70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4116 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_4116  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  271  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2232  hypothetical protein  70.4 
 
 		 129 aa  197  6e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2993  hypothetical protein  65.62 
 
 		 128 aa  187  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2981  hypothetical protein  64.34 
 
 		 132 aa  185  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00129224  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2908  hypothetical protein  64.84 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3099  hypothetical protein  64.84 
 
 		 128 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2820  hypothetical protein  64 
 
 		 128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3342  hypothetical protein  61.6 
 
 		 128 aa  174  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000100238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3197  hypothetical protein  61.42 
 
 		 128 aa  173  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000000985474  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3379  hypothetical protein  62.5 
 
 		 129 aa  173  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.216495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4300  hypothetical protein  60.8 
 
 		 128 aa  171  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0294544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2717  hypothetical protein  61.72 
 
 		 129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1669  hypothetical protein  60.63 
 
 		 132 aa  169  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.224721  normal  0.307611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2156  hypothetical protein  59.84 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1761  hypothetical protein  60 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2396  hypothetical protein  60 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.513219  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0668  hypothetical protein  60 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.482175  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0797  hypothetical protein  60 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1112  hypothetical protein  60 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.616888  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1189  hypothetical protein  60 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311283  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1592  hypothetical protein  58.4 
 
 		 129 aa  166  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.809331  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4267  hypothetical protein  59.84 
 
 		 132 aa  166  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0444284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5399  hypothetical protein  56.25 
 
 		 128 aa  165  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378128  normal  0.950065 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3760  hypothetical protein  58.91 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0990528 
 
 
-
 
NC_003296  RS03031  hypothetical protein  60.16 
 
 		 132 aa  164  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.975381  normal  0.0719151 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4234  hypothetical protein  58.91 
 
 		 132 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0988093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3305  hypothetical protein  58.59 
 
 		 136 aa  163  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4008  hypothetical protein  56.49 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240603  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4121  hypothetical protein  56.49 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4016  hypothetical protein  58.27 
 
 		 132 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4351  hypothetical protein  58.27 
 
 		 132 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1203  hypothetical protein  57.48 
 
 		 128 aa  157  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6003  hypothetical protein  58.27 
 
 		 132 aa  156  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.308652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3691  hypothetical protein  53.33 
 
 		 149 aa  153  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal  0.0849061 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3442  hypothetical protein  31.15 
 
 		 114 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1714  hypothetical protein  31.45 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.735817  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2225  protein of unknown function DUF488  33.33 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4793  protein of unknown function DUF488  27.5 
 
 		 115 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0905934 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0416  hypothetical protein  30.83 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318047  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2811  hypothetical protein  34.82 
 
 		 163 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0695  hypothetical protein  29.41 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0478  hypothetical protein  30.83 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1515  protein of unknown function DUF488  30.17 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.933464  normal  0.210794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1211  hypothetical protein  31.5 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1094  protein of unknown function DUF488  31.03 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0330  hypothetical protein  32.52 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4646  hypothetical protein  32.77 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0089  protein of unknown function DUF488  27.2 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1755  protein of unknown function DUF488  27.64 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5164  hypothetical protein  27.97 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.213776  normal  0.413293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2259  protein of unknown function DUF488  27.12 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.29323  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1965  protein of unknown function DUF488  30.89 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0334  hypothetical protein  30.65 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0507685  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2498  hypothetical protein  28.81 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3588  protein of unknown function DUF488  29.27 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2286  protein of unknown function DUF488  29.37 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1448  hypothetical protein  30.58 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.790697  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4493  hypothetical protein  27.87 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2628  hypothetical protein  27.97 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1902  protein of unknown function DUF488  27.1 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.963702  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0508  hypothetical protein  29.1 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759829  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2397  protein of unknown function DUF488  28.28 
 
 		 114 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000131309  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2463  hypothetical protein  26.72 
 
 		 169 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0871  hypothetical protein  25.62 
 
 		 129 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.192956 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2617  protein of unknown function DUF488  27.5 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0778  protein of unknown function DUF488  27.5 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000129789  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0623  hypothetical protein  33.61 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4130  hypothetical protein  31.36 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2090  hypothetical protein  30.56 
 
 		 120 aa  40.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0599  hypothetical protein  29.75 
 
 		 144 aa  40  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000224589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>