26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3888 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0850  hypothetical protein  64.12 
 
 		 721 aa  892    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3888  hypothetical protein  100 
 
 		 728 aa  1451    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.967801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1838  hypothetical protein  31.23 
 
 		 712 aa  294  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.469371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2506  hypothetical protein  32.06 
 
 		 708 aa  276  7e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4066  hypothetical protein  30.1 
 
 		 715 aa  216  9e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174208 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1472  hypothetical protein  29.6 
 
 		 723 aa  187  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.954552  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1908  hypothetical protein  20.84 
 
 		 736 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2493  hypothetical protein  23.55 
 
 		 739 aa  114  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.394569  normal  0.794955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1718  hypothetical protein  27.03 
 
 		 827 aa  88.6  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715066 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0976  hypothetical protein  29.41 
 
 		 568 aa  85.5  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.412633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1001  hypothetical protein  28.86 
 
 		 914 aa  85.1  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.724391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0851  hypothetical protein  35.38 
 
 		 665 aa  84.3  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.170161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1002  hypothetical protein  28.34 
 
 		 909 aa  82.4  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0457  hypothetical protein  25.58 
 
 		 223 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.471421  hitchhiker  0.00382778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3325  hypothetical protein  26.7 
 
 		 607 aa  68.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3366  hypothetical protein  25.54 
 
 		 540 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261921 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2115  hypothetical protein  21.55 
 
 		 694 aa  65.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.728549  normal  0.648429 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3559  hypothetical protein  25.12 
 
 		 607 aa  63.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0477684 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0977  hypothetical protein  30 
 
 		 219 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.396988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4537  hypothetical protein  28.28 
 
 		 606 aa  60.8  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4140  hypothetical protein  27.34 
 
 		 579 aa  60.8  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232862  hitchhiker  0.00288889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2634  hypothetical protein  30.95 
 
 		 929 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1904  hypothetical protein  27.69 
 
 		 628 aa  51.6  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.812108  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5070  hypothetical protein  32.7 
 
 		 711 aa  50.8  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000565687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4558  hypothetical protein  32.89 
 
 		 678 aa  46.6  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102336  normal  0.516912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1491  hypothetical protein  26.01 
 
 		 635 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241788  normal  0.300108 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>