More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1882 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1882  ABC transporter related  100 
 
 		 279 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.573524  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3251  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  76.62 
 
 		 279 aa  441  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0275021  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3864  ABC transporter related  72.53 
 
 		 295 aa  411  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4041  ABC transporter related protein  72.16 
 
 		 295 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3368  ABC transporter related  72.89 
 
 		 297 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3534  ABC transporter related  73.02 
 
 		 295 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.463988 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2703  ABC transporter related  69.6 
 
 		 287 aa  395  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5439  ABC transporter related  61.51 
 
 		 285 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.476246  hitchhiker  0.0038839 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5170  ABC transporter related  60.57 
 
 		 285 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.219608  normal  0.319827 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3091  ABC transporter related  60.79 
 
 		 287 aa  354  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0035  ABC transporter related  59.78 
 
 		 285 aa  342  5e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00363386  normal  0.320006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2323  ABC transporter related  61.62 
 
 		 277 aa  342  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.936398 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1027  dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  59.56 
 
 		 291 aa  338  8e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.26315  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3990  ABC transporter related  58.03 
 
 		 276 aa  337  9.999999999999999e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3885  ABC transporter  58.7 
 
 		 277 aa  332  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1920  ABC transporter component  60.15 
 
 		 276 aa  329  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0138  ABC transporter related  57.2 
 
 		 276 aa  329  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4177  ABC transporter related  58.3 
 
 		 277 aa  329  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3849  ABC transporter related  57.93 
 
 		 277 aa  328  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.997638 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1903  ABC transporter related  57.56 
 
 		 277 aa  325  4.0000000000000003e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264494  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1251  ABC transporter related  57.93 
 
 		 284 aa  317  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2717  ABC transporter related  58.8 
 
 		 279 aa  316  3e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0375  ABC transporter related  56.46 
 
 		 274 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.157561  normal  0.579699 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2462  ABC transporter related  56.46 
 
 		 274 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.612548  normal  0.124723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0804  ABC dipeptide transporter, ATPase subunit DppD  56.46 
 
 		 274 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.69273  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3832  ABC transporter related  57.35 
 
 		 280 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.817561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3738  ABC transporter related  53.11 
 
 		 276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0710924  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4053  ABC transporter related  55.47 
 
 		 301 aa  298  9e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.149041  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4007  ABC transporter related  55.84 
 
 		 297 aa  296  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7647  ABC transporter related  53.82 
 
 		 291 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5711  ABC transporter related  55.11 
 
 		 304 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0661262 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3774  ABC transporter related  55.11 
 
 		 304 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4594  ABC transporter related  55.11 
 
 		 304 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.254879  normal  0.570129 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2043  ABC transporter related  55.88 
 
 		 276 aa  292  4e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.336265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1250  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  55.11 
 
 		 304 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4020  ABC transporter related  54.29 
 
 		 304 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4482  ABC transporter related  55.11 
 
 		 304 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.959295 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6304  ABC transporter related  54.91 
 
 		 292 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0194  peptide/opine/nickel ABC transporter ATPase  57.2 
 
 		 296 aa  288  8e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0233708 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1277  ABC transporter, ATP-binding protein  55.64 
 
 		 293 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846067  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  55.64 
 
 		 293 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0250  ABC transporter, ATP-binding protein  55.64 
 
 		 293 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0521  ABC transporter, ATP-binding protein  55.64 
 
 		 293 aa  284  9e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.939776  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1445  ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1308  ABC transporter, ATP-binding protein  55.27 
 
 		 293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0652042  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1389  ABC transporter, ATP-binding protein  54.91 
 
 		 293 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0826888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2558  ABC transporter, ATP-binding protein  54.91 
 
 		 293 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1881  ABC transporter related  53.68 
 
 		 281 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176759  normal  0.192809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1695  ABC transporter related  52.92 
 
 		 286 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.930247  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3382  ABC transporter related  48.18 
 
 		 274 aa  256  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3201  ABC transporter related  47.25 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2913  ABC transporter-related protein  46.82 
 
 		 278 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2059  ABC transporter related  44.19 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113348  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0802  ABC transporter component  49.24 
 
 		 276 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.051347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.24 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.555645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1553  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.17 
 
 		 342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1870  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  45.08 
 
 		 333 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0687438  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4046  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.87 
 
 		 353 aa  233  3e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2573  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  45.11 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.194756  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2264  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  45.11 
 
 		 333 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1163  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.09 
 
 		 329 aa  232  5e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0503612  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2764  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.71 
 
 		 336 aa  231  9e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.636824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3115  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  45.88 
 
 		 671 aa  231  9e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.426861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  45.31 
 
 		 543 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0234  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.18 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0764  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  48.44 
 
 		 392 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1712  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.74 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000540803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0272  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.48 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4407  oligopeptide transporter ATP-binding component  43.54 
 
 		 329 aa  230  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4963  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  47.55 
 
 		 340 aa  230  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0355569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1826  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.92 
 
 		 333 aa  229  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0212  hypothetical protein  45.49 
 
 		 334 aa  229  3e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0203  hypothetical protein  45.49 
 
 		 334 aa  229  3e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0091  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 		 609 aa  229  5e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1630  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.74 
 
 		 333 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.04 
 
 		 357 aa  228  7e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003660  oligopeptide transport ATP-binding protein OppD  43.17 
 
 		 327 aa  228  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1102  ABC transporter related  43.84 
 
 		 278 aa  228  8e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 		 543 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4554  ABC transporter related  46.59 
 
 		 670 aa  227  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2969  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  46.3 
 
 		 341 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0804764  normal  0.623944 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.53 
 
 		 353 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3727  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.26 
 
 		 665 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0452  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.94 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3308  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  44.89 
 
 		 346 aa  226  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0579  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.32 
 
 		 351 aa  226  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8931  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  46.18 
 
 		 345 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1864  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 350 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429685  normal  0.131227 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  46.48 
 
 		 539 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0313  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.04 
 
 		 332 aa  225  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0320  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.74 
 
 		 322 aa  225  6e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.173398 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3821  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.92 
 
 		 332 aa  225  6e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.282595  normal  0.751344 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.15 
 
 		 336 aa  225  6e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12580  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.64 
 
 		 359 aa  225  7e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.218091 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  44.32 
 
 		 539 aa  224  8e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0671  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  45.02 
 
 		 321 aa  225  8e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0065  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 		 371 aa  224  9e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1243  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  45.77 
 
 		 320 aa  224  9e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143149  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0759  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 353 aa  224  9e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>