More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0631 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0631  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 		 333 aa  694    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1370  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  79.28 
 
 		 331 aa  557  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.65 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0292  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.76 
 
 		 290 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3339  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 		 253 aa  122  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0689517 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6891  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 		 256 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2934  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.79 
 
 		 255 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0368  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.65 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.585448  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6912  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.85 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.131437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  31.88 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.31 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  29.37 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3284  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.08 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  27.31 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5354  enoyl-CoA hydratase  31.31 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.5 
 
 		 268 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5507  enoyl-CoA hydratase  31.31 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0151  enoyl-CoA hydratase  28.44 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.236072 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1457  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.79 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.221294  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1419  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.77 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.317109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2796  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.538415 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4765  enoyl-CoA hydratase  31.31 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.991647  normal  0.447028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.69 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  26.36 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1991  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.54 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.19767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  28.93 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0345  enoyl-CoA hydratase  27.47 
 
 		 277 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.918373  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  27.46 
 
 		 266 aa  67  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1014  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.67 
 
 		 269 aa  67  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.108431 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  28.9 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  29.79 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.61 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1700  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.67 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.672867  hitchhiker  0.0000387176 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0484  enoyl-CoA hydratase  24.63 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.056437 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6511  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.305352  normal  0.309603 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2162  enoyl-CoA hydratase  25.1 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0321  1,4-dihydroxy-2-naphthoate synthase  28.76 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.303532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0603  enoyl-CoA hydratase  25.11 
 
 		 326 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.383469  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 		 262 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3255  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.57 
 
 		 262 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.574629 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0439  enoyl-CoA hydratase  25.11 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  28.77 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2960  enoyl-CoA hydratase  23.79 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2823  enoyl-CoA hydratase  24.21 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2877  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.48 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0257108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  23.88 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0076  enoyl-CoA hydratase  25.11 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.426099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0244  enoyl-CoA hydratase  25.11 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4233  enoyl-CoA hydratase  24.41 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0420  enoyl-CoA hydratase  25.11 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.411652  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3213  enoyl-CoA hydratase  25.11 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1350  enoyl-CoA hydratase  25.11 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0835186  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  26.9 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0087  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.4 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1958  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.59 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0071566  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6835  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.12 
 
 		 264 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.51 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4553  enoyl-CoA hydratase  25.48 
 
 		 261 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0511055  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  25 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6254  enoyl-CoA hydratase  23.81 
 
 		 275 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2926  enoyl-CoA hydratase  23.81 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.902706  normal  0.995806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4964  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.32 
 
 		 273 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143968  normal  0.90193 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2297  enoyl-CoA hydratase  24.46 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201677  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2911  enoyl-CoA hydratase  24.46 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210869  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  27.04 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2090  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.26 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0323462  normal  0.4563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4579  enoyl-CoA hydratase  23.81 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781565  normal  0.154982 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0166  enoyl-CoA hydratase  24.27 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.5 
 
 		 254 aa  57  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0198  enoyl-CoA hydratase  24.02 
 
 		 286 aa  57  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1587  enoyl-CoA hydratase  25.56 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1563  enoyl-CoA hydratase  25.56 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4399  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.94 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4486  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.94 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4780  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.94 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0159  enoyl-CoA hydratase  24.07 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  27.39 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2625  enoyl-CoA hydratase-isomerase  27.23 
 
 		 257 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0860819 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0598  enoyl-CoA hydratase  25.79 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  23.16 
 
 		 268 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  29.59 
 
 		 269 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0080  enoyl-CoA hydratase  23.95 
 
 		 275 aa  55.8  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0577  enoyl-CoA hydratase  25.79 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.93 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  25 
 
 		 267 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0304  enoyl-CoA hydratase  23.85 
 
 		 272 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2705  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.64 
 
 		 262 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1899  enoyl-CoA hydratase  30.26 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287006  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0297  enoyl-CoA hydratase  33.13 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0316  enoyl-CoA hydratase  33.13 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1822  enoyl-CoA hydratase  23.02 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0818763  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2921  enoyl-CoA hydratase  27.54 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  27.07 
 
 		 258 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0393  enoyl-CoA hydratase  22.62 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.350305  normal  0.0100997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  22.32 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0306  enoyl-CoA hydratase  33.13 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.630829  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  25.24 
 
 		 268 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1533  enoyl-CoA hydratase  30.28 
 
 		 257 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.789962  normal  0.411543 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  23.58 
 
 		 267 aa  54.3  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>