
 
406 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0592295  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2418  polysaccharide export protein  27.37 
 
 
378 aa  123  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.160125 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0759  putative capsule polysaccharide exporter  27.11 
 
 
378 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3419  polysaccharide export protein  28.48 
 
 
384 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0961152  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0416  polysaccharide export protein  31.66 
 
 
377 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.901304 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2609  polysaccharide export protein  27.76 
 
 
376 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  27.89 
 
 
375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3905  polysaccharide export protein  26.85 
 
 
354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.132595 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2254  putative polysaccharide export protein  27.95 
 
 
385 aa  107  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.732758 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  26.2 
 
 
398 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.58 
 
 
378 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1559  polysaccharide export protein  26.21 
 
 
392 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.053083  normal  0.0507525 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  25.75 
 
 
397 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  24.16 
 
 
393 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  23.22 
 
 
379 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  27.27 
 
 
376 aa  96.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  25.24 
 
 
379 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  25.24 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  25.24 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  25.24 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  25.24 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  25.24 
 
 
386 aa  94.7  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  25.24 
 
 
386 aa  94.7  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  24.92 
 
 
386 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  24.81 
 
 
387 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  24.81 
 
 
392 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  24.81 
 
 
387 aa  93.6  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.71 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  25.42 
 
 
350 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  23.41 
 
 
384 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.31 
 
 
396 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  24.57 
 
 
392 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.31 
 
 
391 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  24.3 
 
 
377 aa  92  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  24.6 
 
 
379 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.31 
 
 
391 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  24.04 
 
 
379 aa  91.3  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  25.96 
 
 
356 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  25.4 
 
 
379 aa  90.1  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  23.57 
 
 
392 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  23.57 
 
 
392 aa  89.7  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.16 
 
 
379 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  24.83 
 
 
390 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  23.21 
 
 
384 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.84 
 
 
351 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.84 
 
 
348 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  24.84 
 
 
348 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.16 
 
 
379 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  23.99 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.99 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.99 
 
 
379 aa  88.2  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>