26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1176 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1176  hypothetical protein  100 
 
 		 485 aa  1003    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0184  Tn7-like transposition protein C  28.7 
 
 		 555 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  26.67 
 
 		 551 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3107  transposon Tn7 transposition protein C  27.43 
 
 		 490 aa  117  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0459795 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  26.01 
 
 		 551 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  25.42 
 
 		 568 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  24.95 
 
 		 550 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  26.35 
 
 		 536 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  27.76 
 
 		 552 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  25.19 
 
 		 559 aa  105  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  25.26 
 
 		 530 aa  105  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  27.54 
 
 		 551 aa  103  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  27.54 
 
 		 551 aa  103  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5723  Tn7-like transposition protein C  25.76 
 
 		 488 aa  103  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  24.3 
 
 		 540 aa  99.8  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3934  AAA ATPase  23.27 
 
 		 546 aa  97.8  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  23.9 
 
 		 545 aa  96.7  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  24.06 
 
 		 500 aa  95.9  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3949  Tn7-like transposition protein C  23.06 
 
 		 565 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7025  Tn7-like transposition protein C  26.07 
 
 		 352 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4322  hypothetical protein  24.22 
 
 		 478 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  21.77 
 
 		 562 aa  87.4  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  24.54 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  24.13 
 
 		 552 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  23.3 
 
 		 556 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6941  hypothetical protein  26.21 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0945854  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>