More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0296 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0296  dephospho-CoA kinase  100 
 
 		 199 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0302  dephospho-CoA kinase  83.33 
 
 		 199 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.747826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0397  dephospho-CoA kinase  81.31 
 
 		 199 aa  329  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.523463 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0159  dephospho-CoA kinase  77.89 
 
 		 199 aa  317  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0114  dephospho-CoA kinase  79.8 
 
 		 199 aa  317  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147885  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0424  dephospho-CoA kinase  79.26 
 
 		 199 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0104  dephospho-CoA kinase  75.38 
 
 		 199 aa  287  8e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.118217 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0850  dephospho-CoA kinase  58.97 
 
 		 222 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3481  dephospho-CoA kinase  56.15 
 
 		 194 aa  230  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1830  dephospho-CoA kinase  59.8 
 
 		 200 aa  230  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.037258 
 
 
-
 
NC_004310  BR2070  dephospho-CoA kinase  55.9 
 
 		 200 aa  222  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1990  dephospho-CoA kinase  55.38 
 
 		 200 aa  220  8e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2538  dephospho-CoA kinase  56.91 
 
 		 201 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3197  dephospho-CoA kinase  54.27 
 
 		 211 aa  214  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.189898  normal  0.0250351 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4264  dephospho-CoA kinase  53.44 
 
 		 203 aa  209  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.914249  normal  0.426289 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3212  dephospho-CoA kinase  53.19 
 
 		 194 aa  207  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1488  dephospho-CoA kinase  56.61 
 
 		 217 aa  204  7e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0833932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0005  dephospho-CoA kinase  51.08 
 
 		 195 aa  203  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1766  dephospho-CoA kinase  56.08 
 
 		 217 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.215779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3938  dephospho-CoA kinase  51.85 
 
 		 203 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.39098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5012  dephospho-CoA kinase  56.84 
 
 		 207 aa  194  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1488  dephospho-CoA kinase  53.61 
 
 		 206 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0808878  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1253  dephospho-CoA kinase  52.6 
 
 		 208 aa  187  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4284  dephospho-CoA kinase  54.5 
 
 		 212 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00917274 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2977  dephospho-CoA kinase  50.27 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0114  dephospho-CoA kinase  51.05 
 
 		 201 aa  175  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1034  dephospho-CoA kinase  53.4 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1276  dephospho-CoA kinase  52.88 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2672  dephospho-CoA kinase  50 
 
 		 197 aa  168  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.152116  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0195  dephospho-CoA kinase  51.15 
 
 		 194 aa  166  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3385  dephospho-CoA kinase  48.86 
 
 		 204 aa  165  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.31936 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2896  dephospho-CoA kinase  49.47 
 
 		 197 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0215113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1235  dephospho-CoA kinase  49.47 
 
 		 197 aa  164  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2814  dephospho-CoA kinase  47.72 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40654  predicted protein  47.92 
 
 		 201 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.114893  normal  0.0526833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2829  dephospho-CoA kinase  46.35 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3449  dephospho-CoA kinase  43.88 
 
 		 198 aa  157  8e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0005  dephospho-CoA kinase  41.84 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00364709  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2859  dephospho-CoA kinase  46.52 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.68987  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2839  dephospho-CoA kinase  47.57 
 
 		 207 aa  150  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2760  dephospho-CoA kinase  48.69 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3612  dephospho-CoA kinase  47.78 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2777  dephospho-CoA kinase  41.97 
 
 		 211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.03803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2684  dephospho-CoA kinase  43.01 
 
 		 211 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2870  dephospho-CoA kinase  41.97 
 
 		 211 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2472  dephospho-CoA kinase  36.51 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.73797e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0789  dephospho-CoA kinase  40.62 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0594  dephospho-CoA kinase  34.9 
 
 		 197 aa  118  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1583  dephospho-CoA kinase  38.46 
 
 		 192 aa  118  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.311661  normal  0.292339 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2675  dephospho-CoA kinase  43.89 
 
 		 210 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597099  normal  0.0402246 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0189  dephospho-CoA kinase  37.23 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4223  dephospho-CoA kinase  40.21 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2215  dephospho-CoA kinase  37.97 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0501  dephospho-CoA kinase  37.89 
 
 		 200 aa  110  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.197247 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0828  dephospho-CoA kinase  42.93 
 
 		 219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0185  kinase, putative  37.23 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0020  dephospho-CoA kinase  37.06 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3455  dephospho-CoA kinase  37.89 
 
 		 200 aa  108  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11135  hitchhiker  0.00293873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0657  dephospho-CoA kinase  35.96 
 
 		 206 aa  108  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00457221  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1419  dephospho-CoA kinase  29.23 
 
 		 198 aa  108  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000153204  hitchhiker  0.000000000230419 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2671  dephospho-CoA kinase  33.85 
 
 		 199 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177736  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3462  dephospho-CoA kinase  31 
 
 		 198 aa  107  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0035973  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0677  dephospho-CoA kinase  31.02 
 
 		 297 aa  107  1e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.347634  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0478  dephospho-CoA kinase  41.98 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.56306  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2023  dephospho-CoA kinase  38.31 
 
 		 210 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0993224  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0503  dephospho-CoA kinase  41.36 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.206836  normal  0.43555 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3656  dephospho-CoA kinase  37.63 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.248965  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0366  dephospho-CoA kinase  32.28 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153347  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0108  dephospho-CoA kinase  32.43 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0670  dephospho-CoA kinase  34.8 
 
 		 207 aa  107  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.0684500000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3660  dephospho-CoA kinase  40.74 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528577  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0513  dephospho-CoA kinase  38.33 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167933  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1193  dephospho-CoA kinase  29.53 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.53954  normal  0.175104 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1133  dephospho-CoA kinase  37.62 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1121  dephospho-CoA kinase  32.99 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.22108  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2367  dephospho-CoA kinase  41.27 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.124254 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2184  dephospho-CoA kinase  35.5 
 
 		 205 aa  105  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000448141  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0529  dephospho-CoA kinase  33.68 
 
 		 206 aa  105  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0277  dephospho-CoA kinase  29.32 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1245  dephospho-CoA kinase  35.91 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000344021  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2728  dephospho-CoA kinase  35 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.652095  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1022  dephospho-CoA kinase  36.6 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2658  dephospho-CoA kinase  36.27 
 
 		 200 aa  101  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0413  dephospho-CoA kinase  32.26 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3509  dephospho-CoA kinase  37.78 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2534  dephospho-CoA kinase  37.78 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3530  dephospho-CoA kinase  37.78 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0456  dephospho-CoA kinase  37.78 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3248  dephospho-CoA kinase  37.78 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1314  dephospho-CoA kinase  37.78 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4715  dephospho-CoA kinase  32.63 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000225461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1596  dephospho-CoA kinase  34.22 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.956667  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3534  dephospho-CoA kinase  37.78 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0093  dephospho-CoA kinase  38.64 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3786  dephospho-CoA kinase  30.65 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1788  dephospho-CoA kinase  37.25 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0575  dephospho-CoA kinase  38.64 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121049  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0416  dephospho-CoA kinase  31.91 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.367029  hitchhiker  0.000957115 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3709  dephospho-CoA kinase  38.82 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0544  dephospho-CoA kinase  32.63 
 
 		 200 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000847962  hitchhiker  1.1531e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>