29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2550 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2550  endo-beta-1,3-1,4-glycanase protein  100 
 
 		 260 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.616769  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1209  licheninase  98.46 
 
 		 260 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0812437 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1972  glycoside hydrolase family protein  75.38 
 
 		 260 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.138476 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4955  glycoside hydrolase family protein  47.67 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.126867 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0648  glycoside hydrolase family protein  54.42 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5929  endo-1,3-1,4-beta-glycanase  46.54 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4600  glycoside hydrolase family protein  38.01 
 
 		 277 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  30.13 
 
 		 334 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2751  glycoside hydrolase family protein  29 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0061  exported glycosyl hydrolase, family 16  24.66 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.558429  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2802  b-glucosidase  28.21 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.790099  normal  0.396341 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04515  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  29.33 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000384453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  26.85 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  30.33 
 
 		 566 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3662  glycoside hydrolase family protein  27.17 
 
 		 593 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  21.55 
 
 		 492 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06948  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  24.6 
 
 		 367 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40512  predicted protein  29.73 
 
 		 346 aa  50.4  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  29.76 
 
 		 1332 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4988  glycoside hydrolase family protein  25.9 
 
 		 372 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  23.86 
 
 		 883 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03053  putative transglycosidase, GH16 family (Eurofung)  36.76 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.736555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 		 1321 aa  46.2  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  24.89 
 
 		 279 aa  45.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05790  cell wall organization and biogenesis-related protein, putative  25 
 
 		 376 aa  45.8  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  22.06 
 
 		 556 aa  45.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1017  glycoside hydrolase family 16  28.96 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4636  hypothetical protein  27.81 
 
 		 287 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00933  extracellular cell wall glucanase Crf1/allergen Asp F9 (AFU_orthologue; AFUA_1G16190)  33.33 
 
 		 405 aa  42.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0489883  normal  0.840082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>