124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2921 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2921  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  100 
 
 
188 aa  370  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.833545  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2829  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  96.28 
 
 
188 aa  359  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.707138  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2860  nicotinamide mononucleotide transporter  95.21 
 
 
188 aa  358  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2760  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  81.77 
 
 
192 aa  272  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2600  nicotinamide mononucleotide transporter  67.57 
 
 
187 aa  250  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23973  normal  0.321771 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3009  nicotinamide mononucleotide transporter  62.57 
 
 
187 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.229843  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2172  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  64.86 
 
 
189 aa  237  9e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0259968  hitchhiker  0.00534825 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3142  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC, putative  60.96 
 
 
187 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39200  putative transporter  60.96 
 
 
191 aa  228  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.308671  normal  0.183121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3339  putative transporter  63.64 
 
 
191 aa  216  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.572847  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5035  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  46.32 
 
 
203 aa  170  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2435  nicotinamide mononucleotide transporter  45.21 
 
 
210 aa  167  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.906428  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5421  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  44.21 
 
 
203 aa  167  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0179823  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4688  nicotinamide mononucleotide transporter  43.81 
 
 
214 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0881597  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3675  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  43.81 
 
 
214 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.859752  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3847  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  43.81 
 
 
214 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.975456 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3577  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  44.74 
 
 
203 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162448  normal  0.0889798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02689  PnuC protein  46.07 
 
 
191 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.719379  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0149  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  44.81 
 
 
189 aa  147  8e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0257  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  41.15 
 
 
197 aa  143  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0122  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  36.67 
 
 
204 aa  135  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.537648  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0751  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  34.43 
 
 
212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5815  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  34.98 
 
 
224 aa  111  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.813423  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3696  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  33.7 
 
 
209 aa  111  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1346  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.52 
 
 
215 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.418347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3448  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35.36 
 
 
208 aa  107  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32260  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  38.25 
 
 
220 aa  106  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.323942  normal  0.618471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5744  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.12 
 
 
209 aa  104  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000549247  normal  0.596683 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0513  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.45 
 
 
210 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0012  nicotinamide mononucleotide transporter  32.97 
 
 
187 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3131  nicotinamide mononucleotide transporter  35.68 
 
 
189 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0973  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30 
 
 
200 aa  100  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0700641  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1898  transporter, putative  30.34 
 
 
202 aa  100  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.324173 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3795  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.86 
 
 
244 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0544  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.86 
 
 
244 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0549  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.86 
 
 
244 aa  99.8  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0693  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.79 
 
 
222 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2319  nicotinamide mononucleotide transporter  30.57 
 
 
226 aa  96.3  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2568  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.79 
 
 
220 aa  95.9  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2713  transporter, putative  30.98 
 
 
221 aa  95.5  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2498  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.16 
 
 
221 aa  94.7  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375909 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2066  nicotinamide mononucleotide transporter  30.98 
 
 
197 aa  94.4  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1453  transporter, putative  30.85 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.894692  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2308  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.84 
 
 
221 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.389192  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1830  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.21 
 
 
220 aa  92.8  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.030494  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2378  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.1 
 
 
221 aa  92.4  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.35104  normal  0.833863 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1541  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.04 
 
 
188 aa  92  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.732675 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2175  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  35 
 
 
228 aa  91.7  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.993278  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1528  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.92 
 
 
236 aa  91.3  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.747465  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1662  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.9 
 
 
233 aa  89.4  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.152484  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1413  nicotinamide mononucleotide transporter  30.04 
 
 
252 aa  88.2  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.211581  normal  0.406253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1804  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.91 
 
 
217 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1796  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.91 
 
 
217 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00874639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1843  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.91 
 
 
217 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.144027  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2482  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.91 
 
 
217 aa  88.2  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.060877  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3407  response regulator receiver domain-containing protein  30.56 
 
 
208 aa  88.2  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0778209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4490  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  34.04 
 
 
214 aa  88.2  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0408441  normal  0.0360062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1585  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.09 
 
 
207 aa  87  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.651822  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0274  N-ribosylnicotinamide transporter  30.05 
 
 
205 aa  87  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1920  nicotinamide mononucleotide transporter family protein  30.05 
 
 
205 aa  87  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00740685  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0005  pnuC protein  27.96 
 
 
244 aa  85.9  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00212076  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1442  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  31.87 
 
 
201 aa  85.9  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.189058  normal  0.659941 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1888  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.9 
 
 
212 aa  85.5  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.796853 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1737  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.77 
 
 
215 aa  85.1  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2750  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  30.94 
 
 
213 aa  85.5  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.371674 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0065  putative nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  32.97 
 
 
217 aa  84.7  8e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2849  putative transporter  32.61 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.705156  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1283  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.5 
 
 
241 aa  84  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000492562  hitchhiker  0.00161907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0720  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.57 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.258508 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2595  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  59.02 
 
 
61 aa  82.8  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2864  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.79 
 
 
241 aa  82  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1404  intergral membrane NMN transport protein PnuC  26.79 
 
 
241 aa  82  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2952  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.79 
 
 
241 aa  82  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000727328  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000335  ribosyl nicotinamide transporter PnuC-like protein  30.58 
 
 
243 aa  81.6  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.258606  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06139  hypothetical protein  30.1 
 
 
245 aa  79  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2897  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  29.52 
 
 
241 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000827134  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0199  nucleoside transporter  24.86 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0186  nicotinamide mononucleotide transporter  24.86 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0189  nucleoside transporter  24.86 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0199  nucleoside transporter  24.86 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0218  nucleoside transporter, PnuC family  24.86 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1255  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.5 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0973983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1162  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  27.62 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.264602  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3081  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.5 
 
 
241 aa  74.3  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.368722  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1089  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  23.59 
 
 
223 aa  74.7  0.0000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0298367  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4138  intergral membrane NMN transport protein PnuC  28.5 
 
 
243 aa  74.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0241  nucleoside transporter, PnuC family  24.86 
 
 
216 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0219  nucleoside transporter  25.68 
 
 
216 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0307  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  28.02 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.007136 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4123  intergral membrane NMN transport protein PnuC  28.5 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0183  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  24.31 
 
 
216 aa  72  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01545  putative membrane transporter involved in nicotinamidemononucleotide transport  21.31 
 
 
210 aa  72  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1242  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.98 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00177208  normal  0.230051 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0387  putative nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.56 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0605919  n/a   
 
 
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NC_009012  Cthe_2777  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.7 
 
 
234 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0673  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.19 
 
 
234 aa  67  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000252701  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_02803  transporter, putative  30.56 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.860055  n/a   
 
 
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NC_011353  ECH74115_0854  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  26.19 
 
 
239 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00364593  normal 
 
 
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CP001637  EcDH1_2891  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.71 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135178  n/a   
 
 
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NC_010468  EcolC_2911  nicotinamide mononucleotide transporter PnuC  25.71 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.180433  normal  0.283606 
 
 
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