More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0782 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0397  Ppx/GppA phosphatase  92.98 
 
 
513 aa  977    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0739  Ppx/GppA phosphatase  65.31 
 
 
506 aa  648    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0782  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
513 aa  1038    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1059  Ppx/GppA phosphatase  63.28 
 
 
522 aa  642    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1857  Ppx/GppA phosphatase  64.02 
 
 
548 aa  656    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2438  Ppx/GppA phosphatase  99.61 
 
 
513 aa  1033    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.118104  hitchhiker  0.00776176 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1303  Ppx/GppA phosphatase  66.6 
 
 
513 aa  681    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1593  Ppx/GppA phosphatase  66.6 
 
 
513 aa  681    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.229117  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2160  Ppx/GppA phosphatase  36.98 
 
 
509 aa  301  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7415  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0039  Ppx/GppA phosphatase  39.12 
 
 
499 aa  300  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.935227  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1582  exopolyphosphatase  36.1 
 
 
506 aa  299  7e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.794385  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3325  Ppx/GppA phosphatase  37.8 
 
 
498 aa  289  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.855451  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1251  Ppx/GppA phosphatase  38.81 
 
 
502 aa  287  2.9999999999999996e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0495  Ppx/GppA phosphatase  35.83 
 
 
517 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.813676 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1099  Ppx/GppA phosphatase  34.72 
 
 
506 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.09229 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1245  Ppx/GppA phosphatase  34.51 
 
 
506 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136301  hitchhiker  0.00727222 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1753  Ppx/GppA phosphatase  38.6 
 
 
499 aa  272  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3457  Ppx/GppA phosphatase  36.98 
 
 
501 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15102  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5159  Ppx/GppA phosphatase  37.66 
 
 
513 aa  270  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0743  Ppx/GppA family phosphatase  35.31 
 
 
512 aa  270  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3126  Ppx/GppA phosphatase  36.78 
 
 
503 aa  270  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0749  Ppx/GppA family phosphatase  35.31 
 
 
512 aa  268  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2543  Ppx/GppA phosphatase  34.93 
 
 
512 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.223517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3848  Ppx/GppA phosphatase  36.05 
 
 
499 aa  267  4e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5542  Ppx/GppA phosphatase  37.16 
 
 
514 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.886122  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2542  Ppx/GppA phosphatase  32.53 
 
 
533 aa  265  1e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.916187  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1593  Ppx/GppA phosphatase  34.98 
 
 
529 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2114  Ppx/GppA phosphatase  35.99 
 
 
503 aa  263  6e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.21968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1120  Ppx/GppA phosphatase  36.19 
 
 
506 aa  262  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0207  Ppx/GppA phosphatase  35.85 
 
 
523 aa  259  6e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.431649 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0232  Ppx/GppA phosphatase  37.45 
 
 
498 aa  259  6e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2330  Ppx/GppA phosphatase  35.77 
 
 
501 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2068  Ppx/GppA phosphatase  37.92 
 
 
517 aa  258  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0592985 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2342  Ppx/GppA phosphatase  37.92 
 
 
517 aa  258  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2028  Ppx/GppA phosphatase  37.92 
 
 
517 aa  256  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.549232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2951  Ppx/GppA phosphatase  35.73 
 
 
501 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1567  Ppx/GppA phosphatase  35.66 
 
 
505 aa  254  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal  0.290796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0796  Ppx/GppA phosphatase  34.1 
 
 
507 aa  253  7e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.19288  normal  0.41606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2493  Ppx/GppA phosphatase  35.25 
 
 
501 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.170096  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2549  Ppx/GppA phosphatase  38.2 
 
 
495 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1243  Ppx/GppA phosphatase  30.39 
 
 
501 aa  146  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.085362 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1197  Ppx/GppA phosphatase  29 
 
 
502 aa  134  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.639933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1953  Ppx/GppA phosphatase  31.53 
 
 
491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  28.18 
 
 
513 aa  126  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2105  Ppx/GppA phosphatase  23.69 
 
 
497 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000081594  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  28.76 
 
 
502 aa  123  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0592  Ppx/GppA phosphatase  27.89 
 
 
519 aa  118  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1916  Ppx/GppA phosphatase family protein  21.6 
 
 
502 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.050324  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1634  Ppx/GppA phosphatase family protein  21.6 
 
 
502 aa  117  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.505763  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2046  exopolyphosphatase  22.53 
 
 
510 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.941152  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0661  Ppx/GppA phosphatase  28.95 
 
 
489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1691  nucleoside diphosphate kinase  28.23 
 
 
482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0110463  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0402  Ppx/GppA family phosphatase  25.61 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.719278  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1606  Ppx/GppA family phosphatase  25.61 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0377  Ppx/GppA family phosphatase  25.61 
 
 
486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1179  Ppx/GppA phosphatase  24.94 
 
 
507 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0245  phosphatase  27.44 
 
 
492 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.075442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  25.57 
 
 
513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  23.58 
 
 
506 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0748  phosphatase  26.58 
 
 
482 aa  110  8.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.527588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0880  Ppx/GppA phosphatase  28.31 
 
 
513 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000414352 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0978  fumarate reductase  25.94 
 
 
482 aa  108  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0786435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3823  Ppx/GppA phosphatase  25.86 
 
 
524 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0173  phosphatase, Ppx/GppA family  25.65 
 
 
498 aa  105  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.86777  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2163  Ppx/GppA phosphatase  28.18 
 
 
417 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0232  Ppx/GppA phosphatase  27.4 
 
 
488 aa  104  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  27.33 
 
 
500 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  27.33 
 
 
500 aa  103  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  28.1 
 
 
570 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  28.66 
 
 
545 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1140  Ppx/GppA phosphatase family protein  26.09 
 
 
524 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137013  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  30.89 
 
 
307 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06591  putative exopolyphosphatase  28.93 
 
 
548 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4099  Ppx/GppA phosphatase family protein  24.23 
 
 
524 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  27.65 
 
 
539 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0493  Ppx/GppA phosphatase  26.14 
 
 
301 aa  99  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  28.04 
 
 
544 aa  98.6  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  27.63 
 
 
511 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  28.57 
 
 
531 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3517  Ppx/GppA phosphatase  25.2 
 
 
508 aa  98.6  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.380715  normal  0.228242 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  28.35 
 
 
544 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2696  Ppx/GppA phosphatase  25.08 
 
 
512 aa  97.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00554576  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0394  hypothetical protein  27.18 
 
 
303 aa  97.4  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000322771  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  25.33 
 
 
301 aa  97.1  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153349  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0981  Ppx/GppA phosphatase  26.69 
 
 
420 aa  97.1  8e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.883585  normal  0.144641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0574  Ppx/GppA phosphatase  27.95 
 
 
511 aa  96.7  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.289083  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  26.51 
 
 
550 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  24.67 
 
 
312 aa  96.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4116  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.27 
 
 
511 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000884686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  27.3 
 
 
510 aa  95.5  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431495 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0205  Ppx/GppA phosphatase  26.63 
 
 
312 aa  95.5  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  28.25 
 
 
531 aa  95.9  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3752  exopolyphosphatase, Ppx/GppA phosphatase  23.31 
 
 
512 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.319626  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0090  Ppx/GppA phosphatase  27.34 
 
 
288 aa  95.1  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4044  Ppx/GppA phosphatase family protein  23.17 
 
 
512 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.133134  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0657  Ppx/GppA phosphatase  29.21 
 
 
359 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0664  Ppx/GppA phosphatase  29.21 
 
 
359 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0677  Ppx/GppA phosphatase  29.21 
 
 
359 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.482154  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  25.53 
 
 
521 aa  94.4  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3904  Ppx/GppA phosphatase family protein  25.65 
 
 
512 aa  93.6  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.284574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>