70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2020 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0721  phosphatase-like  58.82 
 
 		 678 aa  749    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2297  phosphatase-like protein  54.34 
 
 		 631 aa  691    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.937411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1172  hypothetical protein  62.09 
 
 		 653 aa  734    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1926  putative exported alkaline phosphatase  56.72 
 
 		 651 aa  688    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5329  putative exported alkaline phosphatase  57.83 
 
 		 650 aa  697    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1201  phosphatase-like protein  58.82 
 
 		 678 aa  749    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2102  phosphatase-like protein  58.14 
 
 		 653 aa  740    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0558877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1084  phosphatase-like protein  58.49 
 
 		 652 aa  743    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1174  phosphatase-like protein  58.67 
 
 		 654 aa  746    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.140129  normal  0.0938107 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0697  hypothetical protein  58.6 
 
 		 653 aa  739    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00183963  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1084  phosphatase-like protein  58.73 
 
 		 651 aa  752    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1369  hypothetical protein  58.6 
 
 		 653 aa  741    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0780829  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3826  hypothetical protein  59.33 
 
 		 662 aa  703    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.984563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0622  putative exported alkaline phosphatase  58.48 
 
 		 650 aa  740    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00813313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4293  putative exported alkaline phosphatase  58.48 
 
 		 650 aa  739    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.422152  normal  0.153908 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2020  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 648 aa  1325    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2864  hypothetical protein  59.53 
 
 		 653 aa  747    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0441015  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1373  hypothetical protein  58.76 
 
 		 653 aa  742    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4309  phosphatase-like  57.89 
 
 		 654 aa  738    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0174712  normal  0.447633 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1503  putative exported alkaline phosphatase  58.76 
 
 		 653 aa  742    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0619169  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5110  putative exported alkaline phosphatase  55.32 
 
 		 673 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.34346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1786  hypothetical protein  58.6 
 
 		 653 aa  739    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00925906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00684  alkaline phosphatase  54.68 
 
 		 630 aa  693    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261575  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0455  hypothetical protein  58.6 
 
 		 653 aa  739    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0565158  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2465  phosphatase-like protein  52.09 
 
 		 678 aa  632  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2071  phosphatase-like protein  51.33 
 
 		 688 aa  622  1e-177  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1083  hypothetical protein  47.63 
 
 		 623 aa  524  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.638894  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0225  alkaline phosphatase  38.55 
 
 		 583 aa  347  4e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1482  protein of unknown function DUF839  34.21 
 
 		 607 aa  295  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0864  hypothetical protein  35.69 
 
 		 630 aa  283  5.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0218  protein of unknown function DUF839  33.6 
 
 		 625 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7168  putative exported alkaline phosphatase  49 
 
 		 253 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0983  protein of unknown function DUF839  27.49 
 
 		 626 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01228  putative cell surface protein  27.97 
 
 		 624 aa  141  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0385  putative cell surface protein  30.28 
 
 		 631 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1474  hypothetical protein  27.88 
 
 		 612 aa  130  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.654414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0626  protein of unknown function DUF839  25.73 
 
 		 883 aa  88.2  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0625  protein of unknown function DUF839  25.72 
 
 		 884 aa  86.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0696  protein of unknown function DUF839  26.49 
 
 		 887 aa  84  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.663766  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0309  twin-arginine translocation pathway signal  23.95 
 
 		 680 aa  66.6  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7026  protein of unknown function DUF839  23.15 
 
 		 696 aa  65.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2410  protein of unknown function DUF839  26.08 
 
 		 715 aa  58.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39290  predicted phosphatase  22.43 
 
 		 695 aa  55.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.618336 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5468  hypothetical protein  23.08 
 
 		 699 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553235  normal  0.0893539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5379  twin-arginine translocation pathway signal  23.08 
 
 		 699 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5755  hypothetical protein  23.08 
 
 		 699 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30040  hypothetical protein  23.72 
 
 		 672 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21400  predicted phosphatase  26.62 
 
 		 689 aa  53.5  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000286399 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0181  hypothetical protein  22.9 
 
 		 593 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.832056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0547  hypothetical protein  21.7 
 
 		 698 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4447  hypothetical protein  24.12 
 
 		 704 aa  51.2  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0141  hypothetical protein  22.68 
 
 		 593 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.348091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0160  hypothetical protein  23.5 
 
 		 593 aa  50.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28430  hypothetical protein  22.52 
 
 		 662 aa  49.3  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1844  hypothetical protein  24.17 
 
 		 744 aa  49.7  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4431  hypothetical protein  28.74 
 
 		 587 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2572  hypothetical protein  22.79 
 
 		 672 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3373  protein of unknown function DUF839  22.1 
 
 		 702 aa  48.1  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.14033  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7027  protein of unknown function DUF839  23.33 
 
 		 677 aa  47.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17750  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  23.78 
 
 		 738 aa  47.8  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2408  hypothetical protein  22.27 
 
 		 667 aa  47  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.272483  normal  0.0989904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8988  twin-arginine translocation pathway signal  23.52 
 
 		 694 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21970  predicted phosphatase  26.7 
 
 		 458 aa  46.2  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.502314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4049  hypothetical protein  23.19 
 
 		 708 aa  45.8  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.117451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5802  hypothetical protein  29.06 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0581425  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1652  hypothetical protein  25.22 
 
 		 741 aa  46.2  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.875802 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1288  hypothetical protein  24.43 
 
 		 386 aa  45.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0491  Tat (twin-arginine translocation) pathway signal sequence domain protein  22.56 
 
 		 638 aa  45.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3386  phosphatase  26.12 
 
 		 476 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.562333  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1144  phosphatase  23.33 
 
 		 753 aa  43.9  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.136121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>