176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3402 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3402  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  573  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  40.18 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  32.5 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  34.19 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  36.04 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  44.58 
 
 		 480 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  45 
 
 		 527 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  45 
 
 		 527 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  38.46 
 
 		 237 aa  68.9  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  38.89 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0255  Abortive infection protein  39.53 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2176  abortive infection protein  38.1 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184478  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  42.5 
 
 		 538 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  29.19 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  37.8 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1232  CAAX amino terminal protease family protein  41.94 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000020685 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  37.8 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  37.8 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1107  putative metal-dependent membrane protease  45.35 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.402277  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  41.03 
 
 		 528 aa  63.2  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  39.74 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  28.4 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  28.4 
 
 		 227 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  28.4 
 
 		 237 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  39.24 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  38.75 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  26.25 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  36.71 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  36.71 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  40.96 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1018  CAAX amino terminal protease family protein  31.53 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.300686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  35.96 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1041  CAAX amino terminal protease family protein  31.53 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1199  CAAX amino terminal protease family protein  31.53 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.746806 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1120  CAAX amino terminal protease family protein  31.53 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0752  Abortive infection protein  39.51 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1019  CAAX amino terminal protease family protein  31.53 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1276  CAAX amino terminal protease family protein  31.53 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  33.33 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  32.5 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  38.89 
 
 		 515 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1605  Abortive infection protein  37.74 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  35.44 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  31.96 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1913  abortive infection protein  28.89 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000308321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0234  CAAX amino terminal protease family protein  36.14 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0603061  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1219  CAAX amino terminal protease family protein  30.63 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.991913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2417  abortive infection protein  36.5 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000014849  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  29.81 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  35.44 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0959  Abortive infection protein  35.51 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  35.11 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  31.71 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  31.71 
 
 		 313 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  24.5 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  24.5 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  31.71 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  28.85 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  31.71 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  31.71 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0040  Abortive infection protein  31.58 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  24.5 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 337 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  31.71 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2327  abortive infection protein  35.23 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  31.71 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_6079  predicted protein  38.46 
 
 		 234 aa  53.9  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.392494  normal  0.133963 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1174  CAAX amino terminal protease family protein  29.73 
 
 		 282 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715167  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0145  caax amino protease family protein  30.33 
 
 		 235 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.353026 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  31.97 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2182  abortive infection protein  39.39 
 
 		 511 aa  53.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0783395  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  35.23 
 
 		 227 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3016  Abortive infection protein  40.91 
 
 		 527 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  36.14 
 
 		 399 aa  53.5  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4694  CAAX amino terminal protease family protein  34.21 
 
 		 224 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000569642  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0098  abortive infection protein  30.3 
 
 		 246 aa  53.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.015853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0581  abortive infection protein  33.04 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000196506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  35.71 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  26.67 
 
 		 228 aa  52.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0331  Abortive infection protein  34.07 
 
 		 262 aa  52.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0520111  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  31.4 
 
 		 234 aa  52.8  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0845  abortive infection protein  27.27 
 
 		 272 aa  52.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0787  Abortive infection protein  40.48 
 
 		 257 aa  52.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2103  abortive infection protein  34.12 
 
 		 246 aa  52.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3430  Abortive infection protein  35 
 
 		 261 aa  52.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000181299  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0817  hypothetical protein  39.08 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.566896 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3154  hypothetical protein  44.04 
 
 		 475 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5144  CAAX amino terminal protease family protein  27.5 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301138  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2113  abortive infection family protein  32.22 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00391634  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0769  Abortive infection protein  33.33 
 
 		 775 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4309  CAAX amino protease  32.89 
 
 		 224 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0376  Abortive infection protein  33.08 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0452979  normal  0.970349 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1085  CAAX amino terminal protease family protein  35.14 
 
 		 130 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0529002  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4167  CAAX amino terminal protease family protein  29.73 
 
 		 282 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0174  caax amino protease family protein  30.33 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028794  hitchhiker  4.68107e-34 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1024  abortive infection protein  30.69 
 
 		 284 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2280  abortive infection protein  41.57 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4680  caax amino protease family protein  35.23 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24966e-38 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>