41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1259 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1259  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  648    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.909105  normal  0.0175405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3768  alpha/beta hydrolase fold  72.93 
 
 		 317 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0122064 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4013  Alpha/beta hydrolase  71.02 
 
 		 317 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377921  normal  0.0298464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1697  alpha/beta hydrolase fold  68.89 
 
 		 317 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0294365  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6447  putative alpha/beta hydrolase fold  54.64 
 
 		 322 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.794257 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1405  alpha/beta hydrolase fold  54.15 
 
 		 331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.301031  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1220  Alpha/beta hydrolase  49.67 
 
 		 327 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.438077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1321  alpha/beta hydrolase fold  51.7 
 
 		 327 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0258  alpha/beta hydrolase fold  49.53 
 
 		 329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.125918  normal  0.242066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4635  putative alpha/beta hydrolase fold protein  51.16 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.709746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2882  alpha/beta hydrolase fold  50.67 
 
 		 342 aa  281  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.652094  normal  0.31238 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4268  putative alpha/beta hydrolase fold  51.88 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.489115  normal  0.522453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4783  putative alpha/beta hydrolase fold  51.19 
 
 		 342 aa  276  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.878297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5702  alpha/beta hydrolase fold  46.13 
 
 		 342 aa  245  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  hitchhiker  0.00380393 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0565  alpha/beta hydrolase fold  37.54 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2807  alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.16124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2157  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.048331  hitchhiker  0.0048272 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2969  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 327 aa  88.2  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248343  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4130  alpha/beta hydrolase fold  29.36 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608421 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2474  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 340 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2288  Alpha/beta hydrolase fold  26.73 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0898  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  29.65 
 
 		 327 aa  72.8  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1914  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 289 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000204003  unclonable  0.0000086861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.42 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0512  alpha/beta hydrolase fold protein  26.62 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.106161  normal  0.950535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3062  hypothetical protein  25.32 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  23.1 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  23.03 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3223  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3531  alpha/beta hydrolase fold protein  25.47 
 
 		 329 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.290128  normal  0.539158 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.05 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01651  putative alpha/beta hydrolase superfamily  26.83 
 
 		 288 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4208  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 268 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3797  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 248 aa  46.6  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.04 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  37.68 
 
 		 277 aa  43.5  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.7 
 
 		 308 aa  43.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>