29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4224 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4224  putative conjugative transfer factor, TraB  100 
 
 		 417 aa  828    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2159  TraB pilus assembly  45.62 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4009  TraB pilus assembly family protein  42.79 
 
 		 458 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.702041  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5368  TraB pilus assembly family protein  42.73 
 
 		 443 aa  150  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.181212 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4287  conjugal transfer pilus assembly protein TraB  32.95 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0018  hypothetical protein  28.71 
 
 		 457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.6486  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4181  TraB pilus assembly family protein  37.44 
 
 		 449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.000413656  hitchhiker  0.000231943 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0035  conjugal transfer pilus assembly protein TraB  38.94 
 
 		 475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0076  type IV conjugative transfer system protein TraB  30.33 
 
 		 438 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4376  TraB pilus assembly family protein  35.75 
 
 		 508 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4537  TraB pilus assembly family protein  35.75 
 
 		 508 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749618  normal  0.479712 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4440  TraB pilus assembly family protein  35.75 
 
 		 508 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2317  TraB pilus assembly  35.48 
 
 		 456 aa  119  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.653277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1538  TraB pilus assembly family protein  34.25 
 
 		 472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.245365 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_06  conjugative transfer protein TraB  27.56 
 
 		 476 aa  117  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4629  TraB pilus assembly family protein  36.02 
 
 		 509 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.803556 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4444  TraB pilus assembly family protein  28.04 
 
 		 508 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4500  TraB pilus assembly family protein  34.84 
 
 		 509 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2650  TraB pilus assembly  34.86 
 
 		 457 aa  116  8.999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.835433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6794  TraB pilus assembly family protein  30 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0932  sex pilus assembly protein  30.95 
 
 		 446 aa  111  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.112358  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0255  TraB pilus assembly family protein  30.67 
 
 		 418 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.844609  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0367  sex pilus assembly protein  34.43 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0565513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0318  TraB pilus assembly family protein  32.38 
 
 		 422 aa  103  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4258  TraB pilus assembly family protein  29.11 
 
 		 452 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.346298  normal  0.0301907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1081  conjugal transfer protein, putative  30.48 
 
 		 543 aa  95.5  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3779  TraB pilus assembly family protein  30.43 
 
 		 468 aa  93.2  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0026  hypothetical protein  26.69 
 
 		 484 aa  80.9  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6227  hypothetical protein  27.87 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.771617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>