32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6452 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  100 
 
 		 142 aa  285  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  92.96 
 
 		 142 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  57.93 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  47.41 
 
 		 134 aa  131  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  47.18 
 
 		 137 aa  127  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0322633 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  43.7 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  38.89 
 
 		 152 aa  97.4  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  41.35 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  40.14 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  39.26 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  39.04 
 
 		 160 aa  94  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  36.81 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  36.55 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  35.42 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  38.1 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  37.5 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  36.17 
 
 		 140 aa  84.7  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1124  antirestriction protein  38.3 
 
 		 159 aa  84  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3208  antirestriction protein  38.3 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  35.92 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4895  antirestriction protein  38.36 
 
 		 157 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3409  antirestriction protein  38.1 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2854  antirestriction protein  37.59 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0792821 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  42.96 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1063  antirestriction protein  38.3 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0944493 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2247  antirestriction protein  38.1 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1401  antirestriction protein  36.88 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0932119 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  37.76 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  38.46 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  37.76 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0005  antirestriction family protein  37.76 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  37.76 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>