26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0921 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0921  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  301  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.38389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2943  hypothetical protein  90.13 
 
 		 152 aa  259  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3124  hypothetical protein  80.65 
 
 		 155 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2343  hypothetical protein  38.84 
 
 		 241 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.400558 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0739  hypothetical protein  34.62 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371354  normal  0.125366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3157  hypothetical protein  36.36 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2938  hypothetical protein  38.14 
 
 		 280 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1811  hypothetical protein  33.33 
 
 		 218 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.603279  normal  0.334623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4116  hypothetical protein  35.83 
 
 		 219 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252565  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2839  hypothetical protein  41.9 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1388  hypothetical protein  43.16 
 
 		 209 aa  67  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610976 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2997  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  41.94 
 
 		 179 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.388571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2714  hypothetical protein  32.43 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5590  hypothetical protein  43.01 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.386943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1368  hypothetical protein  42.2 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2337  hypothetical protein  36.13 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2263  putative exported protein of unknown function  33.33 
 
 		 199 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3231  hypothetical protein  35.14 
 
 		 185 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.114974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6040  hypothetical protein  36.46 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3214  hypothetical protein  37.11 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3326  hypothetical protein  32.43 
 
 		 211 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.321018 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1695  hypothetical protein  27.64 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.307378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2116  hypothetical protein  35.42 
 
 		 210 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0278262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0023  hypothetical protein  32 
 
 		 184 aa  44.3  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4587  hypothetical protein  36.46 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0375188  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4908  hypothetical protein  33.33 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>