23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4608 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4608  phage integrase family protein  100 
 
 		 326 aa  662    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0746  Phage integrase  68.92 
 
 		 326 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4936  phage integrase  66.46 
 
 		 326 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0598447  hitchhiker  0.0000000940352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0686  phage integrase  64.81 
 
 		 326 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00180883  unclonable  0.0000000000000101632 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0938  hypothetical protein  37.35 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.404777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1587  phage integrase family protein  32.24 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0833  hypothetical protein  28.79 
 
 		 298 aa  99.4  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1324  hypothetical protein  28.38 
 
 		 306 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12189  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01684  hypothetical protein  25.63 
 
 		 337 aa  67  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3859  putative integrase  32.77 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2404  hypothetical protein  33.6 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4165  phage integrase, N-terminal SAM-like protein  27.53 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.503266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1553  hypothetical protein  28.74 
 
 		 487 aa  50.8  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.774815 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4486  hypothetical protein  29.08 
 
 		 534 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4962  hypothetical protein  29.12 
 
 		 487 aa  50.1  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2496  hypothetical protein  35 
 
 		 298 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52320  integrase  45.71 
 
 		 287 aa  49.7  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.554417  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  25.09 
 
 		 316 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0627  putative integrase  32.16 
 
 		 288 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1013  hypothetical protein  31.48 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1048  hypothetical protein  31.48 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2540  integrase family protein  27.81 
 
 		 350 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4043  putative integrase  28.24 
 
 		 287 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>