43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2009 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2009  inhibitor of MCP methylation-like protein  100 
 
 		 165 aa  336  7e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1904  inhibitor of MCP methylation-like protein  70.91 
 
 		 163 aa  257  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00098373  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0888  inhibitor of MCP methylation-like protein  69.28 
 
 		 166 aa  247  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0522691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3372  inhibitor of MCP methylation-like protein  68.67 
 
 		 166 aa  245  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2059  hypothetical protein  65.41 
 
 		 159 aa  222  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1206  inhibitor of MCP methylation, CheC-like  33.1 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.333742  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3283  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  31.25 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2921  hypothetical protein  40.66 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0650  inhibitor of MCP methylation, CheC-like protein  28.57 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.207901 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2135  putative chemotaxis protein CheX  25.78 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.234891  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0567  hypothetical protein  35.56 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00522543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4219  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  29.53 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0966  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.91 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0717  chemotaxis protein CheX, putative  27.15 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.908176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3133  chemotaxis protein CheX, putative  26.49 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0248  CheC-like protein  24.2 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0557914  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3420  hypothetical protein  29.33 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2318  hypothetical protein  30.77 
 
 		 161 aa  47  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0184  putative chemotaxis protein CheX  28.35 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000013186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1829  hypothetical protein  31.91 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3844  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.17 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3928  inhibitor of MCP methylation CheC-like protein  28.17 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.045223 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0436  hypothetical protein  34.52 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1768  inhibitor of MCP methylation-like protein  23.08 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0985649  hitchhiker  0.00193959 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3310  hypothetical protein  32.14 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0696  putative chemotaxis protein CheX  27.36 
 
 		 154 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000403522  hitchhiker  0.000308121 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0281  chemotaxis protein CheX, putative  29.14 
 
 		 155 aa  44.3  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.180055  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0739  CheC domain protein  23.91 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000054191  hitchhiker  0.000000000759122 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2875  CheC domain protein  27.34 
 
 		 171 aa  43.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0748  CheC domain-containing protein  23.91 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000188683  hitchhiker  0.000145879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0719  putative chemotaxis protein CheX  23.91 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000137536  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3275  CheC domain-containing protein  27.19 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000378704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3636  putative chemotaxis protein CheX  23.91 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000517443  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0715  putative chemotaxis protein CheX  26.42 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000857864  hitchhiker  0.000181388 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3246  putative chemotaxis protein CheX  26.42 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000130186  hitchhiker  0.00000986039 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3915  hypothetical protein  26.17 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00638  CheC-like protein  28.68 
 
 		 154 aa  42  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00187096  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0484  CheC domain-containing protein  26.27 
 
 		 155 aa  42  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3118  hypothetical protein  28.69 
 
 		 168 aa  42  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0132  hypothetical protein  32.94 
 
 		 168 aa  42  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3060  hypothetical protein  28.69 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00029683  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1817  chemotaxis protein CheX, putative  28.48 
 
 		 154 aa  40.8  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0404  hypothetical protein  35.8 
 
 		 168 aa  40.8  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.639025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>