22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0477 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2400  hypothetical protein  82.53 
 
 		 498 aa  684    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.330729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2129  hypothetical protein  98.8 
 
 		 498 aa  925    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0477  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  937    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3351  putative membrane protein of unknown function  43.15 
 
 		 491 aa  268  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.881704 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2726  hypothetical protein  41.51 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.313145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0253  hypothetical protein  38.73 
 
 		 493 aa  226  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4020  hypothetical protein  31.57 
 
 		 536 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.905898  normal  0.886685 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1627  dienelactone hydrolase  36.22 
 
 		 526 aa  192  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.776343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1522  dienelactone hydrolase  36.46 
 
 		 512 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1690  dienelactone hydrolase  32.13 
 
 		 534 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3774  hypothetical protein  31.67 
 
 		 533 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113955  normal  0.0693003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1247  hypothetical protein  31.66 
 
 		 546 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000443968 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2066  dienelactone hydrolase  38.67 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.399368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3970  hypothetical protein  30.92 
 
 		 501 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0757024 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4116  hypothetical protein  29.9 
 
 		 363 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173783  normal  0.516746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  30.7 
 
 		 295 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3471  alpha/beta hydrolase fold protein  32.43 
 
 		 272 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.525161  normal  0.0346812 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01664  hydrolase, alpha/beta fold family, putative  34.38 
 
 		 272 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.178176  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  31.58 
 
 		 408 aa  45.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  34.51 
 
 		 268 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0890  putative lipase  32.14 
 
 		 310 aa  43.5  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.120136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7821  alpha/beta hydrolase fold protein  47.92 
 
 		 290 aa  43.5  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>