56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3154 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3154  hypothetical protein  100 
 
 
475 aa  934    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0164  abortive infection protein  33.33 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  34.83 
 
 
228 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  34.83 
 
 
228 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  35.96 
 
 
228 aa  61.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  34.83 
 
 
228 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  34.83 
 
 
228 aa  61.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  34.83 
 
 
228 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  35.29 
 
 
278 aa  56.6  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  32.95 
 
 
235 aa  56.6  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  32.73 
 
 
241 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3402  hypothetical protein  44.04 
 
 
285 aa  56.6  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  41.25 
 
 
227 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2823  Abortive infection protein  32.67 
 
 
297 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  31.76 
 
 
286 aa  54.7  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  32.94 
 
 
288 aa  53.9  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1288  CAAX amino terminal protease family protein  30.59 
 
 
292 aa  53.5  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000150846  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  29.63 
 
 
236 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  29.63 
 
 
236 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  29.63 
 
 
236 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  28.89 
 
 
238 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  29.63 
 
 
241 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3237  abortive infection protein  32.73 
 
 
279 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  27.27 
 
 
280 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  27.78 
 
 
237 aa  50.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  27.78 
 
 
237 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1562  Abortive infection protein  33.33 
 
 
269 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000889795  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4680  caax amino protease family protein  31.33 
 
 
268 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24966e-38 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4461  CAAX amino terminal protease family protein  31.33 
 
 
242 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000426946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4809  caax amino terminal protease family protein  31.33 
 
 
242 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00449457  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  31.17 
 
 
237 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  31 
 
 
237 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  36.17 
 
 
480 aa  48.5  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1503  Abortive infection protein  34.07 
 
 
276 aa  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.209578  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  37.35 
 
 
527 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  37.35 
 
 
527 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1880  abortive infection protein  30.56 
 
 
279 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.124856  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0004  abortive infection protein  40 
 
 
259 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00759738  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  25.16 
 
 
237 aa  47  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2009  abortive infection protein  29.9 
 
 
271 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0143983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0252  abortive infection protein  32 
 
 
399 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000621218  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4309  CAAX amino protease  32.47 
 
 
224 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  36.63 
 
 
267 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0055  hypothetical protein  32.76 
 
 
396 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00436559  normal  0.0480998 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  24.55 
 
 
225 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0775  abortive infection protein  28.57 
 
 
211 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443041  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  32.91 
 
 
225 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4694  CAAX amino terminal protease family protein  32.47 
 
 
224 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000569642  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  34.15 
 
 
528 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2167  abortive infection protein  33.33 
 
 
193 aa  44.3  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  35.53 
 
 
538 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2572  Abortive infection protein  31.31 
 
 
251 aa  44.3  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610355  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  31.96 
 
 
278 aa  43.9  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1983  Abortive infection protein  33.12 
 
 
227 aa  43.9  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00182843  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  33.33 
 
 
318 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  31.68 
 
 
237 aa  43.5  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>