More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0477 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0477  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 537 aa  1101    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4101  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  32.95 
 
 		 572 aa  261  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0897  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 546 aa  257  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0359  putative PAS/PAC sensor protein  29.76 
 
 		 560 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1854  response regulator receiver domain-containing protein  28.51 
 
 		 549 aa  211  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.274781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4261  response regulator receiver domain-containing protein  30.93 
 
 		 534 aa  207  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3496  TPR repeat-containing response regulator  30.56 
 
 		 533 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2074  response regulator receiver domain-containing protein  27.73 
 
 		 551 aa  196  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1169  two component transcriptional regulator, AraC family  25.57 
 
 		 549 aa  193  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1911  response regulator/TPR domain protein  29.34 
 
 		 533 aa  193  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.014975  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0768  response regulator/TPR domain-containing protein  28.46 
 
 		 535 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0809  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 535 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0795  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 535 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184844 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2318  response regulator receiver protein  32.59 
 
 		 403 aa  176  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4421  response regulator receiver protein  26.47 
 
 		 535 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.763745  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0041  response regulator  26.14 
 
 		 535 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2579  response regulator receiver protein  25.79 
 
 		 547 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0145  response regulator receiver:tetratricopeptide TPR_4  31.93 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1458  response regulator receiver protein  28.49 
 
 		 416 aa  152  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.893415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01935  Response regulator with TPR repeat  22.81 
 
 		 546 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1420  response regulator receiver domain-containing protein  29.79 
 
 		 561 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1457  response regulator receiver protein  26.96 
 
 		 421 aa  131  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2920  response regulator receiver protein  23.37 
 
 		 538 aa  131  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0284416  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1176  response regulator receiver protein  29.45 
 
 		 540 aa  128  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06171  hypothetical protein  32.31 
 
 		 555 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3634  response regulator receiver  33.69 
 
 		 587 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.351597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02197  response regulator receiver protein  23.03 
 
 		 540 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00179351  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1257  response regulator VieB  31.7 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00784807  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2578  response regulator receiver protein  26.81 
 
 		 577 aa  110  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000176794 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01769  response regulator receiver protein  25.99 
 
 		 561 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.4688  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1268  response regulator receiver protein  22.24 
 
 		 513 aa  96.7  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0947  response regulator receiver protein  22.32 
 
 		 539 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00824863  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0885  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123702  hitchhiker  0.00202919 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1974  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 127 aa  78.2  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0489  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 127 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514722 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2540  response regulator receiver  33.04 
 
 		 131 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0419  response regulator receiver  32.56 
 
 		 127 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487855  normal  0.449259 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2018  response regulator receiver domain-containing protein  32.23 
 
 		 129 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0452  response regulator receiver protein  32.56 
 
 		 127 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0577794  normal  0.205923 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3160  response regulator receiver domain-containing protein  32.17 
 
 		 131 aa  75.5  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  32.23 
 
 		 129 aa  74.3  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 129 aa  73.9  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0388  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 127 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1285  response regulator receiver  30.77 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0521811 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4340  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 124 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365217  normal  0.448557 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2223  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 127 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1527  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 128 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.400069  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2163  response regulator receiver domain-containing protein  30.83 
 
 		 128 aa  73.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3666  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 128 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0547467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0610  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 128 aa  73.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.667708  normal  0.178716 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2979  chemotaxis regulatory protein CheY  28.33 
 
 		 129 aa  72.4  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1366  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 131 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.280194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0518  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  30.4 
 
 		 129 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150153  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3223  response regulator receiver protein  29.69 
 
 		 132 aa  72  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27950  Response regulator CheY  29.75 
 
 		 148 aa  72  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00952762  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0748  response regulator receiver domain-containing protein  28.68 
 
 		 137 aa  71.6  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.927301  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0897  response regulator receiver domain-containing protein  31.3 
 
 		 131 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3309  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.76 
 
 		 900 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.269875  normal  0.342346 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  30.58 
 
 		 129 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1181  response regulator receiver domain-containing protein  29.91 
 
 		 131 aa  71.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.125402 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1929  response regulator receiver domain-containing protein  28.79 
 
 		 132 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2453  chemotaxis regulatory protein CheY  31.4 
 
 		 129 aa  71.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.493501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2968  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 131 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000715649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0741  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  30.4 
 
 		 134 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1302  chemotaxis regulatory protein CheY  29.17 
 
 		 129 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230543 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01853  chemotaxis regulator transmitting signal to flagellar motor component  29.17 
 
 		 129 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1758  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 129 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.302397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2620  chemotaxis regulatory protein CheY  29.17 
 
 		 129 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000674542 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2115  chemotaxis regulatory protein CheY  29.17 
 
 		 129 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.293067  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1750  chemotaxis regulatory protein CheY  29.17 
 
 		 129 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4055  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 133 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4167  response regulator receiver protein  28.8 
 
 		 133 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.937704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 130 aa  70.9  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01842  hypothetical protein  29.17 
 
 		 129 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1978  chemotaxis regulatory protein CheY  29.17 
 
 		 129 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  30.58 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2175  chemotaxis regulatory protein CheY  29.17 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1758  chemotaxis regulatory protein CheY  30.58 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.505823  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0171  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 131 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566468  normal  0.360629 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1646  chemotaxis regulatory protein CheY  30.58 
 
 		 129 aa  70.5  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1402  chemotaxis response regulator transcription regulator protein  28.8 
 
 		 133 aa  70.5  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1614  response regulator receiver domain-containing protein  28.57 
 
 		 131 aa  70.5  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0470902 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0718  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.887374  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3909  response regulator receiver protein  30.83 
 
 		 128 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0125  response regulator receiver domain-containing protein  29.92 
 
 		 131 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0070  chemotaxis protein CheY  29.92 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2837  response regulator receiver domain-containing protein  34.15 
 
 		 129 aa  69.7  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0244  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 131 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.998065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2845  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 131 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0175  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 131 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.327239  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0188  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 131 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0262  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 131 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3930  chemotaxis protein CheY  29.92 
 
 		 131 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1520  chemotaxis protein CheY  31.15 
 
 		 127 aa  69.3  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3849  chemotaxis protein CheY  29.92 
 
 		 131 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3428  chemotaxis protein CheY  29.92 
 
 		 131 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1206  chemotaxis regulatory protein CheY  27.5 
 
 		 129 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1329  chemotaxis regulatory protein CheY  27.5 
 
 		 129 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000458131 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2071  chemotaxis regulatory protein CheY  27.5 
 
 		 129 aa  69.3  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466695 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>