More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2809 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2809  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
239 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.309944  normal  0.926456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3594  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  96.64 
 
 
239 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2178  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  96.64 
 
 
239 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.142027  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2322  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  95.8 
 
 
239 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.893058  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0597  amino acid ABC transporter, permease protein  55.74 
 
 
240 aa  246  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0884053  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2290  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  52.16 
 
 
268 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142141  normal  0.98078 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.72 
 
 
268 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28022  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1589  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.22 
 
 
267 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1563  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  50.22 
 
 
237 aa  222  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.086799  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2236  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.35 
 
 
240 aa  220  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0953  amino acid ABC transporter, permease protein  49.56 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2065  ABC transporter membrane spanning protein (amino acid)  47.37 
 
 
267 aa  211  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1114  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  43.69 
 
 
229 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384644  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6914  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.46 
 
 
241 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5921  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
241 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.610786  normal  0.165756 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7394  ABC transporter membrane spanning protein  38.05 
 
 
240 aa  158  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.330237  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0328  amino acid ABC transporter permease  40.37 
 
 
244 aa  155  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4285  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.2 
 
 
225 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0276895  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.07 
 
 
246 aa  155  6e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0297  ABC basic amino acid transporter, inner membrane subunit  40.37 
 
 
244 aa  154  9e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4840  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  42.2 
 
 
225 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.545995  normal  0.251621 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6801  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.74 
 
 
225 aa  150  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.793236  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1926  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.09 
 
 
228 aa  150  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7240  ABC transporter membrane spanning protein (nopaline)  36.91 
 
 
256 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0593694  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02233  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  36.57 
 
 
228 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1348  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.57 
 
 
228 aa  148  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.120013  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3990  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.81 
 
 
229 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.456811 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02193  hypothetical protein  36.57 
 
 
228 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3774  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.27 
 
 
229 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134573  hitchhiker  0.00153221 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4485  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  38.81 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1430  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.81 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0905208  normal  0.971438 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2458  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  36.57 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2602  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  36.57 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.311053  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2464  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  36.57 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.796861  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3448  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  36.57 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.869706  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2686  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  36.11 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1344  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.57 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.917469  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3519  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.9 
 
 
240 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.405389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0310  amino acid ABC transporter permease  45 
 
 
231 aa  144  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193986  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2252  amino acid ABC transporter permease  38.22 
 
 
232 aa  144  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1378  arginine transporter permease subunit ArtQ  41.23 
 
 
238 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001574  arginine ABC transporter permease protein ArtQ  38.71 
 
 
229 aa  144  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.552599  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05530  arginine transporter permease subunit ArtQ  38.71 
 
 
229 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00867  arginine transporter subunit  39.91 
 
 
238 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.202852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0935  arginine transporter permease subunit ArtQ  39.91 
 
 
238 aa  142  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2780  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.91 
 
 
238 aa  142  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00967955  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0966  arginine transporter permease subunit ArtQ  39.91 
 
 
238 aa  142  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00873  hypothetical protein  39.91 
 
 
238 aa  142  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.202246  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0890  arginine transporter permease subunit ArtQ  39.91 
 
 
238 aa  142  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5101  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.2 
 
 
240 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381438  decreased coverage  0.00220155 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2469  arginine transporter permease subunit ArtQ  40.35 
 
 
238 aa  142  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.391563  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2734  arginine transporter permease subunit ArtQ  39.91 
 
 
238 aa  142  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0586836  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1581  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.97 
 
 
238 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2712  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.97 
 
 
238 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2627  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.97 
 
 
238 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.204375  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2494  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  36.11 
 
 
228 aa  141  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.174518  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1022  arginine transporter permease subunit ArtQ  39.47 
 
 
238 aa  142  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0993  arginine transporter permease subunit ArtQ  39.47 
 
 
238 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1827  arginine/ornithine ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
229 aa  141  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.883387  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0926  arginine transporter permease subunit ArtQ  39.47 
 
 
238 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.412131  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3570  amino acid ABC transporter permease  35.4 
 
 
229 aa  141  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.906452  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2789  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.23 
 
 
229 aa  141  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.113989  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1043  arginine transporter permease subunit ArtQ  39.47 
 
 
238 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0961  arginine transporter permease subunit ArtQ  39.47 
 
 
238 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1024  arginine transporter permease subunit ArtQ  39.47 
 
 
238 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2594  histidine ABC transporter permease HisQ  36.11 
 
 
228 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2703  histidine ABC transporter permease HisQ  36.11 
 
 
228 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003971  arginine/ornithine ABC transporter permease protein AotQ  33.47 
 
 
246 aa  141  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2582  histidine ABC transporter permease HisQ  36.11 
 
 
228 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.114361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2540  histidine ABC transporter permease protein HisQ  36.11 
 
 
228 aa  141  9e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.512507  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4291  amino acid ABC transporter permease  36.56 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1791  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.89 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.369418  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1828  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  34.63 
 
 
240 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.300709  normal  0.358336 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01551  ABC transporter permease protein  33.05 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1654  arginine transporter permease subunit ArtQ  37.29 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.571683 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68080  ABC transporter permease  39.27 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.382503  normal  0.0204508 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2857  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.11 
 
 
228 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.224945  normal  0.227891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0885  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.27 
 
 
229 aa  139  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.524811 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1054  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.67 
 
 
253 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712414  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5892  ABC transporter permease  39.27 
 
 
231 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.67 
 
 
229 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5359  amino acid ABC transporter, permease protein  43.64 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4913  amino acid ABC transporter permease  42.73 
 
 
231 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4287  ABC polar amino acid transporter, inner membrane subunit  35.43 
 
 
229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2567  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.72 
 
 
229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.386415  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2129  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.11 
 
 
260 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356557  normal  0.354244 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2560  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.56 
 
 
230 aa  138  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.645171  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0696  amino acid ABC transporter permease  34.67 
 
 
229 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1175  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.67 
 
 
229 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4835  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.19 
 
 
240 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.137601 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1153  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.67 
 
 
229 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4271  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  41.96 
 
 
231 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000112521 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2915  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.33 
 
 
229 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2927  ABC lysine/arginine/ornithine transporter, innermembrane subunit  35.56 
 
 
233 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.26673 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1429  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  34.07 
 
 
228 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0521843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1539  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.07 
 
 
228 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1377  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.67 
 
 
229 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0352  histidine transport system permease HisQ  34.07 
 
 
228 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.179299  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1089  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  35.27 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1094  histidine ABC transporter, permease protein HisQ  35.27 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>