55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0443 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  41.52 
 
 		 1051 aa  650    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  42.54 
 
 		 1816 aa  692    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  40.65 
 
 		 1067 aa  662    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  40.52 
 
 		 1188 aa  682    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  41.81 
 
 		 1221 aa  704    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  41.81 
 
 		 1061 aa  667    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  39.16 
 
 		 1219 aa  706    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  43.33 
 
 		 1341 aa  702    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  40.71 
 
 		 1194 aa  656    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  100 
 
 		 1057 aa  2155    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  41.41 
 
 		 2007 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  42.15 
 
 		 1101 aa  620  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  42.15 
 
 		 1092 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  40.3 
 
 		 1100 aa  595  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  37.07 
 
 		 1133 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  32.44 
 
 		 2900 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  32.82 
 
 		 2899 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 3238 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  35.15 
 
 		 1103 aa  385  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  32.89 
 
 		 2140 aa  383  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  33.07 
 
 		 3006 aa  381  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  33.59 
 
 		 3521 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 3286 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  30.35 
 
 		 1543 aa  358  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  35.26 
 
 		 1137 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  35.6 
 
 		 1132 aa  337  9e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  35.1 
 
 		 1132 aa  335  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  35.1 
 
 		 1132 aa  335  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  35.43 
 
 		 1159 aa  336  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  31.77 
 
 		 1116 aa  333  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  34.77 
 
 		 1159 aa  331  4e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  31.67 
 
 		 1116 aa  330  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  29.66 
 
 		 1059 aa  326  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  33.44 
 
 		 1120 aa  319  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  33.44 
 
 		 1120 aa  319  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  32.91 
 
 		 1157 aa  314  4.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  32.96 
 
 		 1157 aa  313  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  33.1 
 
 		 1158 aa  313  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  33.1 
 
 		 1158 aa  313  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  32.31 
 
 		 1157 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  34.6 
 
 		 1159 aa  308  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  34.6 
 
 		 1159 aa  307  9.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  35.8 
 
 		 522 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  37.38 
 
 		 1012 aa  270  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  36.31 
 
 		 881 aa  203  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  33.01 
 
 		 951 aa  153  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  24.55 
 
 		 960 aa  143  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  34.41 
 
 		 837 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3094  hypothetical protein  37.14 
 
 		 348 aa  67.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  22.19 
 
 		 918 aa  60.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1446  fibronectin, type III domain-containing protein  27.62 
 
 		 1089 aa  59.3  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  19.03 
 
 		 1644 aa  50.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3156  hypothetical protein  31.25 
 
 		 934 aa  47.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.837395 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5439  hypothetical protein  41.57 
 
 		 1172 aa  46.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.861943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6221  hypothetical protein  48.94 
 
 		 729 aa  45.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>