168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2201 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2201  putative signal peptide protein  100 
 
 		 286 aa  588  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5651  glycosyl transferase family protein  69.68 
 
 		 315 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1697  glycosyl transferase family protein  69.68 
 
 		 280 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2348  glycosyl transferase family protein  70.04 
 
 		 309 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2309  glycosyl transferase family protein  69.68 
 
 		 280 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2332  glycosyl transferase family protein  69.68 
 
 		 280 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.154837 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2228  glycosyl transferase family protein  70.04 
 
 		 280 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0966  glycosyl transferase family protein  53.9 
 
 		 312 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2203  hypothetical protein  52.21 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 785 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 270 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 		 1162 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.78 
 
 		 2401 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  24.8 
 
 		 1077 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 		 1340 aa  67.4  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 		 369 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  24.45 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2042  glycosyl transferase family 2  25.48 
 
 		 832 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.635088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  23.39 
 
 		 1739 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 1268 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  23.97 
 
 		 457 aa  63.5  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3221  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 		 328 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  27.78 
 
 		 700 aa  62.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  26.05 
 
 		 860 aa  60.1  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  24.05 
 
 		 1523 aa  59.7  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  24.39 
 
 		 430 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.89 
 
 		 610 aa  58.9  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  23.73 
 
 		 525 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 		 1523 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3632  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 		 310 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  32.04 
 
 		 1435 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2476  glycosyl transferase family 2  27.01 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1485  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.48 
 
 		 427 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0313881  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3804  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 		 582 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  22.92 
 
 		 1106 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 		 812 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  23.91 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.93 
 
 		 336 aa  53.1  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  27.01 
 
 		 312 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  28.47 
 
 		 316 aa  52.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  24.45 
 
 		 1644 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  24.08 
 
 		 1644 aa  52.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  24.89 
 
 		 337 aa  52.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  24.34 
 
 		 679 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 		 358 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  21.95 
 
 		 624 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  24.72 
 
 		 333 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0883  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.178472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1239  glycosyl transferase family protein  22.83 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.769804 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4364  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 		 294 aa  49.3  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0115  glycosyl transferase family protein  23.35 
 
 		 892 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.411081  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 		 988 aa  49.3  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  32.35 
 
 		 392 aa  48.9  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2934  family 2 glycosyl transferase  33.33 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.349608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8186  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2807  glycosyl transferase family protein  22.35 
 
 		 419 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1366  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.415846  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  27.75 
 
 		 321 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.02 
 
 		 379 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  26.91 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0379  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 891 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 727 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3997  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 		 1250 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 		 332 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 		 333 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  24.05 
 
 		 723 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  23.04 
 
 		 1119 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2893  glycosyl transferase family 2  25.55 
 
 		 312 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  27.45 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2086  glycosyl transferase family protein  22.22 
 
 		 274 aa  46.2  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3250  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.253985  normal  0.48335 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3159  glycosyl transferase family 2  37.11 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  23.18 
 
 		 841 aa  46.2  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3292  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 		 277 aa  46.2  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 		 324 aa  45.8  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3353  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 		 312 aa  45.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 		 286 aa  46.2  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2921  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 		 880 aa  46.2  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0130  glycosyl transferase family protein  27.47 
 
 		 352 aa  45.8  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0102341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  21.69 
 
 		 994 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0380  glycosyl transferase family 2  22.55 
 
 		 298 aa  45.8  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7666  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.2 
 
 		 1132 aa  45.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  27.84 
 
 		 328 aa  45.8  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  34.88 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2297  putative glycosyl transferase  28.33 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.038696  normal  0.220934 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  26.37 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2348  putative glycosyl transferase  28.33 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4968  glycosyl transferase family protein  32.95 
 
 		 338 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>