102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2157 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_2157  metallophosphoesterase  100 
 
 
282 aa  584  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578291  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2312  metallophosphoesterase  98.58 
 
 
282 aa  577  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3794  metallophosphoesterase  80.14 
 
 
292 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.968955  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0863  metallophosphoesterase  39.02 
 
 
255 aa  171  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4142  metallophosphoesterase  37.23 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.377726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0020  metallophosphoesterase  36.68 
 
 
279 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0506  metallophosphoesterase  36.79 
 
 
255 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0414346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0522  metallophosphoesterase  36.07 
 
 
255 aa  158  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4064  metallophosphoesterase  37.81 
 
 
424 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5708  metallophosphoesterase  37.1 
 
 
424 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5904  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
282 aa  148  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.452182  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1997  metallophosphoesterase  36.1 
 
 
252 aa  146  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.654856  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5903  metallophosphoesterase  36.11 
 
 
276 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0647  hypothetical protein  36.79 
 
 
247 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0031  Ser/Thr protein phosphatase family protein  34.17 
 
 
245 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07060  hypothetical protein  36.2 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1688  metallophosphoesterase  34.4 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2928  metallophosphoesterase  34.4 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4805  metallophosphoesterase  34.43 
 
 
242 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.922501  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4971  metallophosphoesterase  35.11 
 
 
277 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.840085  normal  0.403662 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4597  metallophosphoesterase  35.59 
 
 
276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.152399  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3779  metallophosphoesterase  34.77 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1863  metallophosphoesterase  36.68 
 
 
276 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000553362 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1350  calcineurin-like phosphoesterase  34.63 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.182171 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1373  metallophosphoesterase  35.91 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1333  metallophosphoesterase  35.91 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.679785  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1430  metallophosphoesterase  34.92 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847062  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1579  metallophosphoesterase  34.18 
 
 
280 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1359  metallophosphoesterase  33.22 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.943813  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2777  metallophosphoesterase  34.28 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0308  phosphoesterase, related to the Icc protein  32.39 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0970  metallophosphoesterase  34.24 
 
 
276 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.633735  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1452  metallophosphoesterase  34.24 
 
 
276 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116603  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2650  metallophosphoesterase  34.36 
 
 
261 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0184  metallophosphoesterase  34.13 
 
 
276 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04070  Metallophosphoesterase  33.69 
 
 
251 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.529972  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1056  metallophosphoesterase  32.86 
 
 
255 aa  123  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2593  metallophosphoesterase  37.59 
 
 
257 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0018  metallophosphoesterase  31.96 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.275783  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1669  metallophosphoesterase  29.19 
 
 
265 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.129367  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0945  metallophosphoesterase  28.47 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215269  normal  0.228803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1156  metallophosphoesterase  30.6 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0638  metallophosphoesterase  33.33 
 
 
262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.320344 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2144  calcineurin-like phosphoesterase  34.88 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4844  metallophosphoesterase  31.42 
 
 
263 aa  113  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2741  metallophosphoesterase  27.66 
 
 
284 aa  112  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1489  metallo-phosphoesterase  29.19 
 
 
270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.473734 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1703  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.79 
 
 
323 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0938  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.12 
 
 
327 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.33942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0410  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.12 
 
 
327 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.857089  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1681  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.12 
 
 
327 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0752  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.12 
 
 
327 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.325928  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0948  metallophosphoesterase  30.66 
 
 
266 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3342  metallophosphoesterase  32.08 
 
 
270 aa  106  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0143  metallophosphoesterase  32.3 
 
 
268 aa  106  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1858  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.15 
 
 
331 aa  105  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1471  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.82 
 
 
327 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1419  metallophosphoesterase  28.04 
 
 
263 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2622  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.52 
 
 
304 aa  103  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.210089  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3683  metallophosphoesterase  30.03 
 
 
278 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.369528  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1509  metallophosphoesterase  34.43 
 
 
294 aa  99.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3755  metallophosphoesterase  32.78 
 
 
282 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0766449  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5707  metallophosphoesterase  32.76 
 
 
338 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.155019  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3446  metallophosphoesterase  32.89 
 
 
282 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0953452 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3644  metallophosphoesterase  32.88 
 
 
282 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.700666  normal  0.0436648 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5670  metallophosphoesterase  30.19 
 
 
339 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0155  metallophosphoesterase  29.97 
 
 
311 aa  95.1  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.118125  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0099  metallophosphoesterase  28.25 
 
 
316 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0787528  normal  0.210134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4063  metallophosphoesterase  30.19 
 
 
338 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0135  metallophosphoesterase  29.87 
 
 
283 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5971  metallophosphoesterase  31.91 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.110891  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0506  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.28 
 
 
262 aa  89.4  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.445346  normal  0.244405 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0111  metallophosphoesterase  28.38 
 
 
299 aa  87  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4759  hypothetical protein  30.57 
 
 
174 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1981  metallophosphoesterase  29.71 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0094  metallophosphoesterase  26.64 
 
 
281 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0075  metallophosphoesterase  26.49 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.511532  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1930  metallophosphoesterase  27.99 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0646  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.4 
 
 
262 aa  81.3  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.511838 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5193  metallophosphoesterase  31.58 
 
 
294 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.559968  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0785  metallophosphoesterase  28.18 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.449646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0651  metallophosphoesterase  25.95 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3654  metallophosphoesterase  28.86 
 
 
265 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2590  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5429  metallophosphoesterase  28.57 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1374  metallophosphoesterase  24.73 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4143  hypothetical protein  27.55 
 
 
605 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0059  metallophosphoesterase  27.73 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.71748 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1933  Ser/Thr protein phosphatase family protein  25.34 
 
 
262 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5043  metallophosphoesterase  28.36 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.322603  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3701  calcineurin-like phosphoesterase  28.04 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.573997 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2932  hypothetical protein  27.8 
 
 
213 aa  62.4  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.118834 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0961  phosphoesterase  35.77 
 
 
158 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.286204  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0821  hypothetical protein  35.77 
 
 
158 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4241  putative metallophosphoesterase  31.06 
 
 
174 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.202745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2453  hypothetical protein  32.12 
 
 
251 aa  52.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.187764  n/a   
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3577  metallophosphoesterase  27.24 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00161891  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5285  metallophosphoesterase  28.66 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.696837  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1678  serine/threonine protein phosphatase family protein  30.95 
 
 
253 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.854416  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0497  metallophosphoesterase  34.88 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>