30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1107 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1004  teichoic acid export membrane protein  80.89 
 
 		 450 aa  681    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1107  putative membrane protein involved in export of O-antigen  100 
 
 		 450 aa  897    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5069  Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid-like protein  73.56 
 
 		 489 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  24.24 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2996  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.2 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2754  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 		 460 aa  63.2  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.316209  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  27.92 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0890  polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 		 471 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4001  polysaccharide biosynthesis protein  22.72 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.443077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3553  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1391  polysaccharide biosynthesis protein  22.28 
 
 		 456 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  21.99 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1411  polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 		 456 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0987  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 		 458 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.676741 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4685  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5327  polysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 		 445 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0472551  normal  0.0858273 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  28.05 
 
 		 499 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 423 aa  47.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6968  PST family polysaccharide export protein  21.77 
 
 		 458 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2373  polysaccharide biosynthesis protein  25.95 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.308358  hitchhiker  0.00106477 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  24.72 
 
 		 467 aa  47  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  25.16 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  26.07 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0926  polysaccharide biosynthesis protein  23.72 
 
 		 458 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.287187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0950  polysaccharide biosynthesis protein  28.89 
 
 		 458 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0259794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 		 583 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5559  polysaccharide biosynthesis protein  23.14 
 
 		 442 aa  43.5  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>