108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2113 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2113  abortive infection family protein  100 
 
 		 255 aa  513  1e-144  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00391634  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1283  abortive infection protein  29.91 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237963  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0542  metal-dependent membrane protease  26.95 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.67642  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1223  Abortive infection protein  34 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0172  protease, putative  24.32 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2340  hypothetical protein  35.92 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1477  AbrB family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1519  transcriptional regulator, AbrB family  37.78 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1248  CAAX amino terminal protease family protein  35.56 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000143698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1283  abortive infection protein  35.56 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00310248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1412  transcriptional regulator, AbrB family  36.67 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3931  transcriptional regulator, AbrB family  36.67 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1276  AbrB family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 337 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00251818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1250  CAAX amino terminal protease family protein  35.56 
 
 		 337 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1378  AbrB family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 337 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0239799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1450  transcriptional regulator, AbrB family  35.56 
 
 		 337 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0536732 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1082  abortive infection protein  35.56 
 
 		 346 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0692  CAAX amino terminal protease family protein  26.49 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0603  CAAX amino terminal protease family protein  26.49 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0547  CAAX amino terminal protease family protein  26.49 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0636  CAAX amino terminal protease family protein  26.49 
 
 		 228 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  33.58 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0547  CAAX amino terminal protease family protein  26.49 
 
 		 228 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0315  CAAX amino terminal protease family protein  26.29 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000181046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0296  CAAX amino terminal protease family protein  25.71 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00879326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0287  CAAX amino terminal protease family protein  25.71 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00895177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0250  abortive infection protein  32.77 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00998587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0251  CAAX amino terminal protease family protein  25.71 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0238  CAAX amino protease  25.71 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000450498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0265  CAAX amino terminal protease family protein  25.71 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000459802  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0988  CAAX amino terminal protease family protein  34.56 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000602238  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0879  CAAX amino terminal protease family protein  31.12 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00516556  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0717  metal-dependent membrane protease  30 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1838  metal-dependent membrane protease  26.52 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0506649  normal  0.0616534 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0291  CAAX amino terminal protease family protein  25.71 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0237  CAAX amino protease  25.71 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.4387099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3402  hypothetical protein  32.22 
 
 		 285 aa  52  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1896  abortive infection family protein  30.23 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1829  metal-dependent membrane protease  29.82 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000168416  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2352  Abortive infection protein  24.31 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2519  Abortive infection protein  32.32 
 
 		 527 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3587  Abortive infection protein  32.32 
 
 		 527 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1108  Abortive infection protein  31.52 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0998  CAAX amino terminal protease family protein  29.57 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00140172  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2068  hypothetical protein  27.7 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000680357  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2105  hypothetical protein  27.7 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00255983  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2337  hypothetical protein  30.25 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000912878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2380  hypothetical protein  30.25 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0549  abortive infection protein  31.78 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5028  CAAX amino terminal protease family protein  23.89 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000029132  normal  0.883864 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1507  Abortive infection protein  30.3 
 
 		 538 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.950737 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1735  abortive infection protein  23.46 
 
 		 272 aa  48.9  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000137839  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  29.93 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  29.93 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1046  abortive infection protein  32.67 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0244  abortive infection protein  24.44 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000696395  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15071  predicted protein  24.86 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00688834  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1576  Abortive infection protein  32.61 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1486  abortive infection family protein  37.62 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000034413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4460  CAAX amino terminal protease family protein  30.11 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000581148  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0071  protease  26.38 
 
 		 156 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4808  caax amino terminal protease family protein  30.11 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000012688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4768  abortive infection protein  35.11 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4679  CAAX amino terminal protease family protein  30.11 
 
 		 236 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13068e-37 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  29.25 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0484  hypothetical protein  35.29 
 
 		 480 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0842949 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0229  Abortive infection protein  29.35 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000154218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3388  Abortive infection protein  30.83 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0971  abortive infection protein  29.49 
 
 		 213 aa  45.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4396  abortive infection protein  28.89 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000195861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4829  abortive infection protein  32.04 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0136  hypothetical protein  25.29 
 
 		 226 aa  45.4  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3796  abortive infection protein  27.59 
 
 		 602 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4693  CAAX amino terminal protease family protein  27.78 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000019786  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  29.13 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5134  Abortive infection protein  34.44 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4723  CAAX family protease  26.96 
 
 		 274 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.998962 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1815  abortive infection protein  35 
 
 		 515 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.308714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  26.14 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  29.5 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4461  CAAX amino terminal protease family protein  33.73 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000426946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5895  Abortive infection protein  26.36 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4809  caax amino terminal protease family protein  33.73 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00449457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3071  Abortive infection protein  27.01 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21970  Abortive infection protein  35.63 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0275  CAAX amino terminal protease family protein  33.7 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000182048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4694  CAAX amino terminal protease family protein  27.16 
 
 		 224 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000569642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4656  CAAX amino terminal protease  31.18 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1546  abortive infection protein  30.84 
 
 		 528 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2510  abortive infection protein  23.16 
 
 		 282 aa  43.5  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00961161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4680  caax amino protease family protein  33.73 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24966e-38 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5928  Abortive infection protein  23.21 
 
 		 238 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1873  hypothetical protein  31.4 
 
 		 288 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000278939  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03479  caax amino terminal protease family  27.55 
 
 		 278 aa  43.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1871  hypothetical protein  28.89 
 
 		 286 aa  42.7  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000201815  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  30.23 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0098  abortive infection protein  26.62 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.015853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  30.23 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1832  abortive infection protein  26.81 
 
 		 211 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1867  abortive infection protein  26.81 
 
 		 211 aa  42.7  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>