More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6231 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6231  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  903    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.425385  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0206  hypothetical protein  45.95 
 
 
466 aa  385  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  42.18 
 
 
451 aa  329  6e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3755  amidohydrolase  45.8 
 
 
419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.279162 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1947  amidohydrolase  41.02 
 
 
466 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.442808  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4731  amidohydrolase  39.83 
 
 
490 aa  269  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4132  hypothetical protein  39.81 
 
 
451 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1785  hypothetical protein  36.57 
 
 
459 aa  249  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211733  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7586  hypothetical protein  38.41 
 
 
456 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8698  amidohydrolase  39.67 
 
 
428 aa  247  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4435  amidohydrolase  34.74 
 
 
451 aa  230  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5508  hypothetical protein  36.61 
 
 
451 aa  226  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5157  amidohydrolase  36.3 
 
 
487 aa  217  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2899  amidohydrolase  37.06 
 
 
482 aa  209  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3049  amidohydrolase  36.85 
 
 
414 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2471  amidohydrolase  36.12 
 
 
480 aa  207  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356182  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4067  amidohydrolase  35.4 
 
 
461 aa  202  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.737174  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0048  amidohydrolase  34.3 
 
 
501 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2025  amidohydrolase  34.47 
 
 
504 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39910  metal dependent hydrolase  35.03 
 
 
520 aa  183  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.776901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4218  amidohydrolase  33.41 
 
 
466 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1224  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.07 
 
 
441 aa  142  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2253  amidohydrolase  28.08 
 
 
437 aa  142  9e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  26.68 
 
 
440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1599  Atrazine chlorohydrolase  24.04 
 
 
434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.748458  unclonable  4.4345400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1611  amidohydrolase  28.02 
 
 
445 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170905  decreased coverage  0.00285374 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3916  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.79 
 
 
447 aa  127  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33045  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7136  amidohydrolase  29.69 
 
 
461 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1885  amidohydrolase  24.72 
 
 
431 aa  121  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.39 
 
 
445 aa  119  7e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0967  amidohydrolase  27.31 
 
 
439 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  25.74 
 
 
432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3763  amidohydrolase  26.51 
 
 
431 aa  117  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000254001  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.17 
 
 
432 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0651  amidohydrolase  27.64 
 
 
430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1486  amidohydrolase  25.51 
 
 
435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0963  amidohydrolase  25.4 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000377976  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6058  amidohydrolase  24.6 
 
 
479 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.535728  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2526  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.65 
 
 
476 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0262801  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2422  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.65 
 
 
500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2379  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  29.65 
 
 
476 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.750758  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0884  amidohydrolase  21.92 
 
 
428 aa  114  5e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000393523  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0728  putative hydrolase  27.9 
 
 
443 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.951469  normal  0.721492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2838  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.99 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0407905  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3605  amidohydrolase  29.41 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361242  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01530  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  28.16 
 
 
452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.904881  normal  0.929171 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1936  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.94 
 
 
465 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3434  amidohydrolase  28.74 
 
 
462 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.476935 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2961  amidohydrolase  25.79 
 
 
447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  27.73 
 
 
455 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3918  amidohydrolase  27.55 
 
 
442 aa  110  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1293  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.8 
 
 
469 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2323  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.48 
 
 
465 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.421089 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2187  N-ethylammeline chlorohydrolase  27.52 
 
 
448 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.147574  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2073  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  28.6 
 
 
470 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.722851  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0735  amidohydrolase  24.42 
 
 
422 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.30941 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1186  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.33 
 
 
467 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000010565  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3129  amidohydrolase  26.79 
 
 
434 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.611034  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1140  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.99 
 
 
454 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1736  amidohydrolase  24.84 
 
 
455 aa  107  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1980  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.35 
 
 
470 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0946323 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6122  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.51 
 
 
470 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1956  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.51 
 
 
470 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  24.44 
 
 
462 aa  107  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5267  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.99 
 
 
470 aa  107  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3055  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.85 
 
 
452 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0634  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.06 
 
 
451 aa  106  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1326  putative amidohydrolase  24.49 
 
 
469 aa  106  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.183481  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1541  N-ethylammeline chlorohydrolase  25.06 
 
 
484 aa  106  8e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0613367  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4253  amidohydrolase  29.21 
 
 
478 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0761182  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1591  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.64 
 
 
461 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1577  amidohydrolase  25.23 
 
 
466 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.892761 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1189  amidohydrolase  23.57 
 
 
434 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.356173  normal  0.0185789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0863  amidohydrolase  26.55 
 
 
509 aa  104  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  0.0227657 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1943  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.13 
 
 
470 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.821524  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4317  amidohydrolase  27.15 
 
 
663 aa  103  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0896  amidohydrolase  24.08 
 
 
468 aa  103  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3081  amidohydrolase  28.9 
 
 
464 aa  103  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0086  amidohydrolase  24.36 
 
 
422 aa  103  9e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6206  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.15 
 
 
452 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.125899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1870  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.46 
 
 
470 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0172647 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1698  amidohydrolase family protein  28.95 
 
 
477 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0841  amidohydrolase  26.43 
 
 
470 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1959  N-ethylammeline chlorohydrolase  28.51 
 
 
444 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.605472  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1199  amidohydrolase  24.51 
 
 
431 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.242168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2741  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  27.79 
 
 
454 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1294  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  25.96 
 
 
493 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.176356  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0632  amidohydrolase  29.22 
 
 
460 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979891  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1812  Atrazine chlorohydrolase  26.99 
 
 
440 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1182  N-ethylammeline chlorohydrolase  24.71 
 
 
434 aa  102  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.335787  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0781  amidohydrolase family protein  23.84 
 
 
431 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0800  amidohydrolase  24.37 
 
 
422 aa  102  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1183  amidohydrolase  24.14 
 
 
422 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.267504  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4181  amidohydrolase  27.17 
 
 
663 aa  101  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.748776  unclonable  0.000000000471707 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1957  putative chlorohydrolase/aminohydrolase  26.34 
 
 
441 aa  101  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.157555 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0809  amidohydrolase  24.31 
 
 
398 aa  101  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0059  amidohydrolase  27.8 
 
 
448 aa  101  3e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.312881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1313  hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  26.93 
 
 
470 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.023454 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4101  amidohydrolase  25.92 
 
 
452 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3139  amidohydrolase  25.22 
 
 
461 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>